| 項目 | 説明 |
| [.mcmc | MCMC オブジェクトの部分の抽出または置き換え |
| as.matrix.mcmc | MCMC オブジェクトの変換 |
| as.ts.mcmc | mcmc オブジェクトを強制的に時系列にする |
| autocorr | マルコフ連鎖の自己相関関数 |
| autocorr.diag | マルコフ連鎖の自己相関関数 |
| autocorr.plot | マルコフ連鎖の自己相関プロット |
| batchSE | バッチ標準誤差 |
| bugs2jags | WinBUGS データファイルを JAGS データファイルに変換 |
| coda.options | codamenu ドライバのオプションセッテイング |
| codamenu | coda パッケージ用メインメニュードライバ |
| crosscorr | MCMC 出力のクロス相関 |
| crosscorr.plot | 相関マトリックスのイメージのプロット |
| cumuplot | 累積分位点プロット(Cumulative quantile plot) |
| densityplot.mcmc | mcmc オブジェクト用Trellis プロット |
| densplot | MCMC 出力より確率密度関数の推定 |
| effectiveSize | 平均を推定するために効果的なサンプルの大きさ |
| gelman.diag | Gelman および Rubin の収束診断 |
| gelman.plot | Gelman-Rubin-Brooks プロット |
| geweke.diag | Geweke の収束診断 |
| geweke.plot | Geweke-Brooks プロット |
| heidel.diag | Heidelberger and Welch 収束の診断 |
| HPDinterval | 最高事後密度区間(Highest Posterior Density) |
| line | シンプルな線形回帰の例 |
| mcmc | マルコフ連鎖モンテカルロオブジェクト |
| mcmc.list | マルコフ連鎖モンテカルロオブジェクトの複製 |
| mcmcUpgrade | 旧フォーマットの mcmc オブジェクトを更新 |
| mcpar | MCMC オブジェクトの Mcpar 属性 |
| multi.menu | メニューよりマルチプルオプションを選択 |
| nchain | MCMC オブジェクトの次元 |
| pcramer | Cramer-von Mises 分布 |
| plot.mcmc | mcmc オブジェクトのサマリプロット |
| raftery.diag | Raftery および Lewis の診断 |
| read.and.check | データを対話的に読み、データが条件を満たすのかをチェック |
| read.bugs.interactive | BUGS 出力ファイルの対話的に読み込み |
| read.coda | BUGS 出力ファイルの読み込み |
| read.openbugs | OpenBUGS によって生成された CODA 出力ファイルの読み込み |
| rejectionRate | Metropolis-Hastings 連鎖の排出率 |
| spectrum0 | 0 でのスペクトル密度の推定 |
| spectrum0.ar | 0 でのスペクトル密度の推定 |
| summary.mcmc | マルコフ連鎖モンテカルロ chains の要約統計 |
| thin | 間隔の間引き(Thinning interval) |
| time.mcmc | オブジェクトの時間属性 |
| traceplot | MCMC 出力のトレースプロット(Trace plot ) |
| varnames | MCMC オブジェクトの名前付き次元(Named dimensions ) |
| window.mcmc | mcmc オブジェクトの Time windows |
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