nlme(線形および非線形混合効果モデル)パッケージ中のオブジェクト一覧

項目説明
ACF自己相関
ACF.glsgls 残差の自己相関関数
ACF.lmelme 残差の自己相関関数
Alfalfaアルファルファの多様性実験の分割プロット
Assay細胞培養プレートの生物学的検定(法)(Bioassay on Cell Culture Plate)
BICベイズ情報規準量(Bayesian Information Criterion)
BIC.logLiklogLik オブジェクトのBIC
BodyWeight長期間異なった食事制限をしたラットの体重
CefamandolePharmacokinetics of Cefamandole
Coef値を係数に代入
Covariate共変量値代入
Covariate.varFuncvarFunc 共変量代入
DialyzerHigh-Flux 血液透析器
Dimオブジェクトより、大きさ(Dimensions) を抽出
Dim.corSpatialcorSpatial オブジェクトの大きさ
Dim.corStructcorStruct オブジェクトの大きさ
Dim.pdMatpdMat オブジェクトの大きさ
Earthquake地震強度
[.pdMatSubscript a pdMat Object
Fatigue金属疲労による亀裂
Gasolineガソリン生成生産量(Refinery yield of gasoline)
Glucose時系列のグルコース・レベル
Glucose2アルコール摂取後のグルコース・レベル(Glucose Levels Following Alcohol Ingestion)
Gun海軍の銃の発射方法
IGFIGF-Iのたんぱく質の放射免疫測定(Radioimmunoassay of IGF-I Protein)
Initializeオブジェクトの初期化
Initialize.corStructcorStruct オブジェクトの初期化
Initialize.glsStructglsStruct オブジェクトの初期化
Initialize.lmeStructlmeStruct オブジェクトの初期化
Initialize.reStructreStruct オブジェクトの初期化
Initialize.varFuncvarFunc オブジェクトの初期化
LDEsysMatLDEのシステム・マトリックスを生成
Machines機械と労働者の生産性スコア(Productivity Scores for Machines and Workers)
MathAchSchoolSchool demographic data for MathAchieve
MathAchieve数学習得得点(Mathematics achievement scores)
MatrixMatrix 値の代入
Matrix.pdMatオブジェクトにマトリックスを代入
Matrix.reStructreStruct マトリックスの代入
Meat肉の柔らかさ(Tenderness of meat)
Milk牛乳のたんぱく質分
MuscleContraction of heart muscle sections
NamesNames Associated with an Object
Names.formulaExtract Names from a formula
Names.pdBlockedNames of a pdBlocked Object
Names.pdMatNames of a pdMat Object
Names.reStructNames of an reStruct Object
NitrendipeneAssay of nitrendipene
OatsSplit-plot Experiment on Varieties of Oats
OrthodontGrowth curve data on an orthdontic measurement
OvaryCounts of Ovarian Follicles
OxboysOxfordの少年の身長
OxideVariability in Semiconductor Manufacturing
PBGEffect of Phenylbiguanide on Blood Pressure
PhenobarbPhenobarbitol Kinetics
PixelX-ray pixel intensities over time
QuinidineQuinidine Kinetics
RailEvaluation of Stress in Railway Rails
RatPupWeightThe weight of rat pups
RelaxinAssay for Relaxin
RemifentanilPharmacokinetics of remifentanil
Soybean大豆植物(soybean plants)の成長
SpruceGrowth of Spruce Trees
Tetracycline1Pharmacokinetics of tetracycline
Tetracycline2Pharmacokinetics of tetracycline
VarCorr相関成分の分散の抽出
Variogramセミバリオグラム計算
Variogram.corExpCalccorExp オブジェクトのセミバリオグラムの計算
Variogram.corGauscorGaus オブジェクトのセミバリオグラムの計算
Variogram.corLincorLin オブジェクトのセミバリオグラムの計算
Variogram.corRatiocorRatio オブジェクトのセミバリオグラムの計算
Variogram.corSpatialcorSpatial オブジェクトのセミバリオグラムの計算
Variogram.corSphercorSpher オブジェクトのセミバリオグラムの計算
Variogram.defaultセミバリオグラムの計算
Variogram.glsgls オブジェクトより残差のセミバリオグラムの計算
Variogram.lmelme オブジェクトより残差のセミバリオグラムの計算
WaferModeling of Analog MOS Circuits
WheatYields by growing conditions
Wheat2Wheat Yield Trials
allCoefExtract Coefficients from a Set of Objects
anova.glsCompare Likelihoods of Fitted Objects
anova.lmeCompare Likelihoods of Fitted Objects
as.matrix.corStructMatrix of a corStruct Object
as.matrix.pdMatMatrix of a pdMat Object
as.matrix.reStructMatrices of an reStruct Object
asOneFormulaCombine Formulas of a Set of Objects
asTableConvert groupedData to a matrix
augPredAugmented Predictions
balancedGroupedCreate a groupedData object from a matrix
bdfLanguage scores
coef.corStructCoefficients of a corStruct Object
coef.gnlsExtract gnls Coefficients
coef.lmListExtract lmList Coefficients
coef.lmeExtract lme Coefficients
coef.modelStructExtract modelStruct Object Coefficients
coef.pdMatpdMat Object Coefficients
coef.reStructreStruct Object Coefficients
coef.varFuncvarFunc Object Coefficients
collapseCollapse According to Groups
collapse.groupedDataCollapse a groupedData Object
compareFitsCompare Fitted Objects
comparePred予測値の比較
contr.SASContrast Matrices
corAR1AR(1) 相関構造
corARMAARMA(p,q) 相関構造
corCAR1連続的AR(1) 相関構造
corClasses相関構造クラス
corCompSymm複合対称相関構造
corExp指数相関構造
corFactor相関行列のファクター
corFactor.corStructcorStruct オブジェクト・マトリックスのファクター
corGausガウス相関構造
corLin線形相関構造
corMatrix相関マトリックスの抽出
corMatrix.corStructcorStruct オブジェクト・マトリックス
corMatrix.pdMatExtract Correlation Matrix from a pdMat Object
corMatrix.reStructExtract Correlation Matrix from Components of an reStruct Object
corNaturalGeneral correlation in natural parameterization
corRatioRational Quadratic Correlation Structure
corSpatial空間相関構造
corSpherSpherical Correlation Structure
corSymmGeneral Correlation Structure
ergoStoolErgometrics experiment with stool types
fdHessFinite difference Hessian
fitted.glsStructCalculate glsStruct Fitted Values
fitted.gnlsStructCalculate gnlsStruct Fitted Values
fitted.lmListExtract lmList Fitted Values
fitted.lmeExtract lme Fitted Values
fitted.lmeStructCalculate lmeStruct Fitted Values
fitted.nlmeStructCalculate nlmeStruct Fitted Values
fixed.effectsExtract Fixed Effects
fixef.lmListExtract lmList Fixed Effects
formula.pdBlockedExtract pdBlocked Formula
formula.pdMatExtract pdMat Formula
formula.reStructExtract reStruct Object Formula
gapplyApply a Function by Groups
getCovariateExtract Covariate from an Object
getCovariate.corStructExtract corStruct Object Covariate
getCovariate.data.frameExtract Data Frame Covariate
getCovariate.varFuncExtract varFunc Covariate
getCovariateFormulaExtract Covariates Formula
getDataExtract Data from an Object
getData.glsExtract gls Object Data
getData.lmListExtract lmList Object Data
getData.lmeExtract lme Object Data
getGroupsExtract Grouping Factors from an Object
getGroups.corStructExtract corStruct Groups
getGroups.data.frameExtract Groups from a Data Frame
getGroups.glsExtract gls Object Groups
getGroups.lmListExtract lmList Object Groups
getGroups.lmeExtract lme Object Groups
getGroups.varFuncExtract varFunc Groups
getGroupsFormulaExtract Grouping Formula
getResponseExtract Response Variable from an Object
getResponseFormulaExtract Formula Specifying Response Variable
getVarCovExtract variance-covariance matrix
glsFit Linear Model Using Generalized Least Squares
glsControlControl Values for gls Fit
glsObjectFitted gls Object
glsStruct一般化最小二乗構造
gnlsFit Nonlinear Model Using Generalized Least Squares
gnlsControlControl Values for gnls Fit
gnlsObjectFitted gnls Object
gnlsStructGeneralized Nonlinear Least Squares Structure
groupedDataConstruct a groupedData Object
gsummarySummarize by Groups
intervalsConfidence Intervals on Coefficients
intervals.glsConfidence Intervals on gls Parameters
intervals.lmListConfidence Intervals on lmList Coefficients
intervals.lmeConfidence Intervals on lme Parameters
isBalancedCheck a Design for Balance
isInitializedCheck if Object is Initialized
lmListList of lm Objects with a Common Model
lmList.groupedDatalmList Fit from a groupedData Object
lmeLinear Mixed-Effects Models
lme.groupedDataLME fit from groupedData Object
lme.lmListLME fit from lmList Object
lmeControlControl Values for lme Fit
lmeObjectFitted lme Object
lmeScaleScale for lme Optimization
lmeStructLinear Mixed-Effects Structure
logDetExtract the Logarithm of the Determinant
logDet.corStructExtract corStruct Log-Determinant
logDet.pdMatExtract Log-Determinant from a pdMat Object
logDet.reStructExtract reStruct Log-Determinants
logLik.corStructExtract corStruct Log-Likelihood
logLik.glsStructLog-Likelihood of a glsStruct Object
logLik.gnlsLog-Likelihood of a gnls Object
logLik.gnlsStructLog-Likelihood of a gnlsStruct Object
logLik.lmListLog-Likelihood of an lmList Object
logLik.lmeLog-Likelihood of an lme Object
logLik.lmeStructLog-Likelihood of an lmeStruct Object
logLik.reStructCalculate reStruct Log-Likelihood
logLik.varFuncExtract varFunc logLik
model.matrix.reStructreStruct Model Matrix
needUpdateCheck if Update is Needed
needUpdate.modelStructCheck if a modelStruct Object Needs Updating
nlmeNonlinear Mixed-Effects Models
nlme.nlsListNLME fit from nlsList Object
nlmeControlControl Values for nlme Fit
nlmeObjectFitted nlme Object
nlmeStructNonlinear Mixed-Effects Structure
nlsListList of nls Objects with a Common Model
nlsList.selfStartnlsList Fit from a selfStart Function
pairs.compareFitsPairs Plot of compareFits Object
pairs.lmListPairs Plot of an lmList Object
pairs.lmePairs Plot of an lme Object
pdBlockedPositive-Definite Block Diagonal Matrix
pdClassesPositive-Definite Matrix Classes
pdCompSymmPositive-Definite Matrix with Compound Symmetry Structure
pdConstructpdMat オブジェクトの構築
pdConstruct.pdBlockedConstruct pdBlocked Objects
pdDiagDiagonal Positive-Definite Matrix
pdFactorSquare-Root Factor of a Positive-Definite Matrix
pdFactor.reStructExtract Square-Root Factor from Components of an reStruct Object
pdIdentMultiple of the Identity Positive-Definite Matrix
pdLogCholGeneral Positive-Definite Matrix
pdMatPositive-Definite Matrix
pdMatrixExtract Matrix or Square-Root Factor from a pdMat Object
pdMatrix.reStructExtract Matrix or Square-Root Factor from Components of an reStruct Object
pdNaturalGeneral Positive-Definite Matrix in Natural Parametrization
pdSymmGeneral Positive-Definite Matrix
phenoModelModel function for the Phenobarb data
plot.ACFACF オブジェクトのプロット
plot.Variogramバリオグラム・オブジェクトのプロット
plot.augPredaugPred オブジェクトのプロット
plot.compareFitscompareFits オブジェクトのプロット
plot.glsgls オブジェクトのプロット
plot.intervals.lmListlmList 信頼区間のプロット
plot.lmListlmList オブジェクトのプロット
plot.lmelme または nls オブジェクトのプロット
plot.nffGroupedDatanffGroupedData オブジェクトのプロット
plot.nfnGroupedDatanfnGroupedData オブジェクトのプロット
plot.nmGroupedDatanmGroupedData オブジェクトのプロット
plot.ranef.lmListranef.lmList オブジェクトのプロット
plot.ranef.lmeranef.lme オブジェクトのプロット
pooledSD合併標準偏差(Pooled Standard Deviation)の抽出
predict.glsgls オブジェクトの予測
predict.gnlsgnls オブジェクトの予測
predict.lmListlmList オブジェクトの予測
predict.lmelme オブジェクトの予測
predict.nlmenlme オブジェクトの予測
print.summary.pdMatsummary.pdMat オブジェクトのプリント
print.varFuncvarFunc オブジェクトのプリント
qqnorm.glsgls オブジェクトの残差の正規プロット(Normal Plot)
qqnorm.lmeNormal Plot of Residuals or Random Effects from an lme Object
quinModelModel function for the Quinidine data
random.effectsランダムの効果の抽出
ranef.lmListlmList ランダムの効果の抽出
ranef.lmelme ランダムの効果の抽出
reStructランダムの効果の構造
recalc線形モデルオブジェクトの再計算
recalc.corStructcorStruct オブジェクトの再計算
recalc.modelStructmodelStruct オブジェクトの再計算
recalc.reStructreStruct オブジェクトの再計算
recalc.varFuncvarFunc オブジェクトの再計算
residuals.glsgls 残差の抽出
residuals.glsStructglsStruct 残差の計算
residuals.gnlsStructgnlsStruct 残差の計算
residuals.lmListlmList 残差の抽出
residuals.lmelme 残差の抽出
residuals.lmeStructlmeStruct 残差の計算
residuals.nlmeStructnlmeStruct 残差の計算
simulate.lmelme モデルのシミュレート
solve.pdMatCalculate Inverse of a Positive-Definite Matrix
solve.reStructApply Solve to an reStruct Object
splitFormula式を分割する
summary.corStructcorStruct オブジェクトの要約
summary.glsgls オブジェクトの要約
summary.lmListlmList オブジェクトの要約
summary.lmelme オブジェクトの要約
summary.modelStructmodelStruct オブジェクトの要約
summary.nlsListnlsList オブジェクトの要約
summary.pdMatpdMat オブジェクトの要約
summary.varFuncvarFunc オブジェクトの要約
update.modelStructmodelStruct オブジェクトの更新
update.varFuncvarFunc オブジェクトの更新
varClasses分散関数クラス
varComb分散関数の組み合わせ
varConstPower定数+パワー分散関数
varExp指数分散関数
varFixed固定分散関数(Fixed Variance Function)
varFunc分散関数構造(Variance Function Structure)
varIdentConstant Variance Function
varPowerパワー分散関数(Power Variance Function)
varWeights分散関数のウェイトの抽出
varWeights.glsStructglsStruct オブジェクトの分散ウェイト
varWeights.lmeStructlmeStruct オブジェクトの分散ウェイト

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Last-modified: 2023-03-25 (土) 11:19:16