R で並列処理

parallel パッケージ

  • R2.14.0 以降

CRAN Task View

パッケージ

  • snowFT: Fault Tolerant Simple Network of Workstations
  • doSNOW: Foreach parallel adaptor for the snow package
  • rpvm: PVM (並列仮想計算機)への R インタフェイス
  • Rsge: SGE 待ち行列システムインターフェース
  • GridR: リモートホスト、クラスターまたはグリッド上で関数を実行
  • mapReduce: mapReduce - 並列計算用の柔軟な mapReduce アルゴリズム mapReduce(並列計算用の柔軟な mapReduce アルゴリズム)パッケージ中のオブジェクト一覧?
  • taskPR: タスク並列 R パッケージ
  • ff: memory-efficient storage of large data on disk and fast access functions
  • RScaLAPACK: A seamless interface to perform parallel computation on linear algebra problems using the ScaLAPACK library
  • doMPI: Foreach parallel adaptor for the Rmpi package
  • parfossil: Parallelized functions for palaeoecological and palaeogeographical analysis
  • sprint: Simple Parallel R INTerface

マルチコア

  • multicore: Parallel processing of R code on machines with multiple cores or CPUs
    • doMC: Foreach parallel adaptor for the multicore package (linux, MacOSXのみ Windows不可)
    • doSMP: Foreach parallel adaptor for the revoIPC package (Windows, linux, MacOSX) Windowsユーザは有無を言わずこれを使う
  • raster

応用パッケージ

  • caretNWS: NetworkSpaces? を使って並列化した分類と回帰トレーニング
  • npRmpi: Nonparametric kernel smoothing methods for mixed data types
  • pensim: Simulation of high-dimensional data and parallelized repeated penalized regression

GGPU

  • gputools: PU 利用可能なデータマイニングのいくつかの関数群 gputools(GPU 利用可能なデータマイニングのいくつかの関数群)パッケージ中のオブジェクト一覧?
  • GPU computing for R statistical environment
  • cudaBayesreg: fMRI データ分析用マルチレベルモデルの CUDA 並列実装

事例・文献

リンク


コメント



*1 Windows XP, Linux, Mac OS X に対応

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Last-modified: 2015-03-01 (日) 01:15:59 (1727d)