RとXML

RとXML

　Web の標準データ形式であるXMLについては、Rでも関連パッケージがサポートされつつあります。　ここでは、RとXML関連の情報を掲載してきます。

（工事中）

XML パッケージ†

　XML fileの入出力をsupportするパッケージ．非常に有用なパッケージと思われますが　インストール，運用とも情報が少ないようです．

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install†

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linux†

Vine linux 3.0,R-1.9.0-vl1にインストールしてみました．　 http://www.omegahat.org/RSXML/からXML_0.97-0.tar.gz をdownloadして

>R INSTALL -c ./XML_0.97-0.tar.gz

でインストール. すると，libxml, zlib関連で怒られるので,libxml2-devel-2.6.9-0vl1, zlib-devel-1.1.4-0vl3をapt-getすると無事インストールできた。riki 2004-09-22 (水) 17:34:36

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Windows†

http://www.omegahat.org/RSXML/からXML_0.97-0.zipをdownloadして，R上で Package>InstallPackagae(s) local zip files...でインストール riki 2004-09-22 (水) 17:33:05

上記だけで，インストールすると，libxml2.dll, iconv.dll,zlib1.dllがないと怒られます．ので，

ftp://ftp.zlatkovic.com/pub/libxml/

から，libxml2.dll, iconv.dll,zlib1.dllをdownloadして，PATHの通ったところにおく（例えば，C:\WINDOWS\system32)もしくは，PATHを設定すると動く． riki 2004-09-24 (金) 17:06:24

R Console のメニューバー「パッケージ」>「ダウンロードサイトの選択」で BioC extra を選択。引き続きメニューバー「パッケージ」>「パッケージのインストール」で XML を選択するとダウンロードできる 2008-12-18（木）14:10:34

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利用例†

RCurl と XML パッケージを使って NCBI の Eutils を利用する例はこちら

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G-XMLの読み込みと各種処理†

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参考†

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SVG†

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svg 関数†

2.14 より、Windows のバイナリでも Cairo をサポートすることで利用可能。`
- Using R to Produce Scalable Vector Graphics for the Web

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RSvgDevice パッケージ　・・・　プロット出力を SVG に変換。†

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日本語†

devSVG 関数ではサポートしていないが、出力後、エディター等で出力ファイルをUTF-8に変換すれば日本語表示可能．日本語パッチしていないＲでもＯＫ．

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使用例†

devSVG(file = "ファイル名", width = 幅（インチ）, height = 高さ（インチ）,bg = "背景色", fg = "前景色", onefile=TRUE, xmlHeader=XMLヘッダーの有無)
SVG出力設定
作図関連コマンド

dev.off() # SVG出力

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利用例*1 †

devSVG(file = "/temp/Rplots.svg", width = 10, height = 8,bg = "white", fg = "black", onefile=TRUE, xmlHeader=TRUE)
plot(1:11,(-5:5)^2, type='b', main="シンプルグラフプロット")
dev.off()