CRAN パッケージリスト--I
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[[H:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--II#x03913de]] [[I:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--II#c0b3d4d2]] [[J:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--II#bee56ca4]] [[K:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--II#w1ae3894]] [[L:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--II#pa851b1b]] [[M:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--III#k19f18df]] [[N:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--III#i42ceeb3]] 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**COLOR(red){acepack}: 回帰変数変換用の ace() とavas() [#o728fa2c] 回帰変数の変換法を選択する ACE 法と AVAS 法 **COLOR(red){adapt}: adapt -- 多次元数値積分 [#ecf6bbe9] 20次元関数までの適応的求積法 **COLOR(red){ade4}: 環境データの解析:環境科学における探索的・ユークリッド法 [#ia7a3a83] 多次元データ解析とグラフィカルな表示~ http://cran.md.tsukuba.ac.jp/web/packages/ade4/ade4.pdf **COLOR(red){ade4TkGUI}: ade4 Tcl/Tk グラフィカルユーザインターフェース [#wcf49018] //ade4 Tcl/Tk Graphical User Interface ade4 パッケージの数種の基本関数のための Tcl/Tk GUI //a Tcl/Tk GUI for some basic functions in the ade4 package **COLOR(red){adehabitat}: 動物の生息場所選択の解析 [#m30ae5b9] 動物の生息場所選択の解析のためのツール集。 [[adehabitat(動物の生息場所選択の解析)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){adegenet}: R adegenet パッケージ: 遺伝子マーカーの多変量解析のためのクラスおよびメソッド [#rf85dd3b] //The adegenet package for R: classes and methods for the multivariate analysis of genetic markers. 多変量フレームワーク内での遺伝子データ解析用クラスおよび関数 //Classes and functions for genetic data analysis within the multivariate framework. **COLOR(red){adimpro}: デジタル画像の適応型平滑化 [#y4afa20f] //Adaptive Smoothing of Digital Images 本パッケージは、 デジタル画像平滑化のためのPolzehl and Spokoiny (2006) によるデジタル画像の操作および伝播分離アプローチを操作するためのツールを実装している。 //This package implements tools for manipulationg digital images and the Propagation Separation approach by Polzehl and Spokoiny (2006) for smoothing digital images. **COLOR(red){ads}: 空間ポイントパターン分析 [#uf3b4f80] // Spatial point patterns analysis Ripley の K 関数から導出され1次および2次マルチスケール関数を単変量、多変量およびマークつき地図化データに対して矩形、円形および不定形ウィンドーで実行し、モンテカルロシミュレーションに基づいた統計的信頼性検定もおこなう。 //Perform first- and second-order multi-scale analyses derived from Ripley's K-function, for univariate, multivariate and marked mapped data in rectangular, circular or irregular shaped sampling windows, with test of statitical significance based on Monte Carlo simulations. [[ads(空間ポイントパターン分析)のバインディング)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){AER}: R を用いた応用計量経済学 [#m430f0a0] //Applied Econometrics with R Christian Kleiber and Achim Zeileis (2008) の書籍、Applied Econometrics with R, Springer-Verlag, New York、のための関数、データセット、例及び vignettes。 //Functions, data sets, examples and vignettes for the book Christian Kleiber and Achim Zeileis (2008), Applied Econometrics with R, Springer-Verlag, New York. **COLOR(red){agce}: 成長曲線実験の解析 [#y3b645f1] このパッケージは成長曲線実験解析用の幾つかの簡単な関数を含む。 **COLOR(red){agricolae}: 農業調査の統計手続き [#vc85ec0c] //Statistical Procedures for Agricultural Research 本パッケージの関数は International Potato Center Research (CIP)、統計および情報学のインストラクターおよび Universidad Nacional Agraria La Molina Peru の学生に、さらには "Bosques y Gestion de Recursos Forestales" (森林資源管理)の特別管理官(Specialized Master)に現在利用されている。本パッケージの機能には、農業と植物育種の野外実験に特別に適用される実験計画の統計分析が含まれている。野外実験計画:格子(Lattice)、 要素(factorial), RCBD(ランダム化完全ブロック実験計画:randomized complete block experimental design), CRD(完全にランダムな計画), ラテン方格, グレコ?(Greaco), BIB(バランス不完全ブロック:Balanced Incomplete Block), PBIB(部分バランス不完全ブロック:Partially Balanced Incomplete Block), Alpha design. 複数位置試験(multi-location trials)との比較: AMMI (biplot および triplot), 安定性(Stability). 処理間比較: LSD, Bonferroni, HSD, Waller, Kruskal, Friedman, Durbin, Van Der Waerden. リサンプリングとシミュレーション: resampling.model, simulation.model, 母子試験(Mother and baby trials)分析, 生態学: 多様性係数(Indices Biodiversity), パス解析, consensus cluster, 土壌の均一性(Uniformity Soil): Smith の係数. //These functions are currently utilized by the International Potato Center Research (CIP), the Statistics and Informatics Instructors and the Students of the Universidad Nacional Agraria La Molina Peru, and the Specialized Master in "Bosques y Gestion de Recursos Forestales" (Forest Resource Management). This package contains functionality for the statistical analysis of experimental designs applied specially for field experiments in agriculture and plant breeding. Planning of field experiments: Lattice, factorial, RCBD, CRD, Latin Square, Greaco, BIB, PBIB, Alpha design. Comparison of multi-location trials: AMMI (biplot and triplot), Stability. Comparison between treatments: LSD, Bonferroni, HSD, Waller, Kruskal, Friedman, Durbin, Van Der Waerden. Resampling and simulation: resampling.model, simulation.model, analysis Mother and baby trials, Ecology: Indices Biodiversity, path analysis, consensus cluster, Uniformity Soil: Index Smith's. **COLOR(red){AIGIS}: GIS データの空間内奏 [#w45d72d7] //Areal Interpolation for GIS data AIGIS は空間的に関連したデータを、このようなデータの欠けた対象のポリゴン上への内挿に利用できる。バージョン 1.0 のパッケージはカリフォルニア州の特定の合衆国のセンサスに対して便利な内挿を指向しているものの、提供するツールは GIS データソース及び対象ポリゴンのどんな組み合わせに対しても、適切な配慮がなされているならば、動作するはずである。将来のバージョンではより一般的なアプリケーションに役立つことを目的としていく。 //AIGIS can be used to interpolate spatially associated data onto arbitrary target polygons which lack such data. Version 1.0 of the package is oriented toward convenient interpolation of specific US census data for California, but the tools provided should work for any combination of GIS data source and target polygon, provided appropriate care is taken. Future versions will be aimed at facilitating more general applications. **COLOR(red){AIS}: データを見るツール [#ie51c304] //Tools to look at the data ("Ad Inidicia Spectata") 本パッケージはデータを検査するツールである //This provides tools to inspect data **COLOR(red){akima}: 不規則配置データの補間 [#b610e68b] 不規則配置データの線形・3次スプライン補間 [[akima(不規則間隔データの補間)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){amap}: 今一つの多次元解析用パッケージ [#l85e7088] 階層的クラスタリングと主成分分析(一般的手法と頑健手法) **COLOR(red){AMORE}: よりフレキシブルなニューラルネットワークのパッケージ [#j8f2ef6b] **COLOR(red){AnalyzeFMRI}: ANALYZE 書式の fMRI データの解析用関数 [#u296f4e7] ANALYSE 書式で保管された機能的核磁気共鳴画像(fMRI)に対する I/O、可視化、解析用関数 **COLOR(red){animation}: 統計学のデモンステレーションアニメーション [#hf579d0f] //Demonstrate Animations in Statistics 本パッケージは確率論、数理統計学、多変量統計、ノンパラトリック統計、標本調査、線形モデル、時系列、計算統計学、データマイニングおよび機械学習のような多くの分野をカバーし統計学のアニメーション用の様々な関数からなる。これらの関数は統計学およびデータ分析の教育に役立つものである。 //This package consists of various functions for animations in statistics, covering many areas such as probability theory, mathematical statistics, multivariate statistics, nonparamatric statstics, sampling survey, linear models, time series, computational statistics, data mining and machine learning. These functions might be of help in teaching statistics and data analysis. [[animation(統計学のデモンステレーションアニメーション)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){anm}: downscaling に対するアナログモデル [#h0c50ab9] このパッケージは統計・経験的 downscaling に対するアナログモデルを含む **COLOR(red){ant}: R に特化した ant のバージョン [#ra571d07] //Version of ant specific to R 2,3の R のタスクを R パッケージ内で ant の利用を容易にする ant apache ビルドツールのバージョン //Version of the ant apache build tool, with a few R specific tasks to ease use of ant within an R package **COLOR(red){ape}: 系統と進化学の解析 [#j6328412] **COLOR(red){apsrtable}: 社会科学のための apsrtable モデル出力フォーマッタ [#p149064f] //apsrtable model-output formatter for social science 標準誤差を持つ並べた複数のオブジェクトより、latex のテーブルをフォーマットする。 American Political Science Review のような雑誌の表とは異なるものである。 //Formats latex tables from one or more model objects side-by-side with standard errors below, not unlike tables found in such journals as the American Political Science Review. **COLOR(red){apTreeshape}: 系統樹の形の解析 [#m73e16f7] 統計的指標を用いて系統樹のトポロジーのシミュレートと解析を行う。ape パッケージの姉妹ライブラリ。 **COLOR(red){aqp}: 計量土壌学のためのアルゴリズム [#u788aaf2] //Algorithms for Quantitative Pedology 土壌断面データの処理作業及び作図のための R パッケージ //R package for working with and plotting soil profile data. **COLOR(red){argosfilter}: Argos 位置フィルタ [#lc114ff0] //Argos locations filter Argos 衛星より入手した動物衛星追跡データをフィルタリングする関数。海洋生物の遠隔測定法研究用に特に使用されるが、Argos 衛星の位置は大部分が低精度である。 //Functions to filters animal satellite tracking data obtained from Argos. It is especially indicated for telemetry studies of marine animals, where Argos locations are predominantly of low-quality. [[argosfilter(Argos 位置フィルタ)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){arm}: 回帰式およびマルチレベル/階層型モデルを使ったデータ解析 [#i43e6ebd] //Data Analysis Using Regression and Multilevel/Hierarchical Models lm, glm, mer および polr 出力処理用 R 関数 //R functions for processing lm, glm, mer and polr outputs. **COLOR(red){arrayMissPattern}: マイクロアレイデータの欠損パターンの探索的分析 [#u0466451] //Exploratory analysis of Missing patterns for microarray data 本パッケージはマイクロアレイデータの欠損パターンの探索用にデザインされている //This package is designed to explore missing pattern for microarray data **COLOR(red){arules}: 相関ルールおよび頻出アイテムのマイニング [#v7edac88] //Mining Association Rules and Frequent Itemsets トランザクションデータおよびパターン(頻出アイテムおよび相関ルール)の表現、操作、解析用基盤の提供。また C. Borgelt による Apriori and Eclat 相関マイニングアルゴリズム Apriori および Eclat の C 言語実装へのインタフェースも提供。 //Provides the infrastructure for representing, manipulating and analyzing transaction data and patterns (frequent itemsets and association rules). Also provides interfaces to C implementations of the association mining algorithms Apriori and Eclat by C. Borgelt. **COLOR(red){arulesSequences}: 頻出配列のマイニング [#p1f6a04c] //Mining frequent sequences 頻出シークエンスの操作およびマイニングする相関規則のためのアドオン。 Mohammed J. Zaki による cSPADE の C++ 実装用インターフェースを提供する。 //Add-on for arules to handle and mine frequent sequences. Provides interfaces to the C++ implementation of cSPADE by Mohammed J. Zaki. **COLOR(red){ash}: David Scott の ASH ルーチン [#l3249348] David Scotts の ASH ルーチン **COLOR(red){aspace}: セントログラフィ統計量を推定する関数コレクション [#v56c8813] //A collection of functions for estimating centrographic statistcs セントログラフィ統計量(例、標準距離、標準偏差楕円)の計算、ポイントの位置で取った観測点の最小凸包ポリゴン(MCP)の計算関数コレクション。ツールもセントログラフィ統計に関連する図形オブジェクトおよびMCPの ESRI シェープファイルへの変換が提供される。 //A collection of functions for computing centrographic satistics (e.g., standard distance, standard deviation ellipse), and minimum convex polygons (MCP)for observations taken at point locations. A tool is also provided for converting geometric objects associated with the centrographic statistics, and MCPs into ESRI Shapefiles. [[aspace(セントログラフィ統計量を推定する関数コレクション) パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){aster}: Aster モデル [#b528715e] **COLOR(red){asypow}: 指数を利用した漸近尤度比手法の計算 [#z5feeda2] //Calculate Power Utilizing Asymptotic Likelihood Ratio Methods 漸近尤度比手法を利用した指数および関連する量を計算する S 言語で書かれたルーチンのセット //A set of routines written in the S language that calculate power and related quantities utilizing asymptotic likelihood ratio methods. **COLOR(red){asympTest}: 漸近的統計 [#l629814d] //Asymptotic statistic 漸近的統計検定 //Asymptotic testing **COLOR(red){aylmer}: フィッシャーの正確テストの生成 [#jddbf493] //A generalization of Fisher's exact test 構造的な0(structural zero)を考慮に入れたフィッシャーの正確テストの一般化 //A generalization of Fisher's exact test that allows for structural zeros. **COLOR(red){aws}: 適応的重み平滑化 [#y20226b0] *B [#i67ed2ea] **COLOR(red){backtest}: 金融商品についてのポートフォリオベースの推測の探索 [#i91d00ff] //Exploring portfolio-based conjectures about financial instruments backtest パッケージは、金融商品(株、公債、交換、オプション等)ポートフォリオベースの推測をエクスポートする機能を提供する //The backtest package provides facilities for exploring portfolio-based conjectures about financial instruments (stocks, bonds, swaps, options, et cetera). **COLOR(red){BaM}: Jeff Gill の著書のための関数およびデータセット [#wd2ae375] //Functions and datasets for books by Jeff Gill 著書名は"Bayesian Methods: A Social and Behavioral Sciences Approach, Second Edition published by CRC Press, 2007" (ベイズ手法:社会行動科学アプローチ)。 //Books is "Bayesian Methods: A Social and Behavioral Sciences Approach, Second Edition published by CRC Press, 2007" **COLOR(red){BARD}: よりよい自動化再配分 [#se695bcb] //Better Automated ReDistricting 本パッケージは、自動化再配分および再配分をする人の選好のヒューリステックな探査のためのものである。 //This is a package for automated redistricting and heuristic exploration of redistricter revealed preference **COLOR(red){bark}: ベイズ加法回帰カーネル [#ed78877d] //Bayesian Additive Regresssion Kernels BARK: フィーチャ選択付きのベイズ加法回帰カーネル( Zhi Ouyang (2008), Ph.D. 論文, 3 章 )の実装 //Impelementation of BARK: Bayesian Additive Regression Kernels with Feature Selection, Zhi Ouyang (2008), Ph.D. thesis, chapter 3. **COLOR(red){bayesGARCH}: Student's t Innovations を用いる GARCH(1,1) Model のベイズ推定 [#l59968cc] //Bayesian Estimation of the GARCH(1,1) Model with Student's t Innovations 本パッケージは, Student's t Innovations を用いる GARCH(1,1) Model のベイズ推定を実行する bayesGARCH 関数を提供する。 //This package provides the bayesGARCH function which performs the Bayesian estimation of the GARCH(1,1) model with Student's t innovations. **COLOR(red){BayesTree}: 木に基づくモデルのベイズ手法 [#m97967ca] //Bayesian Methods for Tree Based Models Chipman, George, McCulloch (2009) の BART:ベイズ加法回帰木の実装 //Implementation of BART:Bayesian Additive Regression Trees, Chipman, George, McCulloch (2009) **COLOR(red){BAYSTAR}: 閾値の自己回帰のベイズ分析(BAYSTAR)について [#qbe9811d] //On Bayesian analysis of Threshold autoregressive model (BAYSTAR) BAYSTAR パッケージの紹介原稿。本パッケージは、自己回帰閾値モデルのベイズ推定機能を提供する。 //The manuscript introduces the BAYSTAR package, which provides the functionality for Bayesian estimation in autoregressive threshold models. **COLOR(red){BB}: 大規模非線形システムの解法と最適化 [#s37aafd3] //Solving and optimizing large-scale nonlinear systems 非線形連立方程式の解法と単純な制約による非線形目的関数の最適化のための Barzilai-Borwein スペクトル法 //Barzilai-Borwein Spectral Methods for solving nonlinear system of equations, and for optimizing nonlinear objective functions subject to simple constraints. **COLOR(red){bbmle}: 一般最尤推定ツール [#y8c569d4] //Tools for general maximum likelihood estimation R で最尤モデルのあてはめのためのメソッドおよび関数。本パッケージは stats4 パッケージの mle クラスを修正・拡張したものである。 //Methods and functions for fitting maximum likelihood models in R. This package modifies and extends the mle classes in the stats4 package. **COLOR(red){bcp}: ベイジアン変化点 [#f8fc55e0] //Bayesian Change Point Barry and Hartigan (1993) のマルコフ連鎖モンテカルロ(MCMC)を使った標準変化点問題についての積分割モデルの実装。 //An implementation of the Barry and Hartigan (1993) product partition model for the standard change point problem using Markov Chain Monte Carlo. [[bcp(ベイジアン変化点)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){Bhat}: 一般的な尤度解析 [#tc60a68a] MLE, MCMC, CIs に対する関数(オリジナルは Fortran コード) **COLOR(red){BHH2}: Box, Hunter 及び Hunter II のための有用な関数 [#f3f5e619] //Useful Functions for Box, Hunter and Hunter II Box, Hunter 及び Hunter II でのいくつかの例を再生する関数及びデータセット //Functions and data sets reproducing some examples in Box, Hunter and Hunter II **COLOR(red){biglm}:有限メモリー(bounded memory)線形および一般化線形モデル [#jede146d] 大きすぎてメモリーに合わないデータの回帰 **COLOR(red){bigmemory}: 共有メモリーの UNIX サポート付きで、C++利用の巨大マトリックスを管理 [#h1267d5f] //Manage massive matrices in R using C++, with UNIX support for shared memory C++ を使って、大規模なマトリックスを作成、蓄積、アクセスそして操作する。UNIX の下では、共有メモリーをサポートする。 //Use C++ to create, store, access, and manipulate massive matrices. Under UNIX, it also supports use of shared memory. **COLOR(red){bindata}: 人工的な二値データの生成 [#g722c765] 相関のある人工的な二値データを生成 **COLOR(red){bipartite}: 二部ネットワーク(bipartite network) の可視化といくつかの生態学係数の計算 [#i40fbaa5] //Visualises bipartite networks and calculates some ecological indices. 詳細は bipartite-package を参照 //See bipartite-package for more details. **COLOR(red){blighty}: 英国の海岸線 [#ra676325] 英国諸島の海岸線を描く関数 **COLOR(red){bio.infer}: 生物学的推定の計算 [#o540cd2d] //Compute biological inferences 底生生物のカウントデータをインポートし、データの書式を再設定し、データより環境推定を計算する。 //Imports benthic count data, reformats this data, and computes environmental inferences from this data. **COLOR(red){BiodiversityR}: 生物多様性と群集生態学分析用GUI [#l8a6d769] //GUI for biodiversity and community ecology analysis 本パッケージは、 GUI(グラフィカル・ユーザ・インターフェース)と生物多様性と生物群集(ecological communities)の統計分析用のいくつのユーティリティ関数(vegan パッケージをベースにすることがよくある)を提供する。本パッケージの分析には、種の累積曲線、多様性指数、Renyi プロファイル、種の豊富さと種の有無のGLM 分析、距離行列、Mantel 検定およびクラスター、制約形/非制約形オーディネーション(ordination)分析を含む。生物多様性および群集生態学の本は、ウェブサイトより自由にダウンローして手に入れられる。 //This package provides a GUI (Graphical User Interface, via the R-Commander) and some utility functions (often based on the vegan package) for statistical analysis of biodiversity and ecological communities, including species accumulation curves, diversity indices, Renyi profiles, GLMs for analysis of species abundance and presence-absence, distance matrices, Mantel tests, and cluster, constrained and unconstrained ordination analysis. A book on biodiversity and community ecology analysis is available for free download from the website. **COLOR(red){biOps}:画像処理と解析 [#w6e84992] //Image processing and analysis 本パッケージは画像処理と解析のいくつかの手法を含んでいる。本パッケージは幾何、算法、論理、形状(1チャンネルのみ)、ルックアップテーブル、エッジ検出(特に Roberts, Sobel, Kirsch, Marr-Hildreth and Cannyを含む)および畳み込みマスク操作(既に定義済みの共通マスクおよびユーザ定義アプリ)を提供する。Isodata および k-means 分類法も提供されている(標準、kd 木、しらみつぶし法が実装されている)。 高速フーリェ変換法フィルターも、 fftw3 がインストールされていれば利用できる。JPEG と TIFF 画像が今までにサポートされている(将来のバージョンではもっと多くの画像形式がサポートされる)、これらは libtiff および libjpeg がインストールされている必要がある。 //This package includes several methods for image processing and analysis. It provides geometric, arithmetic, logic, morphologic (supported on one channel images only), look-up tables, edge detection (including Roberts, Sobel, Kirsch, Marr-Hildreth and Canny, among others) and convolution masks operations (predefined commons masks already defined and user defined applications). Isodata and k-means classification methods are also provided (standard, kd-tree and brute force methods implemented). Fast Fourier Transform methods and filters also available if fftw3 installed. Supports jpeg and tiff images so far (more image support in future versions). libtiff and libjpeg libraries installed required. [[biOps(画像処理と解析)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){biOpsGUI}: 基本画像操作のためのGUI [#u6bbc4be] //GUI for Basic image operations 基本画像操作用GUIパッケージ(GTK+を使用)。現時点では biOps パッケージより、新しいウィンドーにオリジナルサイズを保ち、画像のピクセルの座標と値を持って情報画像データ表示機能のみ提供する。本パッケージは RGtk2 を必要とする。 //GUI (using GTK+) for the basic image operations package. At the moment, just provides a function that displays imagedata from biOps package in a new window, keeping original size and with information on the coords and values of the pixels in the image. It requires RGtk2. **COLOR(red){BLCOP}: Black-Litterman および copula-opinion プーリングフレームワーク [#f10a10d9] //Black-Litterman and copula-opinion pooling frameworks Black-Litterman および Atilio Meucci の copula-opinion プーリングフレームワークの実装。本パッケージはベータリリース。 //An implementation of the Black-Litterman Model and Atilio Meucci's copula opinion pooling framework. This should be regarded as a beta release. **COLOR(red){bnlearn}: ベイジアンネットワーク構造学習 [#nf0ef064] //Bayesian network structure learning 制約ベース(「条件付独立」としても知られる)のアルゴリズムによるベイジアンネットワーク構造学習。本パッケージは離散およびガウシアンネットワークに対して,Grow-Shrink (GS)のアルゴリズム、増分連関 (IAMB) アルゴリズム、Interleaved-IAMB (Inter-IAMB) アルゴリズムおよび Fast-IAMB (Fast-IAMB) アルゴリズムを実装している。離散ネットワークについては、シミュレーションやいくつかのスコア関数が実装されている。 //Bayesian network structure learning via constraint-based (also known as 'conditional independence') algorithms. This package implements the Grow-Shrink (GS) algorithm, the Incremental Association (IAMB) algorithm, the Interleaved-IAMB (Inter-IAMB) algorithm and the Fast-IAMB (Fast-IAMB) algorithm for both discrete and gaussian networks. Simulation and some score functions are implemented for discrete networks. **COLOR(red){Bolstad}: Bolstad の関数 [#a6372831] //Bolstad functions 書籍"Introduction to Bayesian Statistics, Bolstad, W.M. (2007), John Wiley & Sons ISBN 0-471-27020-2"のための R 関数とデータセット //A set of R functions and data sets for the book Introduction to Bayesian Statistics, Bolstad, W.M. (2007), John Wiley & Sons ISBN 0-471-27020-2 **COLOR(red){boot}: ブートストラップ用の R (S-Plus) 関数 (Canty) [#d640c417] "Bootstrap Methods and Their Applications" by A.C. Davison and D.V. Hinkley (1997, CUP) に掲載のブートストラップ用の関数とデータセット **COLOR(red){bootStepAIC}: ブートストラップ stepAIC [#i8846e07] //Bootstrap stepAIC stepAIC() 手続きのブートストラップによるモデルの選択 //Model selection by bootstrapping the stepAIC() procedure. **COLOR(red){bootstrap}: "An Introduction to the Bootstrap" 掲載の関数 [#r558101a] "An Introduction to the Bootstrap" by B. Efron and R. Tibshirani, 1993, Chapman and Hall 掲載のソフトウェア(ブートストラップ、クロスバリデーション、ジャックナイフ法)とデータ **COLOR(red){bpca}: 主成分分析ベースの多変量データのバイプロット [#uee2ffa9] //Biplot of Multivariate Data Based on Principal Components Analysis 主成分分析ベースの多変量データのバイプロット(2次元および3次元)および縮約の品質診断ツールの実装 //Implements biplot (2d and 3d) of multivariate data based on principal components analysis and diagnostic tools of the quality of the reduction. **COLOR(red){bqtl}: ベイジアン QTL マッピング用の道具集 [#ifebfe26] 近親交配と、組替えのある近親近親交配用の QTL マッピング用の道具集。最尤法とベイズ法用の道具を含む。 **COLOR(red){brew}: レポート生成用テンプレートフレームワーク [#sc5c0576] //Templating Framework for Report Generation brew はレポート生成のために、テキストと R コードを組み合わせたテンプレートフレームワークを実装している。brew のテンプレート・シンタックスは、PHP、Ruby の erb モジュール, Java Server Pages および Python の psp モジュールと同様なものである。 //brew implements a templating framework for mixing text and R code for report generation. brew template syntax is similar to PHP, Ruby's erb module, Java Server Pages, and Python's psp module. **COLOR(red){brlr}: バイアスを減らしたロジスティック回帰 [#z540075b] ロジスティック回帰モデルを最大ペナルティ付き尤度法で当てはめる **COLOR(red){BRugs}:OpenBUGS と その R インターフェース BRugs [#gbacfc2c] OpenBUGS と その R インターフェース BRugs を含んだパッケージ **COLOR(red){BSagri}: 圃場試験における安全性評価のための統計手法 [#ma8ea42b] //Statistical methods for safety assessment in agricultural field trials 安全性の評価を目的とする圃場試験評価のための関数、データセットおよびコードの例のコレクション //Collection of functions, data sets and code examples for evaluations of field trials with the objective of safety assessment. **COLOR(red){bspec}: ベイジアン・スペクトル推定 [#gb507426] //Bayesian spectral inference 時系列のパワースペクトルにおけるベイズ推定 //Bayesian inference on the (discrete) power spectrum of time series. *C [#g1d61c9f] **COLOR(red){CADStat}: 因果関係評価に有益ないくつかの統計手法についての GUI を提供する [#n6204b0a] //Provides a GUI to several statistical methods useful for causal assessment JGR を利用して、いくつかの統計手法のための GUI を提供する。提供する手法は散布図、箱ヒゲ図、線形回帰、一般化回帰、四分位、回帰、条件付確率計算および回帰木である。 //Using JGR, provides a GUI to several statistical methods - scatterplot, boxplot, linear regression, generalized linear regression, quantile, regression, conditional probability calculations, and regression trees. **COLOR(red){calibrate}: バイプロットの軸の目盛り [#af6391f7] //Calibration of Biplot Axes 散布図やバイプロット上の(非直交)変数ベクトル上のチックマークの入った目盛りつきスケールの描画パッケージ //Package for drawing calibrated scales with tick marks on (non-orthogonal) variable vectors in scatterplots and biplots. **COLOR(red){car}: Companion to Applied Regression [#i393a084] J. Fox, An R and S-PLUS Companion to Applied Regression, Sage, 2002, のコンパニオンパッケージ。主に、応用回帰、線形モデル、一般化線形モデル用の関数を含む。回帰診断、特にグラフィカルな診断に重点をおく。また幾つかの道具関数がある。幾つかの例外を除き、R の基本的関数や広く使われているパッケージと内容が重複しないように努めた。car 中の幾つかの関数は MASS パッケージ中の関数を、もしそれがあれば、使う。subset 関数は leap パッケージ中の regset 関数がつくり出すオブジェクトをグラフ化する。car 中の関数は、もし必要なら、オプション na.action = na.omit や na.exclude と両立する。 [[car(応用回帰必携)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){caret}: 分類および回帰トレーニング [#ee26fe93] //Classification and Regression Training 分類および回帰モデルのトレーニングおよび作図用各種関数 //Misc functions for training and plotting classification and regression models **COLOR(red){caretNWS}: NetworkSpaces を使って並列化した分類と回帰トレーニング [#pf344db0] //Classification and Regression Training in Parallel Using NetworkSpaces 並列処理を用いることで指数関数のいくつかが強化される //Augment some caret functions using parallel processing **COLOR(red){cba}: ビジネス分析論用クラスタリング [#l566c0a7] //Clustering for Business Analytics Proximus and Rock のようなクラスタリングテクニック、横断距離(cross distance)の効率的な計算ユーティリティ関数およびデータ操作の実装 //Implements clustering techniques such as Proximus and Rock, utility functions for efficient computation of cross distances and data manipulation. **COLOR(red){ccgarch}: 条件付相関 GARCH モデル [#pf7c19c7] //Conditional Correlation GARCH models GARCH モデル族の推定およびシミュレーションのための関数 //Functions for estimating and simulating the family of the CC-GARCH models. **COLOR(red){CDNmoney}: カナダ通貨及び信用集計量の要素 [#bb734b71] //Components of Canadian Monetary and Credit Aggregates 連続性を調整されたカナダ通貨及び信用集計量の要素 //Components of Canadian Credit Aggregates and Monetary Aggregates with continuity adjustments. **COLOR(red){CellularAutomaton}: 1次元セルオートマトン [#g527a602] //One-Dimensional Cellular Automata 本パッケージジは1次元セルオートマトンのオブジェクト指向実装。本パッケージは基本ルール、ユーザ定義ルール、半径、ユーザ定義の seeding、および作図を含むMathematicaの提供する多くの機能をサポートする、 //This package is an object-oriented implementation of one-dimensional cellular automata. It supports many of the features offered by Mathematica, including elementary rules, user-defined rules, radii, user-defined seeding, and plotting. **COLOR(red){cfa}: configuration frequencies (CFA) の解析 [#b971d8b9] configuration frequencies (単一、そして繰返し測定) と、階層的・ブートストラップ-CFA の解析などとプロット。 **COLOR(red){cggd}: 連続一般化勾配法 [#zb59e6f5] //Continuous Generalized Gradient Descent 異なるモデルタイプについてほとんどの回帰シーケンスをあてはめるための効率的な手続き //Efficient procedures for fitting an entire regression sequences with different model types. **COLOR(red){CGIwithR}: R における CGI プログラミング [#dbf4c724] R を使って CGI スクリプトを書く機能 **COLOR(red){cheb}: 離散線形チェビシェフ近似 [#c0ac78eb] //Discrete Linear Chebyshev Approximation 離散線形チェビシェフ近似 //Discrete Linear Chebyshev Approximation **COLOR(red){CITAN}: 引用分析ツールパック [#wd07abb7] //CITation ANalysis toolpack CITAN は、科学計量学における計量研究に有用な(この領域に限定されない)関数ライブラリー。このライブラリーは、Pareto-type II 分布を取り扱うさまざまな手法も含む。 //CITAN is a library of functions useful in - but not limited to - quantitative research in the field of scientometrics. It also contains various methods for dealing with the Pareto-type II distribution. **COLOR(red){CircStats}: 角度データの統計 [#a1b80aaa] "Topics in circular Statistics" (2001) S. Rao Jammalamadaka and A. SenGupta, World Scientific, 中の角度(方向)データの統計 **COLOR(red){classGraph}: S4 クラス階層の構築 [#xe8ca504] //Construct Graphs of S4 Class Hierarchies S4 クラス階層の有向グラフの構築及び可視化。一般的に、これらのグラフは通常 DAG(有向非巡回グラフ)で、実際には簡単な木構造になることがよくある。 //Construct directed graphs of S4 class hierarchies and visualize them. In general, these graphs typically are DAGs (directed acyclic graphs), often simple trees in practice. **COLOR(red){classInt}: 単変量階級の選択 [#rf887676] 地図またはグラフィックス用単変量階級の選択パッケージ [[classInt(単変量階級間隔の選択)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){clim.pact}: 気象解析と月別・日別データの downscaling 用パッケージ [#i7282c1e] このパッケージはデータの取得、気象データの解析、大局的気象シナリオの月別平均、日別平均の downscale を行なう R 関数を含む。 **COLOR(red){clv}: クラスター検証テクニック [#j126048d] //Cluster Validation Techniques このパッケージは cluster パッケージからの関数による出力のほとんど利用に用意された内部および外部クラスター検証手法のほとんどを含む。また,パッケージは "cluster" パッケージに実装されているアルゴリズムに適用されているクラスタ安定化アプローチのために使用される関数と例も含んでいる。 //Package contains most of the popular internal and external cluster validation methods ready to use for the most of the outputs produced by functions coming from package "cluster". Package contains also functions and examples of usage for cluster stability approach applied to algorithms implemented in "cluster" package. **COLOR(red){clValid}: クラスター結果の検証 [#qa41d3ba] //Validation of Clustering Results クラスター結果の統計的・生物学的検証 //Statistical and biological validation of clustering results. **COLOR(red){clue}: クラスター・アンサンブル [#v1e9980f] //Cluster ensembles クラスター・アンサンブル //CLUster Ensembles **COLOR(red){cluster}: クラスタリング用の関数 (Rousseeuw et al. による) [#rd1770e7] クラスタリング用の関数、もとは Peter Rousseeuw, Anja Struyf そして Mia Hubert による **COLOR(red){clusterfly}: R および GGobi を使ったクラスタリングの対話型探索 [#iba94119] //Explore clustering interactively using R and GGobi 詳細は http://had.co.nz/reshape を参照 //See http://had.co.nz/reshape for more information. **COLOR(red){clusterGeneration}: ランダムクラスタの生成 [#reca327d] //random cluster generation (with specified degree of separation) 本パッケージはランダムなクラスタ生成、ランダムな共分散/相関行列の生成、クラスタのペアまたはクラスタ分布の分離インデックス(データおよび母集団バージョン)の計算、1次元および2次元の射影プロットをしてクラスタの可視化をおこなう関数を含んでいる。本パッケージはまた分離度、クラスター数、変数の数、雑音変数のような因子を使う要因計画に基づくランダムなクラスタの生成関数を含む。 //The package contains functions for generating random clusters, generating random covariance/correlation matrices, calculating a separation index (data and population version) for pairs of clusters or cluster distributions, and 1-D and 2-D projection plots to visualize clusters. The package also contains a function to generate random clusters based on factorial designs with factors such as degree of separation, number of clusters, number of variables, number of noisy variables. **COLOR(red){clusterRepro}: 遺伝子発現のクラスターの再現性 [#k0e9ffc1] //Reproducibility of gene expression clusters 再現性によるマイクロアレイクラスターの検証関数 //A function for validating microarry clusters via reproducibility **COLOR(red){cmm}: カテゴリカル周辺モデル [#e0b0690c] //Categorical Marginal Models カテゴリカルデータのための推定用の非常に広範なパッケージ //Quite extensive package for the estimation of marginal models for categorical data. **COLOR(red){cmprsk}: 競合リスクの半分布関数の解析 [#t1244d0d] 競合リスクの半分布関数の推定、検定と回帰モデリング。参考文献、Gray (1988), A class of K-sample tests for comparing the cumulative incidence of a competing risk, Ann. Stat. 16:1141-1154, そして Fine JP and Gray RJ (1999), A proportional hazards model for the subdistribution of a competing risk, JASA, 94:496-509. **COLOR(red){cobs}: COBS -- 拘束条件付きの B-スプライン [#l3c51dc1] 線形計画法を用いた定性的拘束条件を持つ(回帰)平滑化 **COLOR(red){CoCoAn}: 拘束条件付き対応解析 [#f5c4d3dc] 対応解析と拘束条件付き対応解析を計算し、関連するグラフィック表示をする二つの関数 **COLOR(red){coda}: MCMC用の出力解析と診断 [#v9f31b27] マルコフチェインモンテカルロシミュレーション用の出力解析と診断 [[coda(マルコフ連鎖モンテカルロ(MCMC)シミュレーションについての出力の分析および診断)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){codetools}: R 用コード分析ツール [#yee95932] //Code Analysis Tools for R R 用コード分析ツール //Code analysis tools for R **COLOR(red){combinat}: 組合せ論用の道具 [#q53952db] 組合せ論用ルーティン **COLOR(red){compare}: オブジェクトを比較して差分をとる [#e5e09742] //Comparing Objects for Differences ベクトルとデータフレームを比較する関数 //Functions for comparing vectors and data frames. [[compare(オブジェクトを比較して差分をとる)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){compoisson}: Conway-Maxwell-Poisson 分布 [#n356254f] //Conway-Maxwell-Poisson Distribution Conway-Maxwell-Poisson 分布の密度およびモーメントのためのルーチンおよびモデルを COM-Poisson モデルにあてはめる関数を提供する。 //Provides routines for density and moments of the Conway-Maxwell-Poisson distribution as well as functions for fitting the COM-Poisson model for over/under-dispersed count data. **COLOR(red){colorspace}: 色空間操作 [#g76f4555] //Colorspace Manipulation 分類された色空間の間のマッピング操作 //Carries out mapping between assorted color spaces. **COLOR(red){conf.design}: ファクトリアルデザインを作る [#h668cae7] **COLOR(red){convexHaz}: 凸ハザード(convex hazard)のノンパラメトリック MLE/LSE [#qca2fc91] //Nonparametric MLE/LSE of convex hazard 本パッケージは凸ハザード関数のノンパラメトリックな最尤推定値 (MLE) およびノンパラメトリック最小二乗推定値 (LSE) 関数を含む。凸ハザード関数はデータが IID であると仮定している。 //This package contains functions to compute the nonparametric maximum likelihood estimator (MLE) and the nonparametric least squares estimator (LSE) of a convex hazard function, assuming that the data is IID. **COLOR(red){copas}: メタアナリシスのためのモデル化と修正のための統計手法 [#f87e2f3b] //Statistical methods to model and adjust for bias in meta-analysis Copas 選択モデル。 //Copas selection model. **COLOR(red){corcounts}: 相関のあるカウントランダム変数 [#m69a2531] //Generate correlated count random variables 事前に指定されたピアソン相関をもつ高次元の相関のあるカウントランダム変数を生成する。 //Generate high-dimensional correlated count random variables with a prespecified Pearson correlation. **COLOR(red){corrgram}: コレログラムの作図 [#h99dcece] // Plot a correlogram 変数の相関計算と結果をグラフィックに表示。 //Calculates correlation of variables and displays the results graphically. **COLOR(red){countrycode}: 国名と符号化スキームの変換 [#rcc7a6d7] //Converts country names and coding schemes 国名の標準化、これらを7つの符号化スキームの1つに変換して、地域記述子を当てはめる //Standardizes country names, converts them into one of seven coding schemes, and assigns region descriptors **COLOR(red){coxphw}: 重み付きコックス回帰 [#k7f16239] //Weighted Cox regression コックス回帰の重み付き推定 //Weighted estimation for Cox regression **COLOR(red){CPE}: 生存分析の一致確率(concordance probability)推定 [#hd120ade] //Concordance probability estimates in survival analysis 生存分析の一致確率(concordance probability)推定関数 //Functions to calculate concordance probability estimates in survival analysis **COLOR(red){CPGchron}: 放射年代の深さを作成 [#f59a51c2] //Create radiocarbon-dated depth chronologies 本パッケージは Parnell and Haslett (2007, JRSSC に提出; 印刷前に著者と連) の著作に従うものである。本パッケージは放射年代が付けられた堆積コアの MCMC、予測および作図を実行する。 //This package follows the work of Parnell and Haslett (2007, submitted to JRSSC; contact the author for a pre-print). It runs MCMC, predictions and plots for radiocarbon-dated sediment cores. **COLOR(red){cramer}: 多変量ノンパラメトリッククラメール検定 [#b5fdb708] 多変量ノンパラメトリッククラメール検定用の R ルーティンを提供する **COLOR(red){crantastic}: http://crantastic.org/ のための雑多な R ツール [#vb122710] //Various R tools for http://crantastic.org/ http://crantastic.org/ のための雑多な R ツール //Various R tools for http://crantastic.org/ **COLOR(red){cshapes}: CShapes データセット及びユーティリティー [#ea063808] //CShapes Dataset and Utilities CShapes データセット、国境界(1946-2008)の GIS データセット。データ抽出及びウェイトマトリックス計算のための関数を含む。 //Package for CShapes, a GIS dataset of country boundaries (1946-2008). Includes functions for data extraction and the computation of weights matrices. [[cshapes(CShapes データセット及びユーティリティー)パッケージ中のオブジェクト一覧]] *D [#wb6b788a] **COLOR(red){DAAG} DAAG データ分析とグラフィックス [#k28974e1] Maindonald, J.H. and Braun, W.J. (2003) "Data Analysis and Graphics Using R" の本の中の例と演習で使用されている種々のデータセット. **COLOR(red){DAAGxtras}: データセット及び関数、 DAAG の補遺 [#o5c8ce9d] Data Sets and Functions, supplementary to DAAG 書籍 Maindonald, J.H. and Braun, W.J. (2nd edn 2007) "Data Analysis and Graphics Using R", と データマイニングコース向けの追加例題で使用するさまざまなデータ。本パッケージのバージョン 0.7-6 にあった多くのデータセットが、DAAG パッケージに移動されたので注意されたい。 //various data sets used in additional exercises for the book Maindonald, J.H. and Braun, W.J. (2nd edn 2007) "Data Analysis and Graphics Using R", and for a 'Data Mining' course. Note that a number of datasets that were in version 0.7-6 of this package have been transferred to the DAAG package. **COLOR(red){data.table}(データフレームの拡張。i および j の式、キーおよびバイナ [#b758f1ec] [[data.table(データフレームの拡張。i および j の式、キーおよびバイナリー探索)パッケージ中のオブジェクト中の一覧]] **COLOR(red){dataframes2xls}: dataframes2xls はデータフレームを XLS ファイルに書き込む [#oca30861] //dataframes2xls writes data frames to xls files dataframes2xls はデータフレームを XLS ファイルに書き込む。複数のシートや基本的な書式もサポート。 //dataframes2xls writes data frames to xls files. It supports multiple sheets and basic formatting. [[dataframes2xls パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){Davies}: Davies クォンタイル関数 [#t6830bd2] Davies クォンタイル関数と一般化ラムダ分布用の有用な関数 **COLOR(red){DBI}: R/S-Plus とデータベースへのインタフェイス [#i60994fb] R/S-plus と関係データベース管理システム間の橋渡しをするデータベースインタフェイス(DBI)。このパッケージ中のすべてのクラスは仮想的で、様々な R/DBMS の実装により拡張される必要がある。 **COLOR(red){dblcens}: 二重センサーデータから分布の NPMLE(ノンパラメトリック最尤推定量?)を求める [#xf54f798] 経験分布関数、そして二つのセンサー分布の NPMLE (ノンパラメトリック最尤推定量?) を EM アルゴリズムで求める。データは二重にセンサリングされていても良い。制約条件を科すこともでき、制約付き NPMLE と -2log (尤度比) を与える。これは、経験尤度比定理を用いて、F(K) に対する仮説検定と、信頼区間を求めることを可能にする。influence 関数も計算できる(が遅い)。 **COLOR(red){DCluster}: 疾病の空間クラスター検出関数群 [#bf535f9d] カウントデータを用いた疾病の空間クラスター検出関数セット。統計量の標本分布にはブートストラップを使用している。 [[DCluster(疾病の空間クラスター検出用関数)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){ddesolve}: 遅延微分方程式ソルバー [#rf14e2dd] //Solver for Delay Differential Equations 本パッケージは遅延微分方程式系の解を与える。Benjamin J. Cairns と分担して、 Simon N. Wood によって作成された数値ルーチンのインターフェースを持つ。これらの数値ルーチンは、Simon Wood の solv95 に最初にあったものである。 //This package solves systems of delay differential equations. by interfacing numerical routines written by Simon N. Wood , with contributions by Benjamin J. Cairns . These numerical routines first appeared in Simon Wood's solv95 program. **COLOR(red){DEA}: データ包絡分析 [#m8db6b7e] //Data Envelopment Analysis 包絡分析法の基本的なモデルの実行。乗数および包絡量の形式に対応。 //Performs some basic models of Data Envelopment Analysis, both in multiplier and envelopment form. **COLOR(red){deal}: 混合変数を持つベイジアンネットワークの学習 [#ldae50ad] 連続/離散変数を持つベイジアンネットワークの学習と、データからの比較ができる。 **COLOR(red){debug}: R 用 MVB のデバッガ [#k7550c33] //MVB's debugger for R R 関数用デバッガ。コード表示、適切なエラー復帰、ライン番号での条件付きブレークポイント、終了コードへのアクセス、フロー制御およびフルキーボード入力 //Debugger for R functions, with code display, graceful error recovery, line-numbered conditional breakpoints, access to exit code, flow control, and full keyboard input. **COLOR(red){DeducerSpatial}: 空間データ分析用 Deducer [#n8bad109] //Deducer for spatial data analysis 空間データ分析用 Deducer プラグイン。Open Street Map と Bing Map の衛星画像の表示能力を含む。 //A Deducer plug-in for spatial data analysis. Includes The ability to plot and explore open street map and Bing satellite images. **COLOR(red){Defaults}: デフォルトのグローバル関数の作成 [#s69fa2e1] //Create Global Function Defaults デフォルトのグローバル関数の設定・取得・インポート //Set, get, and import global function defaults **COLOR(red){deldir}: ドロネイ三角化とディリクレ (ボロノイ) 分割 [#y02f40fe] 平面の点集合から、ドロネイ三角化とディリクレ・ボロノイ)分割を計算する。 [[deldir(ドロネイ三角形網およびディリクレ(ボロノイ)分割)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){delt}: 適応ヒストグラムを用いた多変量密度の推定 [#e810d3c4] //Estimation of multivariate densities with adaptive histograms 本パッケージは次の多変量密度の推定手法を実装している。適応ヒストグラム(欲張りヒストグラム および CART ヒストグラム)、段階的最小化およびブートストラップの集約が本パッケージに含まれている。 //The package implements methods for estimating multivariate densities: adaptive histograms (s and CART-histograms), stagewise minimization, and bootstrap aggregation are included in the package. **COLOR(red){depmix}: 従属混合モデル [#f85e3240] //Dependent Mixture Models カテゴリおよび連続(時系列)組み合わせデータに潜在マルコフ(マルチグループ)混合モデルのあてはめ //Fit (multigroup) mixtures of latent Markov models on mixed categorical and continuous (timeseries) data **COLOR(red){descr}: 記述統計 [#b0100e46] //Descriptive statistics 本パッケージは重み付けカテゴリカル変量を記述する関数とオブジェクトの文字符号化変換を容易にする関数を含んでいる。 //This package contains functions to describe weighted categorical variables and functions to facilitate the character encoding conversion of objects. **COLOR(red){DescribeDisplay}: DescribeDisplay (GGobi プラグイン)の R インターフェース [#gee8078b] //R interface to DescribeDisplay (GGobi plugin) GGobi の表示プラグインの出力より印刷品質のグラフィックスを生成する //Produce publication quality graphics from output of GGobi's describe display plugin **COLOR(red){Devore5}: Devore の "Prob and Stat for Eng (5th ed)" 中のデータセット [#mcf5a031] Jay L. Devore (2000), "Probability and Statistics for Engineering and the Sciences (5th ed)", Duxbury, 中のデータセットと見本解析 **COLOR(red){Devore7}: Devore の"Prob and Stat for Eng (7th ed)"のデータセット [#z826efb6] //Data sets from Devore's "Prob and Stat for Eng (7th ed)" Jay L. Devore (2008) の"Probability and Statistics for Engineering and the Sciences (7th ed)", Thomson のデータセットおよびサンプル分析 //Data sets and sample analyses from Jay L. Devore (2008), "Probability and Statistics for Engineering and the Sciences (7th ed)", Thomson. **COLOR(red){devtools}: R コード開発簡易化ツール [#cba2ce1f] //Tools to make developing R code easier パッケージ開発ツールコレクション //Collection of package development tools **COLOR(red){dglm}: 二重一般化線形モデル [#j99379bd] //Double generalized linear models 二重一般化線形モデルのあてはめ //Fitting double generalized linear models **COLOR(red){diamonds}: ダイアモンド分割の解析と標本格子 [#pdcc91cd] Analysis and sampling grids from diamond partitions 格子からのサンプリングと解析のための、平面もしくは正4・12面体上の aperture-4 ダイアモンド分割を解説する関数 **COLOR(red){dichromat}: 二色型色覚者用のカラースキーム [#i7de4d52] 色盲効果をシミュレーションするため赤・緑の差異を縮小する **COLOR(red){DierckxSpline}: "Curve and Surface Fitting with Splines" の R 必携 [#xcb0fdf3] //R companion to "Curve and Surface Fitting with Splines" 本パッケージは Paul Dierckx の書いた FITPACK のルーチンのラッパーを提供する。オリジナルの Fortran は http://www.netlib.org/dierckx より入手できる。 //This package provides a wrapper to the FITPACK routines written by Paul Dierckx. The original Fortran is available from http://www.netlib.org/dierckx **COLOR(red){dirichlet}: マーケティングのための消費者購買行動 Dirichlet モデル [#v3945885] //Dirichlet model of consumer buying behavior for marketing research Dirichlet (別名 NBD-Dirichlet) モデルは消費財の購買生起および銘柄選択を記述する。モデルを推定する。モデル推定をおこない、マーケティングリサーチャの関心のあるさまざまな理論的な量を要約する。また、観測および理論統計量を比較するテーブル作成用関数を提供する。 //The Dirichlet (aka NB **COLOR(red){diseasemapping}: 人口及び事例データより SMR(標準化死亡比)の計算 [#s8aa0082] //Calculate SMR's from population and case data 通常のデータセット及びシェープファイルを使って動作 //works with regular data set file and shape file. [[diseasemapping(人口及び事例データより SMR(標準化死亡比)の計算)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){dismo}: 種の分布モデリング [#lde853df] //Species distribution modeling 種の分布モデリングのための関数。すなわち、特定箇所における全体の地理的分布形の発生を予測する。 //Functions for species distribution modeling, that is, predicting entire geographic distributions form occurences at specific sites. **COLOR(red){dispmod}: 逸脱度モデル [#wfde36e1] GLIM における逸脱度をモデル化する関数 **COLOR(red){distrMod}: 確率モデルのオブジェクト指向実装 [#c797f791] //Object orientated implementation of probability models パッケージベースの確率モデルのオブジェクト指向実装 //Object orientated implementation of probability models based on packages 'distr' and 'distrEx' **COLOR(red){divagis}: 地理参照された(位置情報つきの)植物種取得の品質チェックのためのツールを提供する [#we086d2c] //Provides tools for quality checks of georeferenced plant species accessions divagis: 地理参照された(位置情報つきの)植物種取得の品質チェックのためのツールを提供する //Provides tools for quality checks of georeferenced plant species accessions. [[divagis(地理参照された(位置情報つきの)植物種取得の品質チェックのためのツール)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){dlm}: 動的線形モデルのベイズおよび尤度分析 [#k6db7a77] //Bayesian and Likelihood Analysis of Dynamic Linear Models 正規線形状態空間モデル、動的線形モデルとして知られているものだが、の最尤法、カルマンフィルタリングおよび平滑化およびベイズ分析 //Maximum likelihood, Kalman filtering and smoothing, and Bayesian analysis of Normal linear State Space models, also known as Dynamic Linear Models **COLOR(red){dplR}: R の年代年輪学プログラムライブラリー [#lead7871] //Dendrochronology Program Library in R 本パッケージはいくつかの標準的な木の年輪分析を実行する関数を含む。 //This package contains functions for performing some standard tree-ring analyses. **COLOR(red){dr}: 回帰における次元縮小法 [#qa3426d1] **COLOR(red){dse}: 多変量時系列解析ライブラリ [#c2457653] 各パッケージには doc/*-guide.pdf そして 'http://www.bank-banque-canada.ca/pgilbert ' から得られるユーザーガイドがある。パッケージ dse1 は基本システムで、多変量 ARMA と状態空間モデルを含む。 パッケージ dse2 は推定方法の吟味、予測、予測方法の吟味のための拡張を含む。 パッケージ tframe は時系列に関するプログランミングのためのカーネル法である。 パッケージ setRNG は S と R で同じ乱数を生成する機構を含む。関連バンドル dseplus も参照。setRNG, tframe, dse1, dse2 を含むバンドル **COLOR(red){DSpat}: 距離サンプリングデータの空間モデリング [#p6f7d1d4] //Spatial modelling for distance sampling data 標本データの(個体群調査) 線状法空間モデルのあてはめ、および領域内の繁栄状態を推定する関数を提供する。 //Provides functions for fitting spatial models to line transect sampling data and to estimate abundance within a region. **COLOR(red){dtt}: 離散三角関数変換 [#t6fb62ef] //Discrete Trigonometric Transforms 本パッケージは1次元及び2次元の離散コサイン変換(DCT)、離散サイン変換 (DST) 及び離散 Hartley 変換用の関数を提供する。 //This package provides functions for 1D and 2D Discrete Cosine Transform (DCT), Discrete Sine Transform (DST) and Discrete Hartley Transform (DHT). [[dtt(離散三角関数変換)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){DMwR}: "Data Mining with R" のための関数とデータ [#p8c0ea63] //Functions and data for "Data Mining with R" 本パッケージは、Luis Torgo, CRC Press 2010 の"Data Mining with R" 添付の関数とデータを含む //This package includes functions and data accompanying the book "Data Mining with R, learning with case studies" by Luis Torgo, CRC Press 2010. **COLOR(red){dynamicGraph}: dynamicGraph [#f22aeb1c] グラフ操作用対話型グラフィックツール [[dynamicGraph(グラフ操作用対話型グラフィカルツール)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){dynlm}: 動的線形回帰 [#n6743242] //Dynamic Linear Regression 動的線形回帰および時系列回帰 //Dynamic linear models and time series regression. *E [#v2fbe62b] **COLOR(red){e1071}: TU Wien の統計学科(e1071)提供の雑多な関数 [#b4208950] 潜在的クラス解析用関数、短期間のフーリエ変換、ファジークラスタリング、サポートベクターマシン、bagged クラスタリング、等 [[e1071 (ウィーン工科大 統計学科の雑多な関数)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){earth}: Earth: 多変量適応型回帰スプラインモデル [#b2e0ee32] //Earth: Multivariate Adaptive Regression Spline Models Friedman の論文 "Fast MARS" および "Multivariate Adaptive Regression Splines" のテクニックを使った回帰モデルを構築する。("MARS" という用語は著作権があり、そのためパッケージ名には使用されない.) //Build regression models using the techniques in Friedman's papers "Fast MARS" and "Multivariate Adaptive Regression Splines". (The term "MARS" is copyrighted and thus not used as the name of the package.) **COLOR(red){Ecdat}: 計量経済学用データセット [#df7bbe00] 計量経済学用データセット **COLOR(red){ecespa}: 空間ポイントパターン分析のための関数 [#ua65886f] //Functions for spatial point pattern analysis 空間ポイントパターン分析(重に spatstat ベース)のためのいくつかのラッパー、関数およびデータセット。書籍 "Introduccion al Analisis Espacial de Datos en Ecologia y Ciencias Ambientales: Metodos y Aplicacionesで使用。 //Some wrappers, functions and data sets for for spatial point pattern analysis (mainly based on spatstat), used in the book "Introduccion al Analisis Espacial de Datos en Ecologia y Ciencias Ambientales: Metodos y Aplicaciones". **COLOR(red){ecodist}: 生態学分析のための非類似度ベースの関数 [#x04863ab] //Dissimilarity-based functions for ecological analysis 生態学分析のための非類似度ベースの関数。空間およびコミュニティのデータでの利用を考えたオーディネーションおよび Mantel 検定の関数を含む。 //Dissimilarity-based analysis functions including ordination and Mantel test functions, intended for use with spatial and community data. ク **COLOR(red){EDR}: 効果的な次元縮約 (EDR) 空間 [#c37a0a79] //Estimation of the effective dimension reduction (EDR) space 本ライブラリは多重インデックス回帰モデルの効果的な次元縮約空間を推定する R 関数を含んでいる。 //The library contains R-functions to estimate the effective dimension reduction space in multi-index regression models. **COLOR(red){effects}: 線形回帰、一般化線形モデルに対する効果の表示 [#p6cac716] 線形回帰、一般化線形モデルに対する効果、例えば交互作用、のグラフィカルと表による表示 **COLOR(red){eha}: 事象履歴解析(イベントヒストリー分析) [#nff43706] 生存解析、事象履歴解析用のパッケージ [[eha(イベントヒストリー分析)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){eiPack}: 生態学推定および高次元データ管理 [#s23c8d45] //Ecological Inference and Higher-Dimension Data Management 極端な事例の分析、生態学回帰、および多項ディリクレ生態学推定モデルを使った R x C 生態学分割表のための手法を提供する。高次元のデータオブジェクトを操作するツールも提供する。 //Provides methods for analyzing RxC ecological contingency tables using the extreme case analysis, ecological regression, and Multinomial-Dirichlet ecological inference models. Also provides tools for manipulating higher-dimension data objects. **COLOR(red){ellipse}: 楕円と楕円状の信頼領域を描く関数 [#t4e5ed6e] このパッケージは、様々な楕円と楕円状の信頼領域を描く関数を含む。次の本に紹介されているプロットを実装している:Murdoch and Chow (1996), A graphical display of large correlation matrices, The American Statistician 50, 178-180. また Bates and Watts (1988), Nonlinear Regression Analysis and its Applications にあるプロファイルプロットを実装している。 **COLOR(red){EMC}: 進化モンテカルロ(EMC)アルゴリズム [#c027b053] //Evolutionary Monte Carlo algorithm ランダム・ウォーク・メトロポリス(Random walk Metropolis)、Metropolis Hasting、擬似焼き戻し法 (Simulated Tempering) 、temperature ladder construction and placement //Random walk Metropolis, Metropolis Hasting, parallel tempering, evolutionary Monte Carlo, temperature ladder construction and placement **COLOR(red){emdbook}: 生態学モデルとデータ(本のサポート) [#d250ed01] //Ecological models and data (book support) 生態学者のための最尤推定とそれに関連するトピックを提示する Ecological Models and Data(Princeton University Pressで出版準備中) のための補助関数およびデータセット //Auxiliary functions and data sets for _Ecological Models and Data_, a book presenting maximum likelihood estimation and related topics for ecologists (in preparation for Princeton University Press) **COLOR(red){emme2}: EMME/2 databank への入出力 [#k3e5f193] このパッケージは EMME/2 databank への入出力用の関数を含む。 **COLOR(red){emplik}: センサー・打ち切りデータに対する経験尤度比 [#ud84c2c2] センサー・打ち切りを含むデータの平均、クォンタイル、ハザードに対する経験尤度比検定 **COLOR(red){ensembleBMA}: アンサンブルおよびベイズモデル平均化を使った確率的予測 [#c13e060e] //Probabilistic Forecasting using Ensembles and Bayesian Model Averaging アンサブル予測および気象観測より確率的予測を作成するベイズモデル平均化 //Bayesian Model Averaging to create probabilistic forecasts from ensemble forecasts and weather observations. **COLOR(red){emoa}: 進化多目的最適化アルゴリズム [#qbfcc166] //Evolutionary Multiobjective Optimization Algorithms 進化多目的最適化アルゴリズムのデザインと分析のための構成要素のコレクション //Collection of building blocks for the design and analysis of evolutionary multiobjective optimization algorithms. **COLOR(red){EMV}: データ行列に対する欠損値の推定 [#z6a5b508] k-近接近傍アルゴリズムによるデータ行列中の欠損値の推定 **COLOR(red){epicalc}: 疫学計算機 [#z8f53351] //Epidemiological calculator 疫学計算を簡単にする R の関数 //Functions making R easy for epidemiological calculation. **COLOR(red){epiR}: 疾病データ分析用関数 [#j5dd2fc4] //Functions for analysing epidemiological data 疾病データ分析用パッケージ。疾患頻度の測度の直接間接の調整、分割表であらわされた計数データの単層または多層を基にした関連ための関連測度の定量化、罹患リスクおよび罹患率の推定まわりの信頼区間計算ための関数を含む。メタアナリシス、診断テスト解釈および標本サイズの計算のための雑多な関数。 //A package for analysing epidemiological data. Contains functions for directly and indirectly adjusting measures of disease frequency, quantifying measures of association on the basis of single or multiple strata of count data presented in a contingency table, and computing confidence intervals around incidence risk and incidence rate estimates. Miscellaneous functions for use in meta-analysis, diagnostic test interpretation, and sample size calculations. **COLOR(red){epitools}: 疫学ツール [#i2ad6028] //Epidemiology Tools EpiTools: 疫学データ及びグラフィックスのための R パッケージ //EpiTools: R Package for Epidemiologic Data and Graphics **COLOR(red){ergm}: ネットワークの指数族モデルのあてはめ、シミュレーションおよび診断 [#n63e64f7] //Fit, Simulate and Diagnose Exponential-Family Models for Networks 指数族ランダム・グラフモデル (ERGM) に基づくネットワークの分析およびシミュレーションのための統合ツールセット。 "ergm"はネットワーク分析用パッケージスイート "statnet" の一部である。関数リストを見るには、 help(package='ergm') とタイプすればよい。 //An integrated set of tools to analyze and simulate networks based on exponential-family random graph models (ERGM). "ergm" is a part of the "statnet" suite of packages for network analysis. For a list of functions type: help(package='ergm') **COLOR(red){eRm}: 拡張ラッシュモデリング [#n953923f] //Extended Rasch Modeling. eRm ラッシュモデル (RM), 線形ロジスティック検定モデル (LLTM), 評定尺度モデル (RSM), 線形評定尺度モデル (LRSM), 部分採点モデル(PCM:Partial Credit Model),および線形部分採点モデル(LPCM:linear partial credit models)へのあてはめをおこなう.データマトリックスで欠損値は扱える。個人パラメータ、LR-Model テスト、項目指定 Wald テスト、itemfit and personfit statistics、各種 ICC プロットの推定が追加されている。 //eRm fits Rasch models (RM), linear logistic test models (LLTM), rating scale model (RSM), linear rating scale models (LRSM), partial credit models (PCM), and linear partial credit models (LPCM). Missing values are allowed in the data matrix. Additional features are the estimation of the person parameters, LR-Model test, item-spefific Wald test, itemfit and personfit statistics, various ICC plots. **COLOR(red){evd}: 極値分布の関数 [#c9ebb5c5] 一次元と多次元の極値パラメトリック分布のシミュレーション、クォンタイル、そして密度関数。また、一次元と多次元モデルに対する最尤推定量を計算する当てはめ関数を提供する。 **COLOR(red){exactLoglinTest}: 対数線形モデルのモンテカルロ正確確率検定(Exact Test) [#ta178318] 対数線形モデルのモンテカルロおよび MCMC 適合度検定 **COLOR(red){exactRankTests}: ランクとパーミュテーション検定に対する正確分布 [#g402147f] Streitberg と Roehmel のシフトアルゴリズムの実装を用いた正確な p-値とクォンタイル
タイムスタンプを変更しない
[[A:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--I#od8517e5]] [[B:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--I#i67ed2ea]] [[C:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--I#g1d61c9f]] [[D:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--I#wb6b788a]] [[E:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--I#v2fbe62b]] [[F:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--II#dfd6e0bc]] [[G:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--II#t13a9272]] [[H:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--II#x03913de]] [[I:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--II#c0b3d4d2]] [[J:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--II#bee56ca4]] [[K:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--II#w1ae3894]] [[L:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--II#pa851b1b]] [[M:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--III#k19f18df]] [[N:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--III#i42ceeb3]] [[O:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--III#va02ff2e]] [[P:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--III#ida25b2c]] [[Q:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--III#r9a6e634]] [[R:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--III#t904394c]] [[S:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--IV#hab20eca]] [[T:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--IV#i546cc78]] [[U:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--IV#cbf46408]] [[V:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--IV#uc9b8881]] [[W:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--IV#nd98654b]] [[X:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--IV#v5b41f05]] [[Y:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--IV#ge4e73b6]] [[Z:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--IV#l4166191]]~ ~ [[CRAN パッケージリスト:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88]]~ CRAN パッケージリスト(A〜E)~ [[CRAN パッケージリスト(F〜L):http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--II]]~ [[CRAN パッケージリスト(M〜R):http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--III]]~ [[CRAN パッケージリスト(S〜Z):http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--IV]]~ ---- リンク切れになっていたので,エンコーディングの変更とサーバーの変更に対応させた 2017/04/17~ SIZE(25){COLOR(red){CRAN パッケージリスト(A〜E)}}~ #contents ~ ---- ~ *A [#od8517e5] **COLOR(red){aaMI}: タンパク質配列のアラインメントのための相互情報量 [#j59270bd] **COLOR(red){abind}: 多次元配列の結合 [#aa79deb2] 多次元配列を結合する。cbind と rbind の一般化。ベクトル、行列、配列の列を与え、同一またはより高い次元の単一の配列を作る。 **COLOR(red){accuracy}: 統計処理の結果の正確さをテストし改善するためのツール [#a2767025] **COLOR(red){actuar}: 保険数理関数 [#ve95995c] //Actuarial functions 保険数理関連の関数およびデータセットのコレクション。現在のところは、損失分布、リスク理論(破滅理論を含む)、複合階層モデル及び信頼性理論。 //Collection of functions and data sets related to actuarial science applications, mostly loss distributions, risk theory (including ruin theory), simulation of compound hierarchical models and credibility theory, for the moment. **COLOR(red){acepack}: 回帰変数変換用の ace() とavas() [#o728fa2c] 回帰変数の変換法を選択する ACE 法と AVAS 法 **COLOR(red){adapt}: adapt -- 多次元数値積分 [#ecf6bbe9] 20次元関数までの適応的求積法 **COLOR(red){ade4}: 環境データの解析:環境科学における探索的・ユークリッド法 [#ia7a3a83] 多次元データ解析とグラフィカルな表示~ http://cran.md.tsukuba.ac.jp/web/packages/ade4/ade4.pdf **COLOR(red){ade4TkGUI}: ade4 Tcl/Tk グラフィカルユーザインターフェース [#wcf49018] //ade4 Tcl/Tk Graphical User Interface ade4 パッケージの数種の基本関数のための Tcl/Tk GUI //a Tcl/Tk GUI for some basic functions in the ade4 package **COLOR(red){adehabitat}: 動物の生息場所選択の解析 [#m30ae5b9] 動物の生息場所選択の解析のためのツール集。 [[adehabitat(動物の生息場所選択の解析)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){adegenet}: R adegenet パッケージ: 遺伝子マーカーの多変量解析のためのクラスおよびメソッド [#rf85dd3b] //The adegenet package for R: classes and methods for the multivariate analysis of genetic markers. 多変量フレームワーク内での遺伝子データ解析用クラスおよび関数 //Classes and functions for genetic data analysis within the multivariate framework. **COLOR(red){adimpro}: デジタル画像の適応型平滑化 [#y4afa20f] //Adaptive Smoothing of Digital Images 本パッケージは、 デジタル画像平滑化のためのPolzehl and Spokoiny (2006) によるデジタル画像の操作および伝播分離アプローチを操作するためのツールを実装している。 //This package implements tools for manipulationg digital images and the Propagation Separation approach by Polzehl and Spokoiny (2006) for smoothing digital images. **COLOR(red){ads}: 空間ポイントパターン分析 [#uf3b4f80] // Spatial point patterns analysis Ripley の K 関数から導出され1次および2次マルチスケール関数を単変量、多変量およびマークつき地図化データに対して矩形、円形および不定形ウィンドーで実行し、モンテカルロシミュレーションに基づいた統計的信頼性検定もおこなう。 //Perform first- and second-order multi-scale analyses derived from Ripley's K-function, for univariate, multivariate and marked mapped data in rectangular, circular or irregular shaped sampling windows, with test of statitical significance based on Monte Carlo simulations. [[ads(空間ポイントパターン分析)のバインディング)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){AER}: R を用いた応用計量経済学 [#m430f0a0] //Applied Econometrics with R Christian Kleiber and Achim Zeileis (2008) の書籍、Applied Econometrics with R, Springer-Verlag, New York、のための関数、データセット、例及び vignettes。 //Functions, data sets, examples and vignettes for the book Christian Kleiber and Achim Zeileis (2008), Applied Econometrics with R, Springer-Verlag, New York. **COLOR(red){agce}: 成長曲線実験の解析 [#y3b645f1] このパッケージは成長曲線実験解析用の幾つかの簡単な関数を含む。 **COLOR(red){agricolae}: 農業調査の統計手続き [#vc85ec0c] //Statistical Procedures for Agricultural Research 本パッケージの関数は International Potato Center Research (CIP)、統計および情報学のインストラクターおよび Universidad Nacional Agraria La Molina Peru の学生に、さらには "Bosques y Gestion de Recursos Forestales" (森林資源管理)の特別管理官(Specialized Master)に現在利用されている。本パッケージの機能には、農業と植物育種の野外実験に特別に適用される実験計画の統計分析が含まれている。野外実験計画:格子(Lattice)、 要素(factorial), RCBD(ランダム化完全ブロック実験計画:randomized complete block experimental design), CRD(完全にランダムな計画), ラテン方格, グレコ?(Greaco), BIB(バランス不完全ブロック:Balanced Incomplete Block), PBIB(部分バランス不完全ブロック:Partially Balanced Incomplete Block), Alpha design. 複数位置試験(multi-location trials)との比較: AMMI (biplot および triplot), 安定性(Stability). 処理間比較: LSD, Bonferroni, HSD, Waller, Kruskal, Friedman, Durbin, Van Der Waerden. リサンプリングとシミュレーション: resampling.model, simulation.model, 母子試験(Mother and baby trials)分析, 生態学: 多様性係数(Indices Biodiversity), パス解析, consensus cluster, 土壌の均一性(Uniformity Soil): Smith の係数. //These functions are currently utilized by the International Potato Center Research (CIP), the Statistics and Informatics Instructors and the Students of the Universidad Nacional Agraria La Molina Peru, and the Specialized Master in "Bosques y Gestion de Recursos Forestales" (Forest Resource Management). This package contains functionality for the statistical analysis of experimental designs applied specially for field experiments in agriculture and plant breeding. Planning of field experiments: Lattice, factorial, RCBD, CRD, Latin Square, Greaco, BIB, PBIB, Alpha design. Comparison of multi-location trials: AMMI (biplot and triplot), Stability. Comparison between treatments: LSD, Bonferroni, HSD, Waller, Kruskal, Friedman, Durbin, Van Der Waerden. Resampling and simulation: resampling.model, simulation.model, analysis Mother and baby trials, Ecology: Indices Biodiversity, path analysis, consensus cluster, Uniformity Soil: Index Smith's. **COLOR(red){AIGIS}: GIS データの空間内奏 [#w45d72d7] //Areal Interpolation for GIS data AIGIS は空間的に関連したデータを、このようなデータの欠けた対象のポリゴン上への内挿に利用できる。バージョン 1.0 のパッケージはカリフォルニア州の特定の合衆国のセンサスに対して便利な内挿を指向しているものの、提供するツールは GIS データソース及び対象ポリゴンのどんな組み合わせに対しても、適切な配慮がなされているならば、動作するはずである。将来のバージョンではより一般的なアプリケーションに役立つことを目的としていく。 //AIGIS can be used to interpolate spatially associated data onto arbitrary target polygons which lack such data. Version 1.0 of the package is oriented toward convenient interpolation of specific US census data for California, but the tools provided should work for any combination of GIS data source and target polygon, provided appropriate care is taken. Future versions will be aimed at facilitating more general applications. **COLOR(red){AIS}: データを見るツール [#ie51c304] //Tools to look at the data ("Ad Inidicia Spectata") 本パッケージはデータを検査するツールである //This provides tools to inspect data **COLOR(red){akima}: 不規則配置データの補間 [#b610e68b] 不規則配置データの線形・3次スプライン補間 [[akima(不規則間隔データの補間)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){amap}: 今一つの多次元解析用パッケージ [#l85e7088] 階層的クラスタリングと主成分分析(一般的手法と頑健手法) **COLOR(red){AMORE}: よりフレキシブルなニューラルネットワークのパッケージ [#j8f2ef6b] **COLOR(red){AnalyzeFMRI}: ANALYZE 書式の fMRI データの解析用関数 [#u296f4e7] ANALYSE 書式で保管された機能的核磁気共鳴画像(fMRI)に対する I/O、可視化、解析用関数 **COLOR(red){animation}: 統計学のデモンステレーションアニメーション [#hf579d0f] //Demonstrate Animations in Statistics 本パッケージは確率論、数理統計学、多変量統計、ノンパラトリック統計、標本調査、線形モデル、時系列、計算統計学、データマイニングおよび機械学習のような多くの分野をカバーし統計学のアニメーション用の様々な関数からなる。これらの関数は統計学およびデータ分析の教育に役立つものである。 //This package consists of various functions for animations in statistics, covering many areas such as probability theory, mathematical statistics, multivariate statistics, nonparamatric statstics, sampling survey, linear models, time series, computational statistics, data mining and machine learning. These functions might be of help in teaching statistics and data analysis. [[animation(統計学のデモンステレーションアニメーション)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){anm}: downscaling に対するアナログモデル [#h0c50ab9] このパッケージは統計・経験的 downscaling に対するアナログモデルを含む **COLOR(red){ant}: R に特化した ant のバージョン [#ra571d07] //Version of ant specific to R 2,3の R のタスクを R パッケージ内で ant の利用を容易にする ant apache ビルドツールのバージョン //Version of the ant apache build tool, with a few R specific tasks to ease use of ant within an R package **COLOR(red){ape}: 系統と進化学の解析 [#j6328412] **COLOR(red){apsrtable}: 社会科学のための apsrtable モデル出力フォーマッタ [#p149064f] //apsrtable model-output formatter for social science 標準誤差を持つ並べた複数のオブジェクトより、latex のテーブルをフォーマットする。 American Political Science Review のような雑誌の表とは異なるものである。 //Formats latex tables from one or more model objects side-by-side with standard errors below, not unlike tables found in such journals as the American Political Science Review. **COLOR(red){apTreeshape}: 系統樹の形の解析 [#m73e16f7] 統計的指標を用いて系統樹のトポロジーのシミュレートと解析を行う。ape パッケージの姉妹ライブラリ。 **COLOR(red){aqp}: 計量土壌学のためのアルゴリズム [#u788aaf2] //Algorithms for Quantitative Pedology 土壌断面データの処理作業及び作図のための R パッケージ //R package for working with and plotting soil profile data. **COLOR(red){argosfilter}: Argos 位置フィルタ [#lc114ff0] //Argos locations filter Argos 衛星より入手した動物衛星追跡データをフィルタリングする関数。海洋生物の遠隔測定法研究用に特に使用されるが、Argos 衛星の位置は大部分が低精度である。 //Functions to filters animal satellite tracking data obtained from Argos. It is especially indicated for telemetry studies of marine animals, where Argos locations are predominantly of low-quality. [[argosfilter(Argos 位置フィルタ)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){arm}: 回帰式およびマルチレベル/階層型モデルを使ったデータ解析 [#i43e6ebd] //Data Analysis Using Regression and Multilevel/Hierarchical Models lm, glm, mer および polr 出力処理用 R 関数 //R functions for processing lm, glm, mer and polr outputs. **COLOR(red){arrayMissPattern}: マイクロアレイデータの欠損パターンの探索的分析 [#u0466451] //Exploratory analysis of Missing patterns for microarray data 本パッケージはマイクロアレイデータの欠損パターンの探索用にデザインされている //This package is designed to explore missing pattern for microarray data **COLOR(red){arules}: 相関ルールおよび頻出アイテムのマイニング [#v7edac88] //Mining Association Rules and Frequent Itemsets トランザクションデータおよびパターン(頻出アイテムおよび相関ルール)の表現、操作、解析用基盤の提供。また C. Borgelt による Apriori and Eclat 相関マイニングアルゴリズム Apriori および Eclat の C 言語実装へのインタフェースも提供。 //Provides the infrastructure for representing, manipulating and analyzing transaction data and patterns (frequent itemsets and association rules). Also provides interfaces to C implementations of the association mining algorithms Apriori and Eclat by C. Borgelt. **COLOR(red){arulesSequences}: 頻出配列のマイニング [#p1f6a04c] //Mining frequent sequences 頻出シークエンスの操作およびマイニングする相関規則のためのアドオン。 Mohammed J. Zaki による cSPADE の C++ 実装用インターフェースを提供する。 //Add-on for arules to handle and mine frequent sequences. Provides interfaces to the C++ implementation of cSPADE by Mohammed J. Zaki. **COLOR(red){ash}: David Scott の ASH ルーチン [#l3249348] David Scotts の ASH ルーチン **COLOR(red){aspace}: セントログラフィ統計量を推定する関数コレクション [#v56c8813] //A collection of functions for estimating centrographic statistcs セントログラフィ統計量(例、標準距離、標準偏差楕円)の計算、ポイントの位置で取った観測点の最小凸包ポリゴン(MCP)の計算関数コレクション。ツールもセントログラフィ統計に関連する図形オブジェクトおよびMCPの ESRI シェープファイルへの変換が提供される。 //A collection of functions for computing centrographic satistics (e.g., standard distance, standard deviation ellipse), and minimum convex polygons (MCP)for observations taken at point locations. A tool is also provided for converting geometric objects associated with the centrographic statistics, and MCPs into ESRI Shapefiles. [[aspace(セントログラフィ統計量を推定する関数コレクション) パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){aster}: Aster モデル [#b528715e] **COLOR(red){asypow}: 指数を利用した漸近尤度比手法の計算 [#z5feeda2] //Calculate Power Utilizing Asymptotic Likelihood Ratio Methods 漸近尤度比手法を利用した指数および関連する量を計算する S 言語で書かれたルーチンのセット //A set of routines written in the S language that calculate power and related quantities utilizing asymptotic likelihood ratio methods. **COLOR(red){asympTest}: 漸近的統計 [#l629814d] //Asymptotic statistic 漸近的統計検定 //Asymptotic testing **COLOR(red){aylmer}: フィッシャーの正確テストの生成 [#jddbf493] //A generalization of Fisher's exact test 構造的な0(structural zero)を考慮に入れたフィッシャーの正確テストの一般化 //A generalization of Fisher's exact test that allows for structural zeros. **COLOR(red){aws}: 適応的重み平滑化 [#y20226b0] *B [#i67ed2ea] **COLOR(red){backtest}: 金融商品についてのポートフォリオベースの推測の探索 [#i91d00ff] //Exploring portfolio-based conjectures about financial instruments backtest パッケージは、金融商品(株、公債、交換、オプション等)ポートフォリオベースの推測をエクスポートする機能を提供する //The backtest package provides facilities for exploring portfolio-based conjectures about financial instruments (stocks, bonds, swaps, options, et cetera). **COLOR(red){BaM}: Jeff Gill の著書のための関数およびデータセット [#wd2ae375] //Functions and datasets for books by Jeff Gill 著書名は"Bayesian Methods: A Social and Behavioral Sciences Approach, Second Edition published by CRC Press, 2007" (ベイズ手法:社会行動科学アプローチ)。 //Books is "Bayesian Methods: A Social and Behavioral Sciences Approach, Second Edition published by CRC Press, 2007" **COLOR(red){BARD}: よりよい自動化再配分 [#se695bcb] //Better Automated ReDistricting 本パッケージは、自動化再配分および再配分をする人の選好のヒューリステックな探査のためのものである。 //This is a package for automated redistricting and heuristic exploration of redistricter revealed preference **COLOR(red){bark}: ベイズ加法回帰カーネル [#ed78877d] //Bayesian Additive Regresssion Kernels BARK: フィーチャ選択付きのベイズ加法回帰カーネル( Zhi Ouyang (2008), Ph.D. 論文, 3 章 )の実装 //Impelementation of BARK: Bayesian Additive Regression Kernels with Feature Selection, Zhi Ouyang (2008), Ph.D. thesis, chapter 3. **COLOR(red){bayesGARCH}: Student's t Innovations を用いる GARCH(1,1) Model のベイズ推定 [#l59968cc] //Bayesian Estimation of the GARCH(1,1) Model with Student's t Innovations 本パッケージは, Student's t Innovations を用いる GARCH(1,1) Model のベイズ推定を実行する bayesGARCH 関数を提供する。 //This package provides the bayesGARCH function which performs the Bayesian estimation of the GARCH(1,1) model with Student's t innovations. **COLOR(red){BayesTree}: 木に基づくモデルのベイズ手法 [#m97967ca] //Bayesian Methods for Tree Based Models Chipman, George, McCulloch (2009) の BART:ベイズ加法回帰木の実装 //Implementation of BART:Bayesian Additive Regression Trees, Chipman, George, McCulloch (2009) **COLOR(red){BAYSTAR}: 閾値の自己回帰のベイズ分析(BAYSTAR)について [#qbe9811d] //On Bayesian analysis of Threshold autoregressive model (BAYSTAR) BAYSTAR パッケージの紹介原稿。本パッケージは、自己回帰閾値モデルのベイズ推定機能を提供する。 //The manuscript introduces the BAYSTAR package, which provides the functionality for Bayesian estimation in autoregressive threshold models. **COLOR(red){BB}: 大規模非線形システムの解法と最適化 [#s37aafd3] //Solving and optimizing large-scale nonlinear systems 非線形連立方程式の解法と単純な制約による非線形目的関数の最適化のための Barzilai-Borwein スペクトル法 //Barzilai-Borwein Spectral Methods for solving nonlinear system of equations, and for optimizing nonlinear objective functions subject to simple constraints. **COLOR(red){bbmle}: 一般最尤推定ツール [#y8c569d4] //Tools for general maximum likelihood estimation R で最尤モデルのあてはめのためのメソッドおよび関数。本パッケージは stats4 パッケージの mle クラスを修正・拡張したものである。 //Methods and functions for fitting maximum likelihood models in R. This package modifies and extends the mle classes in the stats4 package. **COLOR(red){bcp}: ベイジアン変化点 [#f8fc55e0] //Bayesian Change Point Barry and Hartigan (1993) のマルコフ連鎖モンテカルロ(MCMC)を使った標準変化点問題についての積分割モデルの実装。 //An implementation of the Barry and Hartigan (1993) product partition model for the standard change point problem using Markov Chain Monte Carlo. [[bcp(ベイジアン変化点)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){Bhat}: 一般的な尤度解析 [#tc60a68a] MLE, MCMC, CIs に対する関数(オリジナルは Fortran コード) **COLOR(red){BHH2}: Box, Hunter 及び Hunter II のための有用な関数 [#f3f5e619] //Useful Functions for Box, Hunter and Hunter II Box, Hunter 及び Hunter II でのいくつかの例を再生する関数及びデータセット //Functions and data sets reproducing some examples in Box, Hunter and Hunter II **COLOR(red){biglm}:有限メモリー(bounded memory)線形および一般化線形モデル [#jede146d] 大きすぎてメモリーに合わないデータの回帰 **COLOR(red){bigmemory}: 共有メモリーの UNIX サポート付きで、C++利用の巨大マトリックスを管理 [#h1267d5f] //Manage massive matrices in R using C++, with UNIX support for shared memory C++ を使って、大規模なマトリックスを作成、蓄積、アクセスそして操作する。UNIX の下では、共有メモリーをサポートする。 //Use C++ to create, store, access, and manipulate massive matrices. Under UNIX, it also supports use of shared memory. **COLOR(red){bindata}: 人工的な二値データの生成 [#g722c765] 相関のある人工的な二値データを生成 **COLOR(red){bipartite}: 二部ネットワーク(bipartite network) の可視化といくつかの生態学係数の計算 [#i40fbaa5] //Visualises bipartite networks and calculates some ecological indices. 詳細は bipartite-package を参照 //See bipartite-package for more details. **COLOR(red){blighty}: 英国の海岸線 [#ra676325] 英国諸島の海岸線を描く関数 **COLOR(red){bio.infer}: 生物学的推定の計算 [#o540cd2d] //Compute biological inferences 底生生物のカウントデータをインポートし、データの書式を再設定し、データより環境推定を計算する。 //Imports benthic count data, reformats this data, and computes environmental inferences from this data. **COLOR(red){BiodiversityR}: 生物多様性と群集生態学分析用GUI [#l8a6d769] //GUI for biodiversity and community ecology analysis 本パッケージは、 GUI(グラフィカル・ユーザ・インターフェース)と生物多様性と生物群集(ecological communities)の統計分析用のいくつのユーティリティ関数(vegan パッケージをベースにすることがよくある)を提供する。本パッケージの分析には、種の累積曲線、多様性指数、Renyi プロファイル、種の豊富さと種の有無のGLM 分析、距離行列、Mantel 検定およびクラスター、制約形/非制約形オーディネーション(ordination)分析を含む。生物多様性および群集生態学の本は、ウェブサイトより自由にダウンローして手に入れられる。 //This package provides a GUI (Graphical User Interface, via the R-Commander) and some utility functions (often based on the vegan package) for statistical analysis of biodiversity and ecological communities, including species accumulation curves, diversity indices, Renyi profiles, GLMs for analysis of species abundance and presence-absence, distance matrices, Mantel tests, and cluster, constrained and unconstrained ordination analysis. A book on biodiversity and community ecology analysis is available for free download from the website. **COLOR(red){biOps}:画像処理と解析 [#w6e84992] //Image processing and analysis 本パッケージは画像処理と解析のいくつかの手法を含んでいる。本パッケージは幾何、算法、論理、形状(1チャンネルのみ)、ルックアップテーブル、エッジ検出(特に Roberts, Sobel, Kirsch, Marr-Hildreth and Cannyを含む)および畳み込みマスク操作(既に定義済みの共通マスクおよびユーザ定義アプリ)を提供する。Isodata および k-means 分類法も提供されている(標準、kd 木、しらみつぶし法が実装されている)。 高速フーリェ変換法フィルターも、 fftw3 がインストールされていれば利用できる。JPEG と TIFF 画像が今までにサポートされている(将来のバージョンではもっと多くの画像形式がサポートされる)、これらは libtiff および libjpeg がインストールされている必要がある。 //This package includes several methods for image processing and analysis. It provides geometric, arithmetic, logic, morphologic (supported on one channel images only), look-up tables, edge detection (including Roberts, Sobel, Kirsch, Marr-Hildreth and Canny, among others) and convolution masks operations (predefined commons masks already defined and user defined applications). Isodata and k-means classification methods are also provided (standard, kd-tree and brute force methods implemented). Fast Fourier Transform methods and filters also available if fftw3 installed. Supports jpeg and tiff images so far (more image support in future versions). libtiff and libjpeg libraries installed required. [[biOps(画像処理と解析)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){biOpsGUI}: 基本画像操作のためのGUI [#u6bbc4be] //GUI for Basic image operations 基本画像操作用GUIパッケージ(GTK+を使用)。現時点では biOps パッケージより、新しいウィンドーにオリジナルサイズを保ち、画像のピクセルの座標と値を持って情報画像データ表示機能のみ提供する。本パッケージは RGtk2 を必要とする。 //GUI (using GTK+) for the basic image operations package. At the moment, just provides a function that displays imagedata from biOps package in a new window, keeping original size and with information on the coords and values of the pixels in the image. It requires RGtk2. **COLOR(red){BLCOP}: Black-Litterman および copula-opinion プーリングフレームワーク [#f10a10d9] //Black-Litterman and copula-opinion pooling frameworks Black-Litterman および Atilio Meucci の copula-opinion プーリングフレームワークの実装。本パッケージはベータリリース。 //An implementation of the Black-Litterman Model and Atilio Meucci's copula opinion pooling framework. This should be regarded as a beta release. **COLOR(red){bnlearn}: ベイジアンネットワーク構造学習 [#nf0ef064] //Bayesian network structure learning 制約ベース(「条件付独立」としても知られる)のアルゴリズムによるベイジアンネットワーク構造学習。本パッケージは離散およびガウシアンネットワークに対して,Grow-Shrink (GS)のアルゴリズム、増分連関 (IAMB) アルゴリズム、Interleaved-IAMB (Inter-IAMB) アルゴリズムおよび Fast-IAMB (Fast-IAMB) アルゴリズムを実装している。離散ネットワークについては、シミュレーションやいくつかのスコア関数が実装されている。 //Bayesian network structure learning via constraint-based (also known as 'conditional independence') algorithms. This package implements the Grow-Shrink (GS) algorithm, the Incremental Association (IAMB) algorithm, the Interleaved-IAMB (Inter-IAMB) algorithm and the Fast-IAMB (Fast-IAMB) algorithm for both discrete and gaussian networks. Simulation and some score functions are implemented for discrete networks. **COLOR(red){Bolstad}: Bolstad の関数 [#a6372831] //Bolstad functions 書籍"Introduction to Bayesian Statistics, Bolstad, W.M. (2007), John Wiley & Sons ISBN 0-471-27020-2"のための R 関数とデータセット //A set of R functions and data sets for the book Introduction to Bayesian Statistics, Bolstad, W.M. (2007), John Wiley & Sons ISBN 0-471-27020-2 **COLOR(red){boot}: ブートストラップ用の R (S-Plus) 関数 (Canty) [#d640c417] "Bootstrap Methods and Their Applications" by A.C. Davison and D.V. Hinkley (1997, CUP) に掲載のブートストラップ用の関数とデータセット **COLOR(red){bootStepAIC}: ブートストラップ stepAIC [#i8846e07] //Bootstrap stepAIC stepAIC() 手続きのブートストラップによるモデルの選択 //Model selection by bootstrapping the stepAIC() procedure. **COLOR(red){bootstrap}: "An Introduction to the Bootstrap" 掲載の関数 [#r558101a] "An Introduction to the Bootstrap" by B. Efron and R. Tibshirani, 1993, Chapman and Hall 掲載のソフトウェア(ブートストラップ、クロスバリデーション、ジャックナイフ法)とデータ **COLOR(red){bpca}: 主成分分析ベースの多変量データのバイプロット [#uee2ffa9] //Biplot of Multivariate Data Based on Principal Components Analysis 主成分分析ベースの多変量データのバイプロット(2次元および3次元)および縮約の品質診断ツールの実装 //Implements biplot (2d and 3d) of multivariate data based on principal components analysis and diagnostic tools of the quality of the reduction. **COLOR(red){bqtl}: ベイジアン QTL マッピング用の道具集 [#ifebfe26] 近親交配と、組替えのある近親近親交配用の QTL マッピング用の道具集。最尤法とベイズ法用の道具を含む。 **COLOR(red){brew}: レポート生成用テンプレートフレームワーク [#sc5c0576] //Templating Framework for Report Generation brew はレポート生成のために、テキストと R コードを組み合わせたテンプレートフレームワークを実装している。brew のテンプレート・シンタックスは、PHP、Ruby の erb モジュール, Java Server Pages および Python の psp モジュールと同様なものである。 //brew implements a templating framework for mixing text and R code for report generation. brew template syntax is similar to PHP, Ruby's erb module, Java Server Pages, and Python's psp module. **COLOR(red){brlr}: バイアスを減らしたロジスティック回帰 [#z540075b] ロジスティック回帰モデルを最大ペナルティ付き尤度法で当てはめる **COLOR(red){BRugs}:OpenBUGS と その R インターフェース BRugs [#gbacfc2c] OpenBUGS と その R インターフェース BRugs を含んだパッケージ **COLOR(red){BSagri}: 圃場試験における安全性評価のための統計手法 [#ma8ea42b] //Statistical methods for safety assessment in agricultural field trials 安全性の評価を目的とする圃場試験評価のための関数、データセットおよびコードの例のコレクション //Collection of functions, data sets and code examples for evaluations of field trials with the objective of safety assessment. **COLOR(red){bspec}: ベイジアン・スペクトル推定 [#gb507426] //Bayesian spectral inference 時系列のパワースペクトルにおけるベイズ推定 //Bayesian inference on the (discrete) power spectrum of time series. *C [#g1d61c9f] **COLOR(red){CADStat}: 因果関係評価に有益ないくつかの統計手法についての GUI を提供する [#n6204b0a] //Provides a GUI to several statistical methods useful for causal assessment JGR を利用して、いくつかの統計手法のための GUI を提供する。提供する手法は散布図、箱ヒゲ図、線形回帰、一般化回帰、四分位、回帰、条件付確率計算および回帰木である。 //Using JGR, provides a GUI to several statistical methods - scatterplot, boxplot, linear regression, generalized linear regression, quantile, regression, conditional probability calculations, and regression trees. **COLOR(red){calibrate}: バイプロットの軸の目盛り [#af6391f7] //Calibration of Biplot Axes 散布図やバイプロット上の(非直交)変数ベクトル上のチックマークの入った目盛りつきスケールの描画パッケージ //Package for drawing calibrated scales with tick marks on (non-orthogonal) variable vectors in scatterplots and biplots. **COLOR(red){car}: Companion to Applied Regression [#i393a084] J. Fox, An R and S-PLUS Companion to Applied Regression, Sage, 2002, のコンパニオンパッケージ。主に、応用回帰、線形モデル、一般化線形モデル用の関数を含む。回帰診断、特にグラフィカルな診断に重点をおく。また幾つかの道具関数がある。幾つかの例外を除き、R の基本的関数や広く使われているパッケージと内容が重複しないように努めた。car 中の幾つかの関数は MASS パッケージ中の関数を、もしそれがあれば、使う。subset 関数は leap パッケージ中の regset 関数がつくり出すオブジェクトをグラフ化する。car 中の関数は、もし必要なら、オプション na.action = na.omit や na.exclude と両立する。 [[car(応用回帰必携)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){caret}: 分類および回帰トレーニング [#ee26fe93] //Classification and Regression Training 分類および回帰モデルのトレーニングおよび作図用各種関数 //Misc functions for training and plotting classification and regression models **COLOR(red){caretNWS}: NetworkSpaces を使って並列化した分類と回帰トレーニング [#pf344db0] //Classification and Regression Training in Parallel Using NetworkSpaces 並列処理を用いることで指数関数のいくつかが強化される //Augment some caret functions using parallel processing **COLOR(red){cba}: ビジネス分析論用クラスタリング [#l566c0a7] //Clustering for Business Analytics Proximus and Rock のようなクラスタリングテクニック、横断距離(cross distance)の効率的な計算ユーティリティ関数およびデータ操作の実装 //Implements clustering techniques such as Proximus and Rock, utility functions for efficient computation of cross distances and data manipulation. **COLOR(red){ccgarch}: 条件付相関 GARCH モデル [#pf7c19c7] //Conditional Correlation GARCH models GARCH モデル族の推定およびシミュレーションのための関数 //Functions for estimating and simulating the family of the CC-GARCH models. **COLOR(red){CDNmoney}: カナダ通貨及び信用集計量の要素 [#bb734b71] //Components of Canadian Monetary and Credit Aggregates 連続性を調整されたカナダ通貨及び信用集計量の要素 //Components of Canadian Credit Aggregates and Monetary Aggregates with continuity adjustments. **COLOR(red){CellularAutomaton}: 1次元セルオートマトン [#g527a602] //One-Dimensional Cellular Automata 本パッケージジは1次元セルオートマトンのオブジェクト指向実装。本パッケージは基本ルール、ユーザ定義ルール、半径、ユーザ定義の seeding、および作図を含むMathematicaの提供する多くの機能をサポートする、 //This package is an object-oriented implementation of one-dimensional cellular automata. It supports many of the features offered by Mathematica, including elementary rules, user-defined rules, radii, user-defined seeding, and plotting. **COLOR(red){cfa}: configuration frequencies (CFA) の解析 [#b971d8b9] configuration frequencies (単一、そして繰返し測定) と、階層的・ブートストラップ-CFA の解析などとプロット。 **COLOR(red){cggd}: 連続一般化勾配法 [#zb59e6f5] //Continuous Generalized Gradient Descent 異なるモデルタイプについてほとんどの回帰シーケンスをあてはめるための効率的な手続き //Efficient procedures for fitting an entire regression sequences with different model types. **COLOR(red){CGIwithR}: R における CGI プログラミング [#dbf4c724] R を使って CGI スクリプトを書く機能 **COLOR(red){cheb}: 離散線形チェビシェフ近似 [#c0ac78eb] //Discrete Linear Chebyshev Approximation 離散線形チェビシェフ近似 //Discrete Linear Chebyshev Approximation **COLOR(red){CITAN}: 引用分析ツールパック [#wd07abb7] //CITation ANalysis toolpack CITAN は、科学計量学における計量研究に有用な(この領域に限定されない)関数ライブラリー。このライブラリーは、Pareto-type II 分布を取り扱うさまざまな手法も含む。 //CITAN is a library of functions useful in - but not limited to - quantitative research in the field of scientometrics. It also contains various methods for dealing with the Pareto-type II distribution. **COLOR(red){CircStats}: 角度データの統計 [#a1b80aaa] "Topics in circular Statistics" (2001) S. Rao Jammalamadaka and A. SenGupta, World Scientific, 中の角度(方向)データの統計 **COLOR(red){classGraph}: S4 クラス階層の構築 [#xe8ca504] //Construct Graphs of S4 Class Hierarchies S4 クラス階層の有向グラフの構築及び可視化。一般的に、これらのグラフは通常 DAG(有向非巡回グラフ)で、実際には簡単な木構造になることがよくある。 //Construct directed graphs of S4 class hierarchies and visualize them. In general, these graphs typically are DAGs (directed acyclic graphs), often simple trees in practice. **COLOR(red){classInt}: 単変量階級の選択 [#rf887676] 地図またはグラフィックス用単変量階級の選択パッケージ [[classInt(単変量階級間隔の選択)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){clim.pact}: 気象解析と月別・日別データの downscaling 用パッケージ [#i7282c1e] このパッケージはデータの取得、気象データの解析、大局的気象シナリオの月別平均、日別平均の downscale を行なう R 関数を含む。 **COLOR(red){clv}: クラスター検証テクニック [#j126048d] //Cluster Validation Techniques このパッケージは cluster パッケージからの関数による出力のほとんど利用に用意された内部および外部クラスター検証手法のほとんどを含む。また,パッケージは "cluster" パッケージに実装されているアルゴリズムに適用されているクラスタ安定化アプローチのために使用される関数と例も含んでいる。 //Package contains most of the popular internal and external cluster validation methods ready to use for the most of the outputs produced by functions coming from package "cluster". Package contains also functions and examples of usage for cluster stability approach applied to algorithms implemented in "cluster" package. **COLOR(red){clValid}: クラスター結果の検証 [#qa41d3ba] //Validation of Clustering Results クラスター結果の統計的・生物学的検証 //Statistical and biological validation of clustering results. **COLOR(red){clue}: クラスター・アンサンブル [#v1e9980f] //Cluster ensembles クラスター・アンサンブル //CLUster Ensembles **COLOR(red){cluster}: クラスタリング用の関数 (Rousseeuw et al. による) [#rd1770e7] クラスタリング用の関数、もとは Peter Rousseeuw, Anja Struyf そして Mia Hubert による **COLOR(red){clusterfly}: R および GGobi を使ったクラスタリングの対話型探索 [#iba94119] //Explore clustering interactively using R and GGobi 詳細は http://had.co.nz/reshape を参照 //See http://had.co.nz/reshape for more information. **COLOR(red){clusterGeneration}: ランダムクラスタの生成 [#reca327d] //random cluster generation (with specified degree of separation) 本パッケージはランダムなクラスタ生成、ランダムな共分散/相関行列の生成、クラスタのペアまたはクラスタ分布の分離インデックス(データおよび母集団バージョン)の計算、1次元および2次元の射影プロットをしてクラスタの可視化をおこなう関数を含んでいる。本パッケージはまた分離度、クラスター数、変数の数、雑音変数のような因子を使う要因計画に基づくランダムなクラスタの生成関数を含む。 //The package contains functions for generating random clusters, generating random covariance/correlation matrices, calculating a separation index (data and population version) for pairs of clusters or cluster distributions, and 1-D and 2-D projection plots to visualize clusters. The package also contains a function to generate random clusters based on factorial designs with factors such as degree of separation, number of clusters, number of variables, number of noisy variables. **COLOR(red){clusterRepro}: 遺伝子発現のクラスターの再現性 [#k0e9ffc1] //Reproducibility of gene expression clusters 再現性によるマイクロアレイクラスターの検証関数 //A function for validating microarry clusters via reproducibility **COLOR(red){cmm}: カテゴリカル周辺モデル [#e0b0690c] //Categorical Marginal Models カテゴリカルデータのための推定用の非常に広範なパッケージ //Quite extensive package for the estimation of marginal models for categorical data. **COLOR(red){cmprsk}: 競合リスクの半分布関数の解析 [#t1244d0d] 競合リスクの半分布関数の推定、検定と回帰モデリング。参考文献、Gray (1988), A class of K-sample tests for comparing the cumulative incidence of a competing risk, Ann. Stat. 16:1141-1154, そして Fine JP and Gray RJ (1999), A proportional hazards model for the subdistribution of a competing risk, JASA, 94:496-509. **COLOR(red){cobs}: COBS -- 拘束条件付きの B-スプライン [#l3c51dc1] 線形計画法を用いた定性的拘束条件を持つ(回帰)平滑化 **COLOR(red){CoCoAn}: 拘束条件付き対応解析 [#f5c4d3dc] 対応解析と拘束条件付き対応解析を計算し、関連するグラフィック表示をする二つの関数 **COLOR(red){coda}: MCMC用の出力解析と診断 [#v9f31b27] マルコフチェインモンテカルロシミュレーション用の出力解析と診断 [[coda(マルコフ連鎖モンテカルロ(MCMC)シミュレーションについての出力の分析および診断)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){codetools}: R 用コード分析ツール [#yee95932] //Code Analysis Tools for R R 用コード分析ツール //Code analysis tools for R **COLOR(red){combinat}: 組合せ論用の道具 [#q53952db] 組合せ論用ルーティン **COLOR(red){compare}: オブジェクトを比較して差分をとる [#e5e09742] //Comparing Objects for Differences ベクトルとデータフレームを比較する関数 //Functions for comparing vectors and data frames. [[compare(オブジェクトを比較して差分をとる)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){compoisson}: Conway-Maxwell-Poisson 分布 [#n356254f] //Conway-Maxwell-Poisson Distribution Conway-Maxwell-Poisson 分布の密度およびモーメントのためのルーチンおよびモデルを COM-Poisson モデルにあてはめる関数を提供する。 //Provides routines for density and moments of the Conway-Maxwell-Poisson distribution as well as functions for fitting the COM-Poisson model for over/under-dispersed count data. **COLOR(red){colorspace}: 色空間操作 [#g76f4555] //Colorspace Manipulation 分類された色空間の間のマッピング操作 //Carries out mapping between assorted color spaces. **COLOR(red){conf.design}: ファクトリアルデザインを作る [#h668cae7] **COLOR(red){convexHaz}: 凸ハザード(convex hazard)のノンパラメトリック MLE/LSE [#qca2fc91] //Nonparametric MLE/LSE of convex hazard 本パッケージは凸ハザード関数のノンパラメトリックな最尤推定値 (MLE) およびノンパラメトリック最小二乗推定値 (LSE) 関数を含む。凸ハザード関数はデータが IID であると仮定している。 //This package contains functions to compute the nonparametric maximum likelihood estimator (MLE) and the nonparametric least squares estimator (LSE) of a convex hazard function, assuming that the data is IID. **COLOR(red){copas}: メタアナリシスのためのモデル化と修正のための統計手法 [#f87e2f3b] //Statistical methods to model and adjust for bias in meta-analysis Copas 選択モデル。 //Copas selection model. **COLOR(red){corcounts}: 相関のあるカウントランダム変数 [#m69a2531] //Generate correlated count random variables 事前に指定されたピアソン相関をもつ高次元の相関のあるカウントランダム変数を生成する。 //Generate high-dimensional correlated count random variables with a prespecified Pearson correlation. **COLOR(red){corrgram}: コレログラムの作図 [#h99dcece] // Plot a correlogram 変数の相関計算と結果をグラフィックに表示。 //Calculates correlation of variables and displays the results graphically. **COLOR(red){countrycode}: 国名と符号化スキームの変換 [#rcc7a6d7] //Converts country names and coding schemes 国名の標準化、これらを7つの符号化スキームの1つに変換して、地域記述子を当てはめる //Standardizes country names, converts them into one of seven coding schemes, and assigns region descriptors **COLOR(red){coxphw}: 重み付きコックス回帰 [#k7f16239] //Weighted Cox regression コックス回帰の重み付き推定 //Weighted estimation for Cox regression **COLOR(red){CPE}: 生存分析の一致確率(concordance probability)推定 [#hd120ade] //Concordance probability estimates in survival analysis 生存分析の一致確率(concordance probability)推定関数 //Functions to calculate concordance probability estimates in survival analysis **COLOR(red){CPGchron}: 放射年代の深さを作成 [#f59a51c2] //Create radiocarbon-dated depth chronologies 本パッケージは Parnell and Haslett (2007, JRSSC に提出; 印刷前に著者と連) の著作に従うものである。本パッケージは放射年代が付けられた堆積コアの MCMC、予測および作図を実行する。 //This package follows the work of Parnell and Haslett (2007, submitted to JRSSC; contact the author for a pre-print). It runs MCMC, predictions and plots for radiocarbon-dated sediment cores. **COLOR(red){cramer}: 多変量ノンパラメトリッククラメール検定 [#b5fdb708] 多変量ノンパラメトリッククラメール検定用の R ルーティンを提供する **COLOR(red){crantastic}: http://crantastic.org/ のための雑多な R ツール [#vb122710] //Various R tools for http://crantastic.org/ http://crantastic.org/ のための雑多な R ツール //Various R tools for http://crantastic.org/ **COLOR(red){cshapes}: CShapes データセット及びユーティリティー [#ea063808] //CShapes Dataset and Utilities CShapes データセット、国境界(1946-2008)の GIS データセット。データ抽出及びウェイトマトリックス計算のための関数を含む。 //Package for CShapes, a GIS dataset of country boundaries (1946-2008). Includes functions for data extraction and the computation of weights matrices. [[cshapes(CShapes データセット及びユーティリティー)パッケージ中のオブジェクト一覧]] *D [#wb6b788a] **COLOR(red){DAAG} DAAG データ分析とグラフィックス [#k28974e1] Maindonald, J.H. and Braun, W.J. (2003) "Data Analysis and Graphics Using R" の本の中の例と演習で使用されている種々のデータセット. **COLOR(red){DAAGxtras}: データセット及び関数、 DAAG の補遺 [#o5c8ce9d] Data Sets and Functions, supplementary to DAAG 書籍 Maindonald, J.H. and Braun, W.J. (2nd edn 2007) "Data Analysis and Graphics Using R", と データマイニングコース向けの追加例題で使用するさまざまなデータ。本パッケージのバージョン 0.7-6 にあった多くのデータセットが、DAAG パッケージに移動されたので注意されたい。 //various data sets used in additional exercises for the book Maindonald, J.H. and Braun, W.J. (2nd edn 2007) "Data Analysis and Graphics Using R", and for a 'Data Mining' course. Note that a number of datasets that were in version 0.7-6 of this package have been transferred to the DAAG package. **COLOR(red){data.table}(データフレームの拡張。i および j の式、キーおよびバイナ [#b758f1ec] [[data.table(データフレームの拡張。i および j の式、キーおよびバイナリー探索)パッケージ中のオブジェクト中の一覧]] **COLOR(red){dataframes2xls}: dataframes2xls はデータフレームを XLS ファイルに書き込む [#oca30861] //dataframes2xls writes data frames to xls files dataframes2xls はデータフレームを XLS ファイルに書き込む。複数のシートや基本的な書式もサポート。 //dataframes2xls writes data frames to xls files. It supports multiple sheets and basic formatting. [[dataframes2xls パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){Davies}: Davies クォンタイル関数 [#t6830bd2] Davies クォンタイル関数と一般化ラムダ分布用の有用な関数 **COLOR(red){DBI}: R/S-Plus とデータベースへのインタフェイス [#i60994fb] R/S-plus と関係データベース管理システム間の橋渡しをするデータベースインタフェイス(DBI)。このパッケージ中のすべてのクラスは仮想的で、様々な R/DBMS の実装により拡張される必要がある。 **COLOR(red){dblcens}: 二重センサーデータから分布の NPMLE(ノンパラメトリック最尤推定量?)を求める [#xf54f798] 経験分布関数、そして二つのセンサー分布の NPMLE (ノンパラメトリック最尤推定量?) を EM アルゴリズムで求める。データは二重にセンサリングされていても良い。制約条件を科すこともでき、制約付き NPMLE と -2log (尤度比) を与える。これは、経験尤度比定理を用いて、F(K) に対する仮説検定と、信頼区間を求めることを可能にする。influence 関数も計算できる(が遅い)。 **COLOR(red){DCluster}: 疾病の空間クラスター検出関数群 [#bf535f9d] カウントデータを用いた疾病の空間クラスター検出関数セット。統計量の標本分布にはブートストラップを使用している。 [[DCluster(疾病の空間クラスター検出用関数)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){ddesolve}: 遅延微分方程式ソルバー [#rf14e2dd] //Solver for Delay Differential Equations 本パッケージは遅延微分方程式系の解を与える。Benjamin J. Cairns と分担して、 Simon N. Wood によって作成された数値ルーチンのインターフェースを持つ。これらの数値ルーチンは、Simon Wood の solv95 に最初にあったものである。 //This package solves systems of delay differential equations. by interfacing numerical routines written by Simon N. Wood , with contributions by Benjamin J. Cairns . These numerical routines first appeared in Simon Wood's solv95 program. **COLOR(red){DEA}: データ包絡分析 [#m8db6b7e] //Data Envelopment Analysis 包絡分析法の基本的なモデルの実行。乗数および包絡量の形式に対応。 //Performs some basic models of Data Envelopment Analysis, both in multiplier and envelopment form. **COLOR(red){deal}: 混合変数を持つベイジアンネットワークの学習 [#ldae50ad] 連続/離散変数を持つベイジアンネットワークの学習と、データからの比較ができる。 **COLOR(red){debug}: R 用 MVB のデバッガ [#k7550c33] //MVB's debugger for R R 関数用デバッガ。コード表示、適切なエラー復帰、ライン番号での条件付きブレークポイント、終了コードへのアクセス、フロー制御およびフルキーボード入力 //Debugger for R functions, with code display, graceful error recovery, line-numbered conditional breakpoints, access to exit code, flow control, and full keyboard input. **COLOR(red){DeducerSpatial}: 空間データ分析用 Deducer [#n8bad109] //Deducer for spatial data analysis 空間データ分析用 Deducer プラグイン。Open Street Map と Bing Map の衛星画像の表示能力を含む。 //A Deducer plug-in for spatial data analysis. Includes The ability to plot and explore open street map and Bing satellite images. **COLOR(red){Defaults}: デフォルトのグローバル関数の作成 [#s69fa2e1] //Create Global Function Defaults デフォルトのグローバル関数の設定・取得・インポート //Set, get, and import global function defaults **COLOR(red){deldir}: ドロネイ三角化とディリクレ (ボロノイ) 分割 [#y02f40fe] 平面の点集合から、ドロネイ三角化とディリクレ・ボロノイ)分割を計算する。 [[deldir(ドロネイ三角形網およびディリクレ(ボロノイ)分割)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){delt}: 適応ヒストグラムを用いた多変量密度の推定 [#e810d3c4] //Estimation of multivariate densities with adaptive histograms 本パッケージは次の多変量密度の推定手法を実装している。適応ヒストグラム(欲張りヒストグラム および CART ヒストグラム)、段階的最小化およびブートストラップの集約が本パッケージに含まれている。 //The package implements methods for estimating multivariate densities: adaptive histograms (s and CART-histograms), stagewise minimization, and bootstrap aggregation are included in the package. **COLOR(red){depmix}: 従属混合モデル [#f85e3240] //Dependent Mixture Models カテゴリおよび連続(時系列)組み合わせデータに潜在マルコフ(マルチグループ)混合モデルのあてはめ //Fit (multigroup) mixtures of latent Markov models on mixed categorical and continuous (timeseries) data **COLOR(red){descr}: 記述統計 [#b0100e46] //Descriptive statistics 本パッケージは重み付けカテゴリカル変量を記述する関数とオブジェクトの文字符号化変換を容易にする関数を含んでいる。 //This package contains functions to describe weighted categorical variables and functions to facilitate the character encoding conversion of objects. **COLOR(red){DescribeDisplay}: DescribeDisplay (GGobi プラグイン)の R インターフェース [#gee8078b] //R interface to DescribeDisplay (GGobi plugin) GGobi の表示プラグインの出力より印刷品質のグラフィックスを生成する //Produce publication quality graphics from output of GGobi's describe display plugin **COLOR(red){Devore5}: Devore の "Prob and Stat for Eng (5th ed)" 中のデータセット [#mcf5a031] Jay L. Devore (2000), "Probability and Statistics for Engineering and the Sciences (5th ed)", Duxbury, 中のデータセットと見本解析 **COLOR(red){Devore7}: Devore の"Prob and Stat for Eng (7th ed)"のデータセット [#z826efb6] //Data sets from Devore's "Prob and Stat for Eng (7th ed)" Jay L. Devore (2008) の"Probability and Statistics for Engineering and the Sciences (7th ed)", Thomson のデータセットおよびサンプル分析 //Data sets and sample analyses from Jay L. Devore (2008), "Probability and Statistics for Engineering and the Sciences (7th ed)", Thomson. **COLOR(red){devtools}: R コード開発簡易化ツール [#cba2ce1f] //Tools to make developing R code easier パッケージ開発ツールコレクション //Collection of package development tools **COLOR(red){dglm}: 二重一般化線形モデル [#j99379bd] //Double generalized linear models 二重一般化線形モデルのあてはめ //Fitting double generalized linear models **COLOR(red){diamonds}: ダイアモンド分割の解析と標本格子 [#pdcc91cd] Analysis and sampling grids from diamond partitions 格子からのサンプリングと解析のための、平面もしくは正4・12面体上の aperture-4 ダイアモンド分割を解説する関数 **COLOR(red){dichromat}: 二色型色覚者用のカラースキーム [#i7de4d52] 色盲効果をシミュレーションするため赤・緑の差異を縮小する **COLOR(red){DierckxSpline}: "Curve and Surface Fitting with Splines" の R 必携 [#xcb0fdf3] //R companion to "Curve and Surface Fitting with Splines" 本パッケージは Paul Dierckx の書いた FITPACK のルーチンのラッパーを提供する。オリジナルの Fortran は http://www.netlib.org/dierckx より入手できる。 //This package provides a wrapper to the FITPACK routines written by Paul Dierckx. The original Fortran is available from http://www.netlib.org/dierckx **COLOR(red){dirichlet}: マーケティングのための消費者購買行動 Dirichlet モデル [#v3945885] //Dirichlet model of consumer buying behavior for marketing research Dirichlet (別名 NBD-Dirichlet) モデルは消費財の購買生起および銘柄選択を記述する。モデルを推定する。モデル推定をおこない、マーケティングリサーチャの関心のあるさまざまな理論的な量を要約する。また、観測および理論統計量を比較するテーブル作成用関数を提供する。 //The Dirichlet (aka NB **COLOR(red){diseasemapping}: 人口及び事例データより SMR(標準化死亡比)の計算 [#s8aa0082] //Calculate SMR's from population and case data 通常のデータセット及びシェープファイルを使って動作 //works with regular data set file and shape file. [[diseasemapping(人口及び事例データより SMR(標準化死亡比)の計算)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){dismo}: 種の分布モデリング [#lde853df] //Species distribution modeling 種の分布モデリングのための関数。すなわち、特定箇所における全体の地理的分布形の発生を予測する。 //Functions for species distribution modeling, that is, predicting entire geographic distributions form occurences at specific sites. **COLOR(red){dispmod}: 逸脱度モデル [#wfde36e1] GLIM における逸脱度をモデル化する関数 **COLOR(red){distrMod}: 確率モデルのオブジェクト指向実装 [#c797f791] //Object orientated implementation of probability models パッケージベースの確率モデルのオブジェクト指向実装 //Object orientated implementation of probability models based on packages 'distr' and 'distrEx' **COLOR(red){divagis}: 地理参照された(位置情報つきの)植物種取得の品質チェックのためのツールを提供する [#we086d2c] //Provides tools for quality checks of georeferenced plant species accessions divagis: 地理参照された(位置情報つきの)植物種取得の品質チェックのためのツールを提供する //Provides tools for quality checks of georeferenced plant species accessions. [[divagis(地理参照された(位置情報つきの)植物種取得の品質チェックのためのツール)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){dlm}: 動的線形モデルのベイズおよび尤度分析 [#k6db7a77] //Bayesian and Likelihood Analysis of Dynamic Linear Models 正規線形状態空間モデル、動的線形モデルとして知られているものだが、の最尤法、カルマンフィルタリングおよび平滑化およびベイズ分析 //Maximum likelihood, Kalman filtering and smoothing, and Bayesian analysis of Normal linear State Space models, also known as Dynamic Linear Models **COLOR(red){dplR}: R の年代年輪学プログラムライブラリー [#lead7871] //Dendrochronology Program Library in R 本パッケージはいくつかの標準的な木の年輪分析を実行する関数を含む。 //This package contains functions for performing some standard tree-ring analyses. **COLOR(red){dr}: 回帰における次元縮小法 [#qa3426d1] **COLOR(red){dse}: 多変量時系列解析ライブラリ [#c2457653] 各パッケージには doc/*-guide.pdf そして 'http://www.bank-banque-canada.ca/pgilbert ' から得られるユーザーガイドがある。パッケージ dse1 は基本システムで、多変量 ARMA と状態空間モデルを含む。 パッケージ dse2 は推定方法の吟味、予測、予測方法の吟味のための拡張を含む。 パッケージ tframe は時系列に関するプログランミングのためのカーネル法である。 パッケージ setRNG は S と R で同じ乱数を生成する機構を含む。関連バンドル dseplus も参照。setRNG, tframe, dse1, dse2 を含むバンドル **COLOR(red){DSpat}: 距離サンプリングデータの空間モデリング [#p6f7d1d4] //Spatial modelling for distance sampling data 標本データの(個体群調査) 線状法空間モデルのあてはめ、および領域内の繁栄状態を推定する関数を提供する。 //Provides functions for fitting spatial models to line transect sampling data and to estimate abundance within a region. **COLOR(red){dtt}: 離散三角関数変換 [#t6fb62ef] //Discrete Trigonometric Transforms 本パッケージは1次元及び2次元の離散コサイン変換(DCT)、離散サイン変換 (DST) 及び離散 Hartley 変換用の関数を提供する。 //This package provides functions for 1D and 2D Discrete Cosine Transform (DCT), Discrete Sine Transform (DST) and Discrete Hartley Transform (DHT). [[dtt(離散三角関数変換)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){DMwR}: "Data Mining with R" のための関数とデータ [#p8c0ea63] //Functions and data for "Data Mining with R" 本パッケージは、Luis Torgo, CRC Press 2010 の"Data Mining with R" 添付の関数とデータを含む //This package includes functions and data accompanying the book "Data Mining with R, learning with case studies" by Luis Torgo, CRC Press 2010. **COLOR(red){dynamicGraph}: dynamicGraph [#f22aeb1c] グラフ操作用対話型グラフィックツール [[dynamicGraph(グラフ操作用対話型グラフィカルツール)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){dynlm}: 動的線形回帰 [#n6743242] //Dynamic Linear Regression 動的線形回帰および時系列回帰 //Dynamic linear models and time series regression. *E [#v2fbe62b] **COLOR(red){e1071}: TU Wien の統計学科(e1071)提供の雑多な関数 [#b4208950] 潜在的クラス解析用関数、短期間のフーリエ変換、ファジークラスタリング、サポートベクターマシン、bagged クラスタリング、等 [[e1071 (ウィーン工科大 統計学科の雑多な関数)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){earth}: Earth: 多変量適応型回帰スプラインモデル [#b2e0ee32] //Earth: Multivariate Adaptive Regression Spline Models Friedman の論文 "Fast MARS" および "Multivariate Adaptive Regression Splines" のテクニックを使った回帰モデルを構築する。("MARS" という用語は著作権があり、そのためパッケージ名には使用されない.) //Build regression models using the techniques in Friedman's papers "Fast MARS" and "Multivariate Adaptive Regression Splines". (The term "MARS" is copyrighted and thus not used as the name of the package.) **COLOR(red){Ecdat}: 計量経済学用データセット [#df7bbe00] 計量経済学用データセット **COLOR(red){ecespa}: 空間ポイントパターン分析のための関数 [#ua65886f] //Functions for spatial point pattern analysis 空間ポイントパターン分析(重に spatstat ベース)のためのいくつかのラッパー、関数およびデータセット。書籍 "Introduccion al Analisis Espacial de Datos en Ecologia y Ciencias Ambientales: Metodos y Aplicacionesで使用。 //Some wrappers, functions and data sets for for spatial point pattern analysis (mainly based on spatstat), used in the book "Introduccion al Analisis Espacial de Datos en Ecologia y Ciencias Ambientales: Metodos y Aplicaciones". **COLOR(red){ecodist}: 生態学分析のための非類似度ベースの関数 [#x04863ab] //Dissimilarity-based functions for ecological analysis 生態学分析のための非類似度ベースの関数。空間およびコミュニティのデータでの利用を考えたオーディネーションおよび Mantel 検定の関数を含む。 //Dissimilarity-based analysis functions including ordination and Mantel test functions, intended for use with spatial and community data. ク **COLOR(red){EDR}: 効果的な次元縮約 (EDR) 空間 [#c37a0a79] //Estimation of the effective dimension reduction (EDR) space 本ライブラリは多重インデックス回帰モデルの効果的な次元縮約空間を推定する R 関数を含んでいる。 //The library contains R-functions to estimate the effective dimension reduction space in multi-index regression models. **COLOR(red){effects}: 線形回帰、一般化線形モデルに対する効果の表示 [#p6cac716] 線形回帰、一般化線形モデルに対する効果、例えば交互作用、のグラフィカルと表による表示 **COLOR(red){eha}: 事象履歴解析(イベントヒストリー分析) [#nff43706] 生存解析、事象履歴解析用のパッケージ [[eha(イベントヒストリー分析)パッケージ中のオブジェクト一覧]] **COLOR(red){eiPack}: 生態学推定および高次元データ管理 [#s23c8d45] //Ecological Inference and Higher-Dimension Data Management 極端な事例の分析、生態学回帰、および多項ディリクレ生態学推定モデルを使った R x C 生態学分割表のための手法を提供する。高次元のデータオブジェクトを操作するツールも提供する。 //Provides methods for analyzing RxC ecological contingency tables using the extreme case analysis, ecological regression, and Multinomial-Dirichlet ecological inference models. Also provides tools for manipulating higher-dimension data objects. **COLOR(red){ellipse}: 楕円と楕円状の信頼領域を描く関数 [#t4e5ed6e] このパッケージは、様々な楕円と楕円状の信頼領域を描く関数を含む。次の本に紹介されているプロットを実装している:Murdoch and Chow (1996), A graphical display of large correlation matrices, The American Statistician 50, 178-180. また Bates and Watts (1988), Nonlinear Regression Analysis and its Applications にあるプロファイルプロットを実装している。 **COLOR(red){EMC}: 進化モンテカルロ(EMC)アルゴリズム [#c027b053] //Evolutionary Monte Carlo algorithm ランダム・ウォーク・メトロポリス(Random walk Metropolis)、Metropolis Hasting、擬似焼き戻し法 (Simulated Tempering) 、temperature ladder construction and placement //Random walk Metropolis, Metropolis Hasting, parallel tempering, evolutionary Monte Carlo, temperature ladder construction and placement **COLOR(red){emdbook}: 生態学モデルとデータ(本のサポート) [#d250ed01] //Ecological models and data (book support) 生態学者のための最尤推定とそれに関連するトピックを提示する Ecological Models and Data(Princeton University Pressで出版準備中) のための補助関数およびデータセット //Auxiliary functions and data sets for _Ecological Models and Data_, a book presenting maximum likelihood estimation and related topics for ecologists (in preparation for Princeton University Press) **COLOR(red){emme2}: EMME/2 databank への入出力 [#k3e5f193] このパッケージは EMME/2 databank への入出力用の関数を含む。 **COLOR(red){emplik}: センサー・打ち切りデータに対する経験尤度比 [#ud84c2c2] センサー・打ち切りを含むデータの平均、クォンタイル、ハザードに対する経験尤度比検定 **COLOR(red){ensembleBMA}: アンサンブルおよびベイズモデル平均化を使った確率的予測 [#c13e060e] //Probabilistic Forecasting using Ensembles and Bayesian Model Averaging アンサブル予測および気象観測より確率的予測を作成するベイズモデル平均化 //Bayesian Model Averaging to create probabilistic forecasts from ensemble forecasts and weather observations. **COLOR(red){emoa}: 進化多目的最適化アルゴリズム [#qbfcc166] //Evolutionary Multiobjective Optimization Algorithms 進化多目的最適化アルゴリズムのデザインと分析のための構成要素のコレクション //Collection of building blocks for the design and analysis of evolutionary multiobjective optimization algorithms. **COLOR(red){EMV}: データ行列に対する欠損値の推定 [#z6a5b508] k-近接近傍アルゴリズムによるデータ行列中の欠損値の推定 **COLOR(red){epicalc}: 疫学計算機 [#z8f53351] //Epidemiological calculator 疫学計算を簡単にする R の関数 //Functions making R easy for epidemiological calculation. **COLOR(red){epiR}: 疾病データ分析用関数 [#j5dd2fc4] //Functions for analysing epidemiological data 疾病データ分析用パッケージ。疾患頻度の測度の直接間接の調整、分割表であらわされた計数データの単層または多層を基にした関連ための関連測度の定量化、罹患リスクおよび罹患率の推定まわりの信頼区間計算ための関数を含む。メタアナリシス、診断テスト解釈および標本サイズの計算のための雑多な関数。 //A package for analysing epidemiological data. Contains functions for directly and indirectly adjusting measures of disease frequency, quantifying measures of association on the basis of single or multiple strata of count data presented in a contingency table, and computing confidence intervals around incidence risk and incidence rate estimates. Miscellaneous functions for use in meta-analysis, diagnostic test interpretation, and sample size calculations. **COLOR(red){epitools}: 疫学ツール [#i2ad6028] //Epidemiology Tools EpiTools: 疫学データ及びグラフィックスのための R パッケージ //EpiTools: R Package for Epidemiologic Data and Graphics **COLOR(red){ergm}: ネットワークの指数族モデルのあてはめ、シミュレーションおよび診断 [#n63e64f7] //Fit, Simulate and Diagnose Exponential-Family Models for Networks 指数族ランダム・グラフモデル (ERGM) に基づくネットワークの分析およびシミュレーションのための統合ツールセット。 "ergm"はネットワーク分析用パッケージスイート "statnet" の一部である。関数リストを見るには、 help(package='ergm') とタイプすればよい。 //An integrated set of tools to analyze and simulate networks based on exponential-family random graph models (ERGM). "ergm" is a part of the "statnet" suite of packages for network analysis. For a list of functions type: help(package='ergm') **COLOR(red){eRm}: 拡張ラッシュモデリング [#n953923f] //Extended Rasch Modeling. eRm ラッシュモデル (RM), 線形ロジスティック検定モデル (LLTM), 評定尺度モデル (RSM), 線形評定尺度モデル (LRSM), 部分採点モデル(PCM:Partial Credit Model),および線形部分採点モデル(LPCM:linear partial credit models)へのあてはめをおこなう.データマトリックスで欠損値は扱える。個人パラメータ、LR-Model テスト、項目指定 Wald テスト、itemfit and personfit statistics、各種 ICC プロットの推定が追加されている。 //eRm fits Rasch models (RM), linear logistic test models (LLTM), rating scale model (RSM), linear rating scale models (LRSM), partial credit models (PCM), and linear partial credit models (LPCM). Missing values are allowed in the data matrix. Additional features are the estimation of the person parameters, LR-Model test, item-spefific Wald test, itemfit and personfit statistics, various ICC plots. **COLOR(red){evd}: 極値分布の関数 [#c9ebb5c5] 一次元と多次元の極値パラメトリック分布のシミュレーション、クォンタイル、そして密度関数。また、一次元と多次元モデルに対する最尤推定量を計算する当てはめ関数を提供する。 **COLOR(red){exactLoglinTest}: 対数線形モデルのモンテカルロ正確確率検定(Exact Test) [#ta178318] 対数線形モデルのモンテカルロおよび MCMC 適合度検定 **COLOR(red){exactRankTests}: ランクとパーミュテーション検定に対する正確分布 [#g402147f] Streitberg と Roehmel のシフトアルゴリズムの実装を用いた正確な p-値とクォンタイル
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