CRANについて

CRAN (Comprehensive R Archive Network)は、R本体や各種パッケージをダウンロードするためのWebサイトで、 全世界にミラーサイト*1が存在する。 日本にも、統計数理研究所ミラー( http://cran.ism.ac.jp/ )、 会津大学ミラー ( ftp://ftp.u-aizu.ac.jp/pub/lang/R/CRAN )、東京大学ミラー(http://ftp.ecc.u-tokyo.ac.jp/CRAN/ )、兵庫教育大学ミラー(http://essrc.hyogo-u.ac.jp/cran/ )が存在する。 適切なミラーを選べば利用者の側には高速で快適なダウンロードが、サーバ管理者の側には負荷の軽減が期待できる。

ミラーの使い方

CRANはWebブラウザを用いてR自体をダウンロードするためにも使われるが、より便利な使い方として、 Rから直接パッケージを自動インストール、自動アップデートするためにも使うことができる(install.packages(), update.packages() )。 しかし、以下のような設定をしないと、これらの関数ではCRANの本家サイト( http://cran.r-project.org )が使われてしまう。

初期設定であらかじめ設定しておく場合

install.packages()等でCRAN国内ミラーを使うためには、options()をあらかじめ使っておくのが簡単だろう。

 options(repos="http://cran.md.tsukuba.ac.jp")

この指定以後はCRANからのファイルのダウンロードには指定されたミラーサイトが使われるようになる。

しかし、options()の指定は通常、Rを終了すると保存されず、毎起動時に指定しなおす必要がある。 これは面倒なので、Rの初期化ファイル(.Rprofile)にoptionsの指定を書いてしまうのがよい。

LinuxやMacOS Xではホームディレクトリ、WindowsではRをインストールした先のディレクトリ(C:¥Program Files¥R¥rw1090 など)に 下記のような内容の.Rprofileという名前のファイルを置けば、毎起動時にこの内容が読み込まれてCRANオプションが適切に設定される。

 options(repos="http://cran.md.tsukuba.ac.jp")

Windows環境ではドットで始まるファイルが作成し辛いらしいが、 いったんドット抜きのRprofileという名前のファイルを作って書き込み、それをエクスプローラでリネームするのがよいらしい(未確認)。

もし、Webへのアクセスにプロキシを利用しなければならない場所では、この.Rprofileに以下のような内容を追記すればよい(The R Book p.50より)。

 Sys.putenv("http_proxy"="http://proxyhost:3128/")
  • Windows環境で「.Rprofile」という名前のファイルを作るときは、「メモ帳」でファイルの名前を""で囲んだ「".Rprofile"」、ファイルの種類を「すべてのファイル」にすればよい。 -- hashi? 2006-07-08 (土) 14:59:24
  • Windows環境のノートPCなどでインターネット環境(プロキシ)が異なる職場・自宅・外出先を持ち歩く場合は、Rのショートカットのプロパティを開き、リンク先の「"...Rgui.exe"」の末尾に「 --internet2」を追記して、「"...Rgui.exe" --internet2」とすれば、コントロールパネルのインターネットオプションで設定したプロキシ設定が自動的に使われる(The R Book p.50より)。 -- 2006-07-08 (土) 15:14:56
  • Winows では,ドットで始まるファイルが作成しづらい?
    R コンソールから,
    cat("options(repos=\"http://cran.md.tsukuba.ac.jp\")\n", file="foo/bar/.baz")
    などではいかが? -- 2006-07-10 (月) 19:08:44
  • R2.12.2にて.Sys.putenvは廃止予定と警告が出る模様.動かない事例があればSys.setenvを使用のこと. -- 2011-04-27 (水) 02:54:10

逐次設定する

いつも使っているミラーでエラーが出るとき、一時的にダウンロード先のミラーサイトを変更したいときがあるだろう。そのような場合は、reposオプションでミラーサイトを指定する。例えば、Task Viewで"Spatial"のパッケージセットをインストールする際に、東京大学のミラーサイトを指定するには下記のようにする。

> library(ctv)
> install.views("Spatial", repos="ftp://ftp.ecc.u-tokyo.ac.jp/CRAN/")
  • 選択リストからミラーサイトを選ぶコマンド例: -- kkd? 2012-11-03 (土) 20:29:39
    > chooseCRANmirror(graphics=FALSE)


*1 同じコンテンツをコピーして提供するサイトをミラーと呼ぶ。

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Last-modified: 2015-03-01 (日) 01:15:59 (846d)