SIZE(25){COLOR(red){R で並列処理}}

*parallel パッケージ [#i7152570]
-R2.14.0 以降

*[[CRAN Task View:]] [#z2839d6d]
*パッケージ [#v97f8d59]
--[[L. Tierney氏のsnowパッケージでクラスタ計算を行う]]

-snowFT: Fault Tolerant Simple Network of Workstations

-doSNOW: Foreach parallel adaptor for the snow package

-rpvm: PVM (並列仮想計算機)への R インタフェイス

-nws: [[NetworkSpacesh:]] ((Windows XP, Linux, Mac OS X に対応))と Sleigh のための R 関数
--[[R での利用法方法:]]
--[[Python NetWorkSpaces(NWS)と並列プログラミング(日本語):]]

-Rsge: SGE 待ち行列システムインターフェース

-GridR: リモートホスト、クラスターまたはグリッド上で関数を実行
//Executes functions on remote hosts, clusters or grids

-mapReduce: mapReduce - 並列計算用の柔軟な mapReduce アルゴリズム
[[mapReduce(並列計算用の柔軟な mapReduce アルゴリズム)パッケージ中のオブジェクト一覧]]

-taskPR: タスク並列 R パッケージ 

-ff: memory-efficient storage of large data on disk and fast access functions

-RScaLAPACK: A seamless interface to perform parallel computation on linear algebra problems using the ScaLAPACK library

-doMPI: Foreach parallel adaptor for the Rmpi package

-parfossil: Parallelized functions for palaeoecological and palaeogeographical analysis

-sprint: Simple Parallel R INTerface

**マルチコア [#p56159c3]
-multicore: Parallel processing of R code on machines with multiple cores or CPUs
--doMC: Foreach parallel adaptor for the multicore package (linux, MacOSXのみ Windows不可)
--doSMP: Foreach parallel adaptor for the revoIPC package (Windows, linux, MacOSX) Windowsユーザは有無を言わずこれを使う
---[[doSMP removed from CRAN:]] Win User は、代わりに、doSnow を当面利用


*応用パッケージ [#bede5c1c]
-caretNWS: NetworkSpaces を使って並列化した分類と回帰トレーニング
-npRmpi: Nonparametric kernel smoothing methods for mixed data types
-pensim: Simulation of high-dimensional data and parallelized repeated penalized regression

**GGPU [#u943c622]
-gputools: PU 利用可能なデータマイニングのいくつかの関数群
[[gputools(GPU 利用可能なデータマイニングのいくつかの関数群)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
-[[GPU computing for R statistical environment :]]

-cudaBayesreg: fMRI データ分析用マルチレベルモデルの CUDA 並列実装
//CUDA Parallel Implementation of a Bayesian Multilevel Model for fMRI Data Analysis

-[[Support Vector Machine with GPU:]] [[RPUSVM:]]

*事例・文献 [#uc19aeb9]
-[[R on Biowulf:]] Biowulf 上での R の実行例
-[[Condor での利用例:]]
-[[useR! 2008 の発表リスト:]]
-[[Easier Parallel Computing in R with snowfall and sfCluster:]]
-[[McCallum, Q. M., Weston, S.(2011): Parallel R, Data Analysis in the Distributed World :]],O'Reilly.
-[[The next generation of parallel R:]]
-[[Parallel R - Data Analysis in the Distributed World:]]

*リンク [#m9250d6e]
-[[R で GPUによる超高速演算(NVIDIA CUDA を利用) のできる時?]]
--[[BLAS での利用例:]]
-[[Tutorial: Introduction to High-Performance Computing with R @ useR! 2009 :]]
-[[High Performance Computing@R-Forge:]]
-[[Parallel R Model Prediction Building and Analytics:]]


*コメント [#s8b2826f]


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