LaTeX
をテンプレートにして作成
[
トップ
] [
新規
|
一覧
|
検索
|
最終更新
|
ヘルプ
]
開始行:
#contents
*概要 [#description]
R と LaTeX の連係
LaTeX そのものの話題は各人で検索して下さい。R と関係のあ...
//-------------------------------------------------------...
* RからLaTeXの表を出力する [#faf014f9]
RからLaTeXの表を出力するには、xtableパッケージのxtable()...
latex()は、通常のtabluar以外にも、booktabsやctableに対応...
** latex 関数の場合 [#r485b8cf]
*** booktabs形式での出力 [#tfd76fc0]
> latex(オブジェクト, file='',booktabs=T,dcolumn=T)
file=''とすると、画面に出力される。
*** ctable形式での出力 [#r34bea38]
*** 用意するもの [#jea4551a]
Hmiscパッケージ、[[ctable.sty:http://www.ring.gr.jp/pub/t...
styファイルをカレントディレクトリに置けばそのまま使えるが...
*** コマンドの実行 [#hccee882]
> latex(オブジェクト, file='ファイル名.tex',ctable=T,dco...
ctableは学術風の表にするため、dcolumnは小数点をそろえるた...
*** LaTeXソースの中に取り込む [#k06c0a55]
?documentclass{jsarticle}
?usepackage[xdvi]{color}
?usepackage{ctable,dcolumn}
?begin{document}
?input{ファイル名.tex}
?end{document}
上記のように論文中に?inputを使って取り込めばよい。
*** 実行結果の例 [#vde08f51]
#ref(latex-table.png)
latex()は非常に多機能なので、是非ヘルプファイルを読まれた...
//-------------------------------------------------------...
** xtable 関数の場合 [#z864988a]
"xtable" パッケージを利用すると、データを「LaTeXのtabular...
あるいは「htmlの表のコード」を出力します。
*** ライブラリの使用宣言 [#r7e7e456]
> library(xtable)
*** どのような関数の結果に対応しているか [#w14d6091]
> methods(xtable) # 以下のような関数に対応
[1] xtable.anova xtable.aov
[3] xtable.aovlist xtable.coxph
[5] xtable.data.frame xtable.glm
[7] xtable.lm xtable.matrix
[9] xtable.prcomp xtable.summary.aov
[11] xtable.summary.aovlist xtable.summary.glm
[13] xtable.summary.lm xtable.summary.prcomp
[15] xtable.ts
*** 使用例 [#u3d70637]
何もオプションを指定しないとコンソールに結果が示される。...
> xtable(prcomp(matrix(rnorm(100),20,5))) # prcomp の結...
% latex table generated in R 2.1.1 by xtable 1.2-5 package
% Thu Aug 4 22:17:08 2005
?begin{table}[ht]
?begin{center}
?begin{tabular}{rrrrrr}
?hline
& PC1 & PC2 & PC3 & PC4 & PC5 ??
?hline
1 & $-$0.0244 & $-$0.1054 & $-$0.9110 & $-$0.3256 & $-$0...
2 & $-$0.3081 & $-$0.2500 & 0.3311 & $-$0.2465 & $-$0.81...
3 & 0.0399 & 0.9111 & 0.0660 & $-$0.3748 & $-$0.1535 ??
4 & $-$0.6196 & $-$0.1368 & 0.1157 & $-$0.5813 & 0.4961 ??
5 & $-$0.7204 & 0.2786 & $-$0.2065 & 0.5957 & $-$0.0767 ??
?hline
?end{tabular}
?end{center}
?end{table}
タイプセットの結果は，以下の通り
#ref(xtable.png)
* RのソースコードをLaTeX文書に記述する [#b7ceaf32]
** listings.styを使う [#jf70ea48]
Rソースファイルを構文強調して表示することができます。~
「[[RのソースコードをLaTeX文書に記述する]]」を参照。
** verbatim 環境を使う [#yf0f5ffd]
キーワードのカラーリングなど派手だが，色数を使えばいいと...
実行例（以下はテキストのように見えるが，画像ファイル）
----
#ref(prog.png)
----
** cprog.styを使う [#la7e81c5]
?documentclass{article}
?usepackage{cprog}
?begin{document}
?begin{cprog}
boa.acf <- function(link, lags)
# Brian Smith has produced the BOA (Bayesian Output Anal...
# S-plus/R functions for analysis of MCMC output, which ...
# from Classic BUGS or WinBUGS. Version 0.5.0 is now ava...
{
pnames <- boa.pnames(link)
result <- matrix(NA, nrow = ncol(link), ncol = length(...
dimnames = list(pnames, paste("Lag", ...
lags <- lags[lags <= (nrow(link) - 1)]
n.lags <- length(lags)
if(n.lags > 0) {
idx <- 1:n.lags
lag.max <- max(lags)
for(i in pnames) {
result[i, idx] <- acf(link[, i], lag.max = lag.m...
plot = FALSE)$acf[lags + 1]
}
}
return(result)
}
?end{cprog}
?end{document}
実行例（以下はテキストのように見えるが，画像ファイル）
----
#ref(cprog.png)
----
//-------------------------------------------------------...
* LaTeX で利用するグラフィックファイルの作成方法 [#i1a0e2...
** 図をEPS ファイルに書き出す [#xdff39bf]
> dev.copy2eps( file = "file_name.eps" )
[[Rによるポストスクリプト画像のLaTeXでの利用]] も参照．
** 図をPDFファイルに書き出す [#p09598b6]
pdflatex+pdfscreenなどでは epsは使えない。代わりにpdfを作...
> dev.copy(pdf,file="file_name.pdf")
> dev.off()
または
> pdf()
> plot(x)
> dev.off()
LaTeX ソースは以下のような感じ。bb= の次の4つの数字は，最...
?documentclass[a4paper] {jsarticle}
?usepackage[dvipdfm]{graphicx}
?usepackage{ctable}
?begin{document}
?includegraphics[bb=2 2 363 275, clip, width=150mm]{pdf....
?includegraphics[bb=2 2 363 275, clip, width=80mm]{pdf.p...
?end{document}
実際の出力例~
#ref(pdf.png)
//-------------------------------------------------------...
** 図をpicTeX形式に書き出す [#z207ec26]
> dev.copy(pictex,"fig1.tex")
できあがったpicTeX形式の図(上記例ではfig1.tex)はテキスト...
*** 参考例 -- 2004-11-20 [#t0533e56]
まず R で
x <- rnorm(10)
pictex("test.tex")
plot(x)
dev.off()
これで作られたファイル test.tex の最初に次を加える
?documentclass[a4paper]{jarticle}
?usepackage{pictex}
?begin{document}
当然最後に次を加える
?end{document}
次に test.tex からx,y軸ラベルに相当するところを見つけ編集...
?put {Index} [rB] <0.00pt,0.00pt> at 169.59 5.17
?put {x} [lB] <0.00pt,0.00pt> at 9.72 154.73
をたとえば
?put {インデックス} [lB] <0.00pt,0.00pt> at 169.59 5.17
?put {?shortstack[r]{ス??[-7mm] ク??[-7mm] ッ??[-7mm] エ...
<0.00pt,0.00pt> at 2 154.73
に変更する。at 以下はテキストをおく位置の x,y 座標ですか...
#ref(test.png)
* 図中に日本語や数式を使う [#f1b26b99]
R単独でも日本語や数式は使えますが、美しい数式が必要な場合...
PSfrag を使う場合は、英文の図を日本語の図に変換するため、...
//-------------------------------------------------------...
* 資料 [#o7cfdafd]
- [[Statistical Tables and Plots using S and LaTeX:http:/...
- [[The R Book]]第19章「RとLaTeX」
//-------------------------------------------------------...
*参考記事 [#article]
-[[TeX Wiki:http://oku.edu.mie-u.ac.jp/~okumura/texwiki/i...
ツール Sweave を使うと、R コードと LATEX ドキュメントの一...
- [[The Sweave Homepage>http://www.statistik.lmu.de/~leis...
- [[Sweave 関連情報]]
- [[SweaveTips集]]
終了行:
#contents
*概要 [#description]
R と LaTeX の連係
LaTeX そのものの話題は各人で検索して下さい。R と関係のあ...
//-------------------------------------------------------...
* RからLaTeXの表を出力する [#faf014f9]
RからLaTeXの表を出力するには、xtableパッケージのxtable()...
latex()は、通常のtabluar以外にも、booktabsやctableに対応...
** latex 関数の場合 [#r485b8cf]
*** booktabs形式での出力 [#tfd76fc0]
> latex(オブジェクト, file='',booktabs=T,dcolumn=T)
file=''とすると、画面に出力される。
*** ctable形式での出力 [#r34bea38]
*** 用意するもの [#jea4551a]
Hmiscパッケージ、[[ctable.sty:http://www.ring.gr.jp/pub/t...
styファイルをカレントディレクトリに置けばそのまま使えるが...
*** コマンドの実行 [#hccee882]
> latex(オブジェクト, file='ファイル名.tex',ctable=T,dco...
ctableは学術風の表にするため、dcolumnは小数点をそろえるた...
*** LaTeXソースの中に取り込む [#k06c0a55]
?documentclass{jsarticle}
?usepackage[xdvi]{color}
?usepackage{ctable,dcolumn}
?begin{document}
?input{ファイル名.tex}
?end{document}
上記のように論文中に?inputを使って取り込めばよい。
*** 実行結果の例 [#vde08f51]
#ref(latex-table.png)
latex()は非常に多機能なので、是非ヘルプファイルを読まれた...
//-------------------------------------------------------...
** xtable 関数の場合 [#z864988a]
"xtable" パッケージを利用すると、データを「LaTeXのtabular...
あるいは「htmlの表のコード」を出力します。
*** ライブラリの使用宣言 [#r7e7e456]
> library(xtable)
*** どのような関数の結果に対応しているか [#w14d6091]
> methods(xtable) # 以下のような関数に対応
[1] xtable.anova xtable.aov
[3] xtable.aovlist xtable.coxph
[5] xtable.data.frame xtable.glm
[7] xtable.lm xtable.matrix
[9] xtable.prcomp xtable.summary.aov
[11] xtable.summary.aovlist xtable.summary.glm
[13] xtable.summary.lm xtable.summary.prcomp
[15] xtable.ts
*** 使用例 [#u3d70637]
何もオプションを指定しないとコンソールに結果が示される。...
> xtable(prcomp(matrix(rnorm(100),20,5))) # prcomp の結...
% latex table generated in R 2.1.1 by xtable 1.2-5 package
% Thu Aug 4 22:17:08 2005
?begin{table}[ht]
?begin{center}
?begin{tabular}{rrrrrr}
?hline
& PC1 & PC2 & PC3 & PC4 & PC5 ??
?hline
1 & $-$0.0244 & $-$0.1054 & $-$0.9110 & $-$0.3256 & $-$0...
2 & $-$0.3081 & $-$0.2500 & 0.3311 & $-$0.2465 & $-$0.81...
3 & 0.0399 & 0.9111 & 0.0660 & $-$0.3748 & $-$0.1535 ??
4 & $-$0.6196 & $-$0.1368 & 0.1157 & $-$0.5813 & 0.4961 ??
5 & $-$0.7204 & 0.2786 & $-$0.2065 & 0.5957 & $-$0.0767 ??
?hline
?end{tabular}
?end{center}
?end{table}
タイプセットの結果は，以下の通り
#ref(xtable.png)
* RのソースコードをLaTeX文書に記述する [#b7ceaf32]
** listings.styを使う [#jf70ea48]
Rソースファイルを構文強調して表示することができます。~
「[[RのソースコードをLaTeX文書に記述する]]」を参照。
** verbatim 環境を使う [#yf0f5ffd]
キーワードのカラーリングなど派手だが，色数を使えばいいと...
実行例（以下はテキストのように見えるが，画像ファイル）
----
#ref(prog.png)
----
** cprog.styを使う [#la7e81c5]
?documentclass{article}
?usepackage{cprog}
?begin{document}
?begin{cprog}
boa.acf <- function(link, lags)
# Brian Smith has produced the BOA (Bayesian Output Anal...
# S-plus/R functions for analysis of MCMC output, which ...
# from Classic BUGS or WinBUGS. Version 0.5.0 is now ava...
{
pnames <- boa.pnames(link)
result <- matrix(NA, nrow = ncol(link), ncol = length(...
dimnames = list(pnames, paste("Lag", ...
lags <- lags[lags <= (nrow(link) - 1)]
n.lags <- length(lags)
if(n.lags > 0) {
idx <- 1:n.lags
lag.max <- max(lags)
for(i in pnames) {
result[i, idx] <- acf(link[, i], lag.max = lag.m...
plot = FALSE)$acf[lags + 1]
}
}
return(result)
}
?end{cprog}
?end{document}
実行例（以下はテキストのように見えるが，画像ファイル）
----
#ref(cprog.png)
----
//-------------------------------------------------------...
* LaTeX で利用するグラフィックファイルの作成方法 [#i1a0e2...
** 図をEPS ファイルに書き出す [#xdff39bf]
> dev.copy2eps( file = "file_name.eps" )
[[Rによるポストスクリプト画像のLaTeXでの利用]] も参照．
** 図をPDFファイルに書き出す [#p09598b6]
pdflatex+pdfscreenなどでは epsは使えない。代わりにpdfを作...
> dev.copy(pdf,file="file_name.pdf")
> dev.off()
または
> pdf()
> plot(x)
> dev.off()
LaTeX ソースは以下のような感じ。bb= の次の4つの数字は，最...
?documentclass[a4paper] {jsarticle}
?usepackage[dvipdfm]{graphicx}
?usepackage{ctable}
?begin{document}
?includegraphics[bb=2 2 363 275, clip, width=150mm]{pdf....
?includegraphics[bb=2 2 363 275, clip, width=80mm]{pdf.p...
?end{document}
実際の出力例~
#ref(pdf.png)
//-------------------------------------------------------...
** 図をpicTeX形式に書き出す [#z207ec26]
> dev.copy(pictex,"fig1.tex")
できあがったpicTeX形式の図(上記例ではfig1.tex)はテキスト...
*** 参考例 -- 2004-11-20 [#t0533e56]
まず R で
x <- rnorm(10)
pictex("test.tex")
plot(x)
dev.off()
これで作られたファイル test.tex の最初に次を加える
?documentclass[a4paper]{jarticle}
?usepackage{pictex}
?begin{document}
当然最後に次を加える
?end{document}
次に test.tex からx,y軸ラベルに相当するところを見つけ編集...
?put {Index} [rB] <0.00pt,0.00pt> at 169.59 5.17
?put {x} [lB] <0.00pt,0.00pt> at 9.72 154.73
をたとえば
?put {インデックス} [lB] <0.00pt,0.00pt> at 169.59 5.17
?put {?shortstack[r]{ス??[-7mm] ク??[-7mm] ッ??[-7mm] エ...
<0.00pt,0.00pt> at 2 154.73
に変更する。at 以下はテキストをおく位置の x,y 座標ですか...
#ref(test.png)
* 図中に日本語や数式を使う [#f1b26b99]
R単独でも日本語や数式は使えますが、美しい数式が必要な場合...
PSfrag を使う場合は、英文の図を日本語の図に変換するため、...
//-------------------------------------------------------...
* 資料 [#o7cfdafd]
- [[Statistical Tables and Plots using S and LaTeX:http:/...
- [[The R Book]]第19章「RとLaTeX」
//-------------------------------------------------------...
*参考記事 [#article]
-[[TeX Wiki:http://oku.edu.mie-u.ac.jp/~okumura/texwiki/i...
ツール Sweave を使うと、R コードと LATEX ドキュメントの一...
- [[The Sweave Homepage>http://www.statistik.lmu.de/~leis...
- [[Sweave 関連情報]]
- [[SweaveTips集]]
ページ名:
![[RjpWiki]](image/../Rlogo.png "[RjpWiki]")
