vgam(ベクトル一般化線形・一般加法モデル)パッケージ中のオブジェクト一覧

モデル当てはめ関数

項目説明
vglmベクトル一般化線形モデル
vgamベクトル一般加法モデル
rrvglm縮小ランクVGLMs および 二次RR-VGLM
vsmooth.splineベクトル平滑化スプライン
vlmベクトル線形モデル
grcGoodman's RC assocation model
cgoCanonical Gaussian ordination

メソッド関数

項目説明
coef.vlm係数抽出関数
fitted.vglmvglm オブジェクトのあてはめ値
plot.vgamvgam オブジェクトのプロット
predict.vglmvglm オブジェクトの予測
predict.vgamvgam オブジェクトの予測
resid.vglmvglm オブジェクトの残差
residuals.vglmvglm オブジェクトの残差
summary.vgamvgam オブジェクトの要約
summary.vglmvglm オブジェクトの要約
summary.vlmvlm オブジェクトの要約

Generic 関数

項目説明
qtplotQuantile plots (e.g., for quantile regression)
deplot密度プロット(e.g., for quantile regression)
cdf累積分布関数 (ditto)
lvplot潜在変量プロット (RR-VGLMs用)
biplotバイプロット(RR-VGLMs)
devianceExtractor function
loglikExtractor function
vcovExtractor function

SMARTPRED The SMARTPRED library for smart prediction

ファミリー関数(FAMILY FUNCTIONS) Many of them! Here is a list of them.

二項(Binomial)

項目説明
betabinbeta-binomial (doesn't work)
binom2.or二変量対数モデル
binom2.rho二変量プロビットモデル

カテゴリカル

項目説明
sratioStopping ratio model
cratioContinuation ratio model
multinomial多項ロジットモデル
cumulativeNon-proportional odds model
acat隣接カテゴリーモデル(Adjacent categories model)

極値データ(Extreme Value Data)

項目説明
gev一般化極値分布
gpd一般化パレート分布
egev一般化極値分布
ogev一般化極値分布
gumbel.blockGumbel distribution

Genetic Data

項目説明
G1G2G3G1/G2/G3 表現型
AAaa.nohwAA-Aa-aa 表現型(no Hardy-Weinberg assumption)
AB.Ab.aB.ab2AB-Ab-aB-ab2 表現型
A1A2A3A1A2A3 対立遺伝子システム(Allele System)
MNSsMNSs Blood Group System
ABOABO Blood Group System
AB.Ab.aB.abAB-Ab-aB-ab 表現型
AA.Aa.aaAA-Aa-aa 表現型

一般化線形モデル

項目説明
gaussianffガウス
quasiff疑似尤度
binomialff二項
poissonffポアソン(allows matrix response)
quasibinomialff二項
quasipoissonffポアソン(allows matrix response)
gammaffガンマ
inverse.gaussianff逆ガウス
inv.gaussianff逆ガウス (パラメータは2つとも、最尤度で推定される)

対数線形モデル

項目説明
loglinb2Bivariate binomial responses
loglinb3Trivariate binomial responses

非線形回帰

項目説明
micmenMichaelis-Menton
skiraShinozaki and Kira
exp.reg指数回帰
asyregOAsymptotic Regression through the origin
autocataロジスティック(自己触媒) モデル
bnelderBleasdale & Nelder モデル(fixed theta3 & theta4)
bsimpBleasdaleの簡略モデル
cwitmerCook and Witmer モデル
fharrisFarazaghi and Harris モデル
gompゴンペルツ・モデル
hollidayHolliday Model
logi一般化ロジスティック
makehamMakehham second modification (without 2nd parameter)
mmfMorgan-Mercer-Flodin(MMF) Family
monomoMonomolecular Function
nelder61Nelder (1961) モデル
weibull.nlワイブル・モデル

正の分布(Positive Distributions)

項目説明
positive.poissonPositive Poisson
positive.binomialPositive binomial

区分回帰(Quantile Regression) (LMS method)

項目説明
lms.bcnBox-Cox transformation to normality
lms.bcgBox-Cox transformation to a gamma distribution
lms.yjnYeo-Johnson transformation to normality
qtplotMethods function
cdfMethods function
deplotMethods function

量子データ(Quantal data) (not working)

項目説明
abbottAbbott's model for binary response
expected.abbottAbbott's model for binary response

見かけ上無関係な回帰(not working)

項目説明
Sur古典的モデル

縮小ランク時系列モデル(Reduced-rank Time Series Model)

項目説明
rrarNested vector AR(p)
garmaGARMA(p, q)

単変量分布

項目説明
hzetaHaight's Zeta distribution
dirmulDirichlet-Multinomial distribution
dirichletDirichlet 分布
zetaffZeta distribution
cauchy11パラメータコーシー分布(One parameter Cauchy distribution)
logistic1One parameter logistic distribution
erlangErlang distribution
borel.tannerBorel-Tanner 分布
skewnorm11-parameter Skew-normal distribution
beta22-parameter Beta distribution
beta44-parameter Beta distribution (unstable)
simple.exponentialシンプルな指数分布
exponential指数分布
gamma11パラメータ・ガンマ分布
gamma22パラメータ・ガンマ分布
geometric幾何
levyLevy 分布
lgammaff対数ガンマ
logff対数分布(Logarithmic distribution)
normal1単変量正規分布
negbin.mn負の二項分布
negbin.mu負の二項分布(平均は1パラメータ)
neg.binomial負の二項分布
neg.binomial.k負の二項分布
simple.poissonポアソン
gumbelGumbel (doesn't work)
studenttスチューデントT分布
chisqカイ二乗分布
simplex単変量シンプレックス分布(Univariate Simplex distribution)
rigReciprocal Inverse Gaussian distribution
hyper.secantHyperbolic Secant distribution
hyper.secant.1Hyperbolic Secant distribution
leipnikLeipnik 分布
invbinomial逆二項分布(Inverse binomial distribution)
genpoisson一般化ポアソン分布

ゼロ確率?膨張分布(Zero-Inflated Distributions)

Generic Functions:

項目説明
yip88ゼロ確率?膨張ポアソン(Zero-inflated Poisson) (based on Yip (1988))

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Last-modified: 2015-03-01 (日) 01:15:59 (1719d)