グラフィックス参考実例集:三次元散布図 scatterplot3d

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アドオンパッケージのライブラリ scatterplot3d により実現できる三次元散布図の例。2ch で匿名子が絶賛。image, persp, contour (coplot も?) に続く三次元データのグラフィックス。たしかに三次元図は見栄えが良く、論文の飾りに好適だが、しばしばそれだけに留まるので注意がいるか。人間の視覚は二次元対象で最も鋭敏のようである。


例 1

scatterplot3d1 <- function() {
  library(scatterplot3d)
  z <- seq(-10, 10, 0.01)
  x <- cos(z)
  y <- sin(z)
  scatterplot3d(x, y, z, highlight.3d=TRUE, col.axis="blue",
                col.grid="lightblue", main="scatterplot3d - 1", pch=20)
  pp <- recordPlot()
  png("scatterplot3d1.png")
  replayPlot(pp)
  dev.off()
}
scatterplot3d1.png

例 2

scatterplot3d2 <- function() {
  library(scatterplot3d)
  temp <- seq(-pi, 0, length = 50)
  x <- c(rep(1, 50) %*% t(cos(temp)))
  y <- c(cos(temp) %*% t(sin(temp)))
  z <- c(sin(temp) %*% t(sin(temp)))
  scatterplot3d(x, y, z, highlight.3d=TRUE,
                col.axis="blue", col.grid="lightblue",
                main="scatterplot3d - 2", pch=20)
  pp <- recordPlot()
  png("scatterplot3d2.png")
  replayPlot(pp)
  dev.off()
}
scatterplot3d2.png

例 3

scatterplot3d3 <- function() {
  library(scatterplot3d)
  temp <- seq(-pi, 0, length = 50)
  x <- c(rep(1, 50) %*% t(cos(temp)))
  y <- c(cos(temp) %*% t(sin(temp)))
  z <- 10 * c(sin(temp) %*% t(sin(temp)))
  color <- rep("green", length(x))
  temp <- seq(-10, 10, 0.01)
  x <- c(x, cos(temp))
  y <- c(y, sin(temp))
  z <- c(z, temp)
  color <- c(color, rep("red", length(temp)))
  scatterplot3d(x, y, z, color, pch=20, zlim=c(-2, 10),
                main="scatterplot3d - 3")
  pp <- recordPlot()
  png("scatterplot3d3.png")
  replayPlot(pp)
  dev.off()
}
scatterplot3d3.png

例 4

scatterplot3d4 <- function() {
  library(scatterplot3d)
  my.mat <- matrix(runif(25), nrow=5)
  dimnames(my.mat) <- list(LETTERS[1:5], letters[11:15])
  s3d.dat <- data.frame(cols=as.vector(col(my.mat)),
                        rows=as.vector(row(my.mat)),
                        value=as.vector(my.mat))
  scatterplot3d(s3d.dat, type="h", lwd=5, pch=" ",
                x.ticklabs=colnames(my.mat), y.ticklabs=rownames(my.mat),
                color=grey(25:1/40), main="scatterplot3d - 4")
  pp <- recordPlot()
  png("scatterplot3d4.png")
  replayPlot(pp)
  dev.off()
}
scatterplot3d4.png

例 5

scatterplot3d5 <- function() {
  library(scatterplot3d)
  data(trees)
  s3d <- scatterplot3d(trees, type="h", highlight.3d=TRUE,
                       angle=55, scale.y=0.7, pch=16, main="scatterplot3d - 5")
  ## Now adding some points to the "scatterplot3d"
  s3d$points3d(seq(10,20,2), seq(85,60,-5), seq(60,10,-10),
               col="blue", type="h", pch=16)
  ## Now adding a regression plane to the "scatterplot3d"
  attach(trees)
  my.lm <- lm(Volume ~ Girth + Height)
  s3d$plane3d(my.lm)
  pp <- recordPlot()
  png("scatterplot3d5.png")
  replayPlot(pp)
  dev.off()
}
scatterplot3d5.png

例 6; by Martin Maechler

scatterplot3d6 <- function() {
  library(scatterplot3d)
  cubedraw <- function(res3d, min = 0, max = 255, cex = 2)
    {
      ## Purpose: Draw nice cube with corners
      cube01 <- rbind(c(0,0,1),0,c(1,0,0),c(1,1,0),1,c(0,1,1),c(0,0,1),
                      c(1,0,1),c(1,0,0),c(1,0,1),1,c(1,1,0),
                      c(0,1,0),c(0,1,1),  c(0,1,0),0)
      cub <- min + (max-min)* cube01
      res3d$points3d(cub[ 1:11,], cex = cex, type = 'b', lty = 1)
      res3d$points3d(cub[11:15,], cex = cex, type = 'b', lty = 3)
    }
  ## 6 a) The named colors in R, i.e. colors()
  cc <- colors()
  crgb <- t(col2rgb(cc))
  par(xpd = TRUE)
  rr <- scatterplot3d(crgb, color = cc, box = FALSE, angle = 24,
                      xlim = c(-50, 300), ylim = c(-50, 300), zlim = c(-50, 300))
  cubedraw(rr)
  ## 6 b) The rainbow colors from rainbow(201)
  rbc <- rainbow(201)
  Rrb <- t(col2rgb(rbc))
  rR <- scatterplot3d(Rrb, color = rbc, box = FALSE, angle = 24,
                      xlim = c(-50, 300), ylim = c(-50, 300), zlim = c(-50, 300))
  cubedraw(rR)
  rR$points3d(Rrb, col = rbc, pch = 16)
  pp <- recordPlot()
  png("scatterplot3d6.png")
  replayPlot(pp)
  dev.off()
}  
scatterplot3d6.png

添付ファイル: filescatterplot3d1.png 2591件 [詳細] filescatterplot3d2.png 2074件 [詳細] filescatterplot3d5.png 2412件 [詳細] filescatterplot3d3.png 1903件 [詳細] filescatterplot3d6.png 2056件 [詳細] filescatterplot3d4.png 2080件 [詳細]

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Last-modified: 2015-03-01 (日) 01:15:59 (1727d)