R で並列処理
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SIZE(25){COLOR(red){R で並列処理}}
*parallel パッケージ [#i7152570]
-R2.14.0 以降
*[[CRAN Task View:http://cran.md.tsukuba.ac.jp/web/views/...
*パッケージ [#v97f8d59]
-snow(snow:ワークステーションのシンプルなネットワーク)
--[[L. Tierney氏のsnowパッケージでクラスタ計算を行う]]
--[[Rで並列計算]]
-snowFT: Fault Tolerant Simple Network of Workstations
-doSNOW: Foreach parallel adaptor for the snow package
-rpvm: PVM (並列仮想計算機)への R インタフェイス
-nws: [[NetworkSpacesh:http://www.lindaspaces.com/product...
--[[R での利用法方法:http://www.lindaspaces.com/downloads...
--[[Python NetWorkSpaces(NWS)と並列プログラミング（日本語...
-Rsge: SGE 待ち行列システムインターフェース
-GridR: リモートホスト、クラスターまたはグリッド上で関数...
//Executes functions on remote hosts, clusters or grids
-mapReduce: mapReduce - 並列計算用の柔軟な mapReduce アル...
[[mapReduce(並列計算用の柔軟な mapReduce アルゴリズム)パ...
-taskPR: タスク並列 R パッケージ
-ff: memory-efficient storage of large data on disk and f...
-RScaLAPACK: A seamless interface to perform parallel com...
-doMPI: Foreach parallel adaptor for the Rmpi package
-parfossil: Parallelized functions for palaeoecological a...
-sprint: Simple Parallel R INTerface
**マルチコア [#p56159c3]
-multicore: Parallel processing of R code on machines wit...
--doMC: Foreach parallel adaptor for the multicore packag...
--doSMP: Foreach parallel adaptor for the revoIPC package...
---[[doSMP removed from CRAN:http://heuristically.wordpre...
-raster
*応用パッケージ [#bede5c1c]
-caretNWS: NetworkSpaces を使って並列化した分類と回帰トレ...
-npRmpi: Nonparametric kernel smoothing methods for mixed...
-pensim: Simulation of high-dimensional data and parallel...
**GGPU [#u943c622]
-gputools: PU 利用可能なデータマイニングのいくつかの関数群
[[gputools(GPU 利用可能なデータマイニングのいくつかの関数...
-[[GPU computing for R statistical environment :http://us...
-cudaBayesreg: fMRI データ分析用マルチレベルモデルの CUDA...
//CUDA Parallel Implementation of a Bayesian Multilevel M...
-[[Support Vector Machine with GPU:http://www.r-tutor.com...
*事例・文献 [#uc19aeb9]
-[[R on Biowulf:http://biowulf.nih.gov/apps/R.html]] Biow...
-[[「グリッドコンピューティングとR」:http://jasp.ism.ac.j...
-[[Condor での利用例:https://stat.ethz.ch/pipermail/r-hel...
-[[useR! 2008 の発表リスト:http://www.statistik.uni-dortm...
-[[Easier Parallel Computing in R with snowfall and sfClu...
-[[McCallum, Q. M., Weston, S.(2011): Parallel R, Data An...
-[[The next generation of parallel R:http://www.r-blogger...
-[[Parallel R - Data Analysis in the Distributed World:ht...
*リンク [#m9250d6e]
-[[R/parallel:http://www.rparallel.org/]]
-[[r-sg-hpc:https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-sig-h...
-[[R で GPUによる超高速演算(NVIDIA CUDA を利用) のできる...
--[[BLAS での利用例:http://cs.anu.edu.au/people/Ahmed.ElZ...
-[[Tutorial: Introduction to High-Performance Computing w...
-[[High Performance Computing@R-Forge:https://r-forge.r-p...
-[[Parallel R Model Prediction Building and Analytics:htt...
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*コメント [#s8b2826f]
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*parallel パッケージ [#i7152570]
-R2.14.0 以降
*[[CRAN Task View:http://cran.md.tsukuba.ac.jp/web/views/...
*パッケージ [#v97f8d59]
-snow(snow:ワークステーションのシンプルなネットワーク)
--[[L. Tierney氏のsnowパッケージでクラスタ計算を行う]]
--[[Rで並列計算]]
-snowFT: Fault Tolerant Simple Network of Workstations
-doSNOW: Foreach parallel adaptor for the snow package
-rpvm: PVM (並列仮想計算機)への R インタフェイス
-nws: [[NetworkSpacesh:http://www.lindaspaces.com/product...
--[[R での利用法方法:http://www.lindaspaces.com/downloads...
--[[Python NetWorkSpaces(NWS)と並列プログラミング（日本語...
-Rsge: SGE 待ち行列システムインターフェース
-GridR: リモートホスト、クラスターまたはグリッド上で関数...
//Executes functions on remote hosts, clusters or grids
-mapReduce: mapReduce - 並列計算用の柔軟な mapReduce アル...
[[mapReduce(並列計算用の柔軟な mapReduce アルゴリズム)パ...
-taskPR: タスク並列 R パッケージ
-ff: memory-efficient storage of large data on disk and f...
-RScaLAPACK: A seamless interface to perform parallel com...
-doMPI: Foreach parallel adaptor for the Rmpi package
-parfossil: Parallelized functions for palaeoecological a...
-sprint: Simple Parallel R INTerface
**マルチコア [#p56159c3]
-multicore: Parallel processing of R code on machines wit...
--doMC: Foreach parallel adaptor for the multicore packag...
--doSMP: Foreach parallel adaptor for the revoIPC package...
---[[doSMP removed from CRAN:http://heuristically.wordpre...
-raster
*応用パッケージ [#bede5c1c]
-caretNWS: NetworkSpaces を使って並列化した分類と回帰トレ...
-npRmpi: Nonparametric kernel smoothing methods for mixed...
-pensim: Simulation of high-dimensional data and parallel...
**GGPU [#u943c622]
-gputools: PU 利用可能なデータマイニングのいくつかの関数群
[[gputools(GPU 利用可能なデータマイニングのいくつかの関数...
-[[GPU computing for R statistical environment :http://us...
-cudaBayesreg: fMRI データ分析用マルチレベルモデルの CUDA...
//CUDA Parallel Implementation of a Bayesian Multilevel M...
-[[Support Vector Machine with GPU:http://www.r-tutor.com...
*事例・文献 [#uc19aeb9]
-[[R on Biowulf:http://biowulf.nih.gov/apps/R.html]] Biow...
-[[「グリッドコンピューティングとR」:http://jasp.ism.ac.j...
-[[Condor での利用例:https://stat.ethz.ch/pipermail/r-hel...
-[[useR! 2008 の発表リスト:http://www.statistik.uni-dortm...
-[[Easier Parallel Computing in R with snowfall and sfClu...
-[[McCallum, Q. M., Weston, S.(2011): Parallel R, Data An...
-[[The next generation of parallel R:http://www.r-blogger...
-[[Parallel R - Data Analysis in the Distributed World:ht...
*リンク [#m9250d6e]
-[[R/parallel:http://www.rparallel.org/]]
-[[r-sg-hpc:https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-sig-h...
-[[R で GPUによる超高速演算(NVIDIA CUDA を利用) のできる...
--[[BLAS での利用例:http://cs.anu.edu.au/people/Ahmed.ElZ...
-[[Tutorial: Introduction to High-Performance Computing w...
-[[High Performance Computing@R-Forge:https://r-forge.r-p...
-[[Parallel R Model Prediction Building and Analytics:htt...
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