さすがに、Rでしか出来ない解析と言うのは少ないと思いますが、有名どころのパッケージではできなくて、Rでは出来る解析というのはいろいろあると思います。是非具体的にhogehogeという解析はhogeというパッケージでは出来ないが、Rではhogehogeというコマンドでできる等と具体的に列挙してもらえれば幸いです。