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COLOR(red){SIZE(30){RでGIS}}
ここでは、Rによって実現できるGIS(地理情報システム)とい...
#contents
*地図パッケージ [#hf842fc3]
** ベクトル型 [#y7d974a1]
- [[Rmapを使った地図表示]]
- [[maptools で地図表示]]
- sp
- maps
- RArcInfo
- gmt: GMT 4.0 へのインターフェース
**ベクトル/ラスター型 [#tf8157c4]
- [[rgdal(GDAL(Geospatial Data Abstraction Library, 地理...
*空間データ [#x669e88e]
//**ポータルサイト [#m728bb6f]
//-[[The National Map Seamless Server:http://seamless.usg...
// 画像、ＤＥＭ等。ベクターデータ（ＵＳＡのみ）。
//-[[カナダ バンクーバー市:http://data.vancouver.ca/]] ...
** シェープファイル & KML & E00[#xdc0ca93]
- 世界
//-- [[DataServer:http://biogeo.berkeley.edu/bgm/gdata.ph...
-- [[Shapefiles for Epi Info:http://www.cdc.gov/epiinfo/s...
--[[SALB - Administrative boundaries:http://www.unsalb.or...
--DCW
--[[FAO GeoNetwork:http://www.fao.org/geonetwork/]] 検索...
--[[Global Administrative Areas:http://www.gadm.org/count...
---[[R 関連情報:http://www.gadm.org/node/346#comment-133]]
---[[Provincial Map using GADM:http://r-nold.blogspot.jp/...
--[[Natural Earth:http://www.naturalearthdata.com/]] 行政...
--OSM:Open Street Map --- Croudsourcing で作成された空間...
---[[CloudMade:http://downloads.cloudmade.com/]]
--[[Free GIS Datasets:http://freegisdata.rtwilson.com/]]
--[[cshapes:http://cran.r-project.org/web/packages/cshape...
[[解説:http://journal.r-project.org/archive/2010-1/RJou...
--[[UNEP の原子力発電所データセット(E00):https://stat.eth...
--[[http://www.diva-gis.org/Data]]
- 日本
--[[地図で見る統計（統計GIS）:http://www.e-stat.go.jp/SG1...
シェープファイル形式の町丁字界とCSV形式の人口・世帯デー...
--地球地図
--- [[地球地図日本:http://www.gsi.go.jp/kankyochiri/gm_jp...
-- [[国土交通省 国土数値情報:http://nlftp.mlit.go.jp/ksj...
---各種の情報があるが、市区町村界は、昭和２５年から、５年...
---[[国土数値情報 土地利用細分メッシュデータ(昭和51年度...
---小学校区（コミュニティの単位として）
---流動データ：パーソントリップ
---シェープファイル形式が用意されていないものは、[[変換ツ...
---[[土地分類調査・水調査:http://tochi.mlit.go.jp/tockok/...
--環境省
---[[第６回・第７回自然環境保全基礎調査 植生調査:http://...
--[[地震ハザードステーション:http://www.j-shis.bosai.go.j...
- 中国
-- [[400万分の１ - 行政界の中心点・行政界（県(county)以上...
-- 上記のデータを使った chinamap という R パッケージが公...
- アフガニスタン
--[[Afghan War Diary, 2004-2010:http://wikileaks.org/wiki...
---[[Wikileaks Attack Data by Year and Type Projected on ...
R のソースコードあり
- アメリカ合衆国
--[[geodata.gov - U. S. MAPS & DATA:http://gos2.geodata.g...
-- [[連邦政府各機関が提供するデータの総合サイト:http://da...
-- [[アメリカ地質調査所のナショナルアトラス（国勢地図帳）...
-- ESRI - Geography Network
-- アメリカセンサス局
---[[2007 TIGER/LineR Shapefiles:http://www.census.gov/ge...
--[[The US National Historical GIS:http://www.nhgis.org]]...
--[[Atlas of Historical County Boundaries:http://publicat...
--[[Washington DC Data Catalog:http://data.dc.gov/]] Shap...
-カナダ
-- [[道路ネットワークデータ:http://www.statcan.gc.ca/mgeo...
--ブリティッシュコロンビア州ヴァンクーヴァー市 [[Open Da...
--オンタリオ州[[トロント市:http://www1.toronto.ca/wps/por...
--Ottawa
--Edmonton
--[[ケベック州:http://donnees.gouv.qc.ca/?node=/accueil]]
---[[ケベック市:http://donnees.ville.quebec.qc.ca/]]
--ポータルサイト
-ハイチ
--[[HaitiData.org:http://haitidata.org/]]
-ヨーロッパ
--[[EEA(欧州環境庁) Data Service:http://dataservice.eea.e...
--[[Corine land cover2000:http://terrestrial.eionet.europ...
-イギリス
--[[http://www.sharegeo.ac.uk/]]
---[[Amateur Mapmaking: Getting Started With Shapefiles:h...
--[[イングランド・ウェールズ歴史的カウンティ(historic cou...
--[[OS Open Data :https://www.ordnancesurvey.co.uk/openda...
シェープファイル形式(行政界)、ポイントデータ(CSV),等高...
--[[Ordnance Survey Opendata:http://wiki.openstreetmap.or...
--[[John Snow のロンドン・ソーホーにおけるコレラの感染地...
---[[John Snow’s Cholera data in more formats:http://blog...
---[[John Snow’s famous cholera analysis data in modern G...
--[[Open Geoscience イギリス地質調査所の地質図:http://www...
--[[Census 2012:http://www.ons.gov.uk/ons/guide-method/ge...
---[[2011 CENSUS OPEN ATLAS PROJECT:http://www.alex-singl...
-フランス
--[[フランス国土地理院:http://www.ign.fr/rubrique.asp?lng...
--パリ市
-イタリア
-- [[イタリア国家統計局:http://www.istat.it/it/strumenti/...
- オーストラリア
--[[GeoScience Australia:https://www.ga.gov.au/products/s...
行政界、DEM、地形、環境、地質、地球物理、地球化学、地質...
- ニュージーランド
ニュージーランドは公的な空間データがフリーになる模様
-- [[Statistics New Zealand’s Digital Boundaries and stan...
--[[Mapping New Zealand - a summary:http://blog.thematicm...
-南極
--[[南極の地理空間情報データ:http://antarctic.gsi.go.jp/i...
**変換ツール [#fc91ce5b]
-数値地図のデータ形式がXML(JPGIS)形式に変更されたためか、...
-[[国土地理院:http://fgd.gsi.go.jp/download/]]から基盤地...
**ラスター [#ac466938]
***[[USGS EarthExplorer:http://edcsns17.cr.usgs.gov/Earth...
***[[地球環境データセット:http://spatial-analyst.net/wiki...
-地形・行政界
--標高・地形
--行政界
--社会経済
--水資源
-ウエブサービスによるもの
-リモセン画像
-主題図（派生データ）
***DEM（数値標高モデル） [#a82efae1]
-[[基盤地図情報@国土地理院:http://www.gsi.go.jp/kiban/ets...
-[[ASTER全球3次元地形データ:http://www.gdem.aster.ersdac....
--[[Global Multi-resolution Terrain Elevation Data 2010 (...
-UK
--[[LIDAR Digital Surface Model:http://data.gov.uk/datase...
-USA
--[[Open Topography:http://www.opentopography.org/index.p...
-NZ
--[[geographx のフリーでＤＬできるDEM:http://www.geograph...
***[[国土地理院火山地形分類データファイル:http://www1.gsi...
***NOAAの夜間照明（画像）TIFF 形式 [#q055e336]
-[[Version 4 DMSP-OLS Nighttime Lights Time Series:http:/...
-[[Nightlights:http://stevemosher.wordpress.com/2010/10/0...
//***地球の月 [#k28713f4]
//-かぐやのデータ２００９年１１月公開予定
***LANDSAT [#se378509]
-landsat@CRAN
**属性データ [#xa67723f]
[[GISで利用可能なRパッケージ内データ]]
-アメリカ
--UScensus2000
---[[US Census Spatial and Demographic Data in R: The USc...
--人口移動
---[[IRS(アメリカ合衆国内国歳入庁) の州間およびカウンティ...
----[[Great Circles US IRS Migration mapping:https://stat...
---[[カウンティ間の労働者の移動データ(2006-2009):http://u...
-イギリス
--[[data.gov.uk:http://data.gov.uk/]] ポータルサイト。GIS...
--[[census 2011 key statistics and quick statistics bulk ...
-[[Census Open Atlas Project Version Two:http://www.r-blo...
*lattice パッケージを使った地図表示 [#c8f99c9a]
http://dsarkar.fhcrc.org/lattice/book/figures.html に多...
**latticeExtra パッケージを使った地図表示 [#y1f3f043]
-[[Customizing Maps in R: spplot() and latticeExtra funct...
sp, gstat
*GPS [#v6af9871]
-[[gpsbabel を利用:https://stat.ethz.ch/pipermail/r-sig-g...
-maptools の readgps 関数。GPSBabel 経由のデータ読み込み。
-[[Stay on track: Plotting GPS tracks with R:http://rcras...
*シェープファイルの新規作成 [#ga9d885a]
-[[[R-sig-Geo] How to create a SpatialPolygonsDataFrame o...
-座標値を含むCSVファイルよりポイントシェープファイルの作成
library(maptools)
d<-read.csv(ファイル名)
coordinates(d)<-c("X座標属性名","Y座標属性名")
writeShapePoints(d,"シェープファイル出力ファイル")
*地図投影変換 [#gdaadb8c]
**rgdal [#g3724558]
**[[proj4(PROJ.4 地図投影変換ライブラリ簡易インターフェー...
[[投影法のパラメータが検索できるサイト:http://spatialre...
*等値線図 [#s9d2c7c4]
**[[シェープファイルへの変換:https://stat.ethz.ch/piperma...
ContourLines2SLDF(maptools) 関数で変換して、writeOGR(rg...
*総描 [#bc56d839]
**幾何図形の簡略化 [#id758bb5]
-gSimplify@rgeos
**ラインの簡略化（単純化） [#y71eee53]
-maptools パッケージの thinnedSpatialPoly 関数 --- ポリゴ...
-PBSmapping パッケージの thinPolys 関数 --- ポリゴンのラ...
-shapefiles パッケージの dp 関数 --- ラインの簡略化
-[[Alpha Shapes to Polygons:http://rpubs.com/geospacedman...
*ラベル配置 [#xbe79e7a]
-[[Label placement with spplot and lattice:http://procomu...
*住所照合 [#x9a72bb0]
-gooJSON の gooadd & goomap 関数
#位置（地理座標（緯度）を求める）
uci.add <- gooadd(address=list("千代田区内幸町"))
goomap(uci.add, key="Google Key")
goomap(paste(140,40,sep=","), key="Google Key")
#住所（地理座標（緯度）より求める）
*空間検索 [#z70818d5]
**rgeos [#d74f5ca3]
GEOS パッケージを利用しているので、主要機能をカバーして...
**重心 [#x9b56c6b]
- maptools パッケージ get.Pcent 関数
- PBSMappingパッケージの calcCentroid 関数
-[[Compute Polygon Centroids Using R :http://www.nceas.uc...
**ポリゴンの面積 [#x7e84e41]
- splancs パッケージ areapl 関数
- gpclib パッケージ area.poly 関数(hole のあるポリゴン対応)
- PBSMappingパッケージの calcArea 関数
**最近接点 [#rf57fef7]
- splancs パッケージ n2dist 関数
- [[１つのポイントセットに別のポイントセットの最近接点を...
-spatstat パッケージの nncross 関数
*** K-NN [#c980f3f0]
- spdepパッケージのknearneigh関数
***任意のポイントに近接するラインとの距離と交点 [#xb8c9253]
-dist2Line@geosphere ラインの特定は要プログラミング
***近接するポリゴン情報取得・・・Dorling のカルトグラムや...
- [[シェープファイルよりポリゴンの近隣情報を取得する R ス...
**ポイント・イン・ポリゴン [#ae2483b6]
- sp パッケージ point.in.polygon 関数
- splancsパッケージ inpip , inout 関数
- splancsパッケージ point.in.polygon 関数
**任意のポリゴンに隣接するポリゴン数 [#rf4c9274]
- spdepパッケージ
**空間インデックス [#d388788c]
-[[SearchTrees:http://cran.at.r-project.org/web/packages/...
-gstat パッケージの predict.gstat 関数が内部で4分木（quad...
*空間解析 [#ff494701]
**ポリゴン・オーバーレイ解析 [#v6ec5f2f]
--[[rgeos:http://cran.at.r-project.org/web/packages/rgeos...
gpclib の代替として、[[GEOS:http://trac.osgeo.org/geos/...
Maptools の一部の関数でも利用できる。
libray(stringr) と、"stringr"パッケージを明示的にインス...
--[[Map overlay and spatial aggregation in sp:http://cran...
---[[Google Summer of Code '2010 R:http://gsoc2010r.wordp...
- CRAN の gpclib パッケージ。[[gpclib(R用汎用ポリゴン・...
- spgpc
- PostGIS(RODBC経由)
--PBSMappingパッケージの joinPolys 関数
-[[Spatial Overlays with R - Retrieving Polygon Attribute...
-[[Follow Up on Spatial Overlays with R – Getting A...
**ポリゴンの三角形分割 [#va174fa1]
-deldir
-gpclib
**凸包 [#d4899a31]
-CRAN の tripack パッケージ
-PBSMappingパッケージの calcConvexHull 関数
**TIN [#y5449946]
CRAN の tripack パッケージを利用([[tripack(不規則な間隔...
-deldir
--[[Voronoi polygons with R:http://www.carsonfarmer.com/?...
-[[misc3d(雑多な３Ｄプロット)パッケージ中のオブジェクト一...
**ボロノイ [#h99af677]
-CRAN の tripack パッケージ
--[[tripack を使った六角形グリッドの生成:http://article.g...
-CRAN の deldir パッケージ
--[[deldir を使った六角形グリッドの生成:http://article.gm...
-PBSMappingパッケージの calcVoronoi 関数
-[[擬似ボロノイ（指数の内積および距離の平方によるバイアス...
-voronoi パッケージ(deldir 利用)
-[[Images as Voronoi tesselations:http://is-r.tumblr.com/...
*空間サンプリング（標本化） [#nf40483f]
-sp パッケージの spsample 関数.ライン、ポリゴンおよびグリ...
-splancs パッケージ.spsample より高度な手法をサポートする...
-[[PSURVEY.DESIGN:http://www.epa.gov/nheerl/arm/analysisp...
EPAが開発。近くCRANからも入手可能。
-[[Grid size calculator:http://spatial-analyst.net/wiki/i...
*空間内挿・サーフェス（平滑化） [#r13ab5fa]
**ローパスフィルター [#i42c03e6]
-[[Function to smooth grids using n x n window moving ave...
**スプライン [#raf91525]
-akima
-fields
薄板スプライン(Tps関数)
-MBA(CRAN)
マルチレベルＢスプライン [[MBA パッケージ(マルチレベル ...
**カーネル密度推定法 [#p8e94983]
-[[spatialkernel パッケージ:http://cran.okada.jp.org/src/...
--多変量空間点過程における空間隔離のノンパラメトリック推定
***属性なし [#icb95366]
-MASS パッケージの kde2d 関数
-kde3d 3次元カーネル密度推定計算 in misc3d パッケージ
-density 関数
--[[density+spatstat による例:https://stat.ethz.ch/piperm...
-sm パッケージ
***属性あり [#df81e7ca]
-fields パッケージの smooth.2d 関数
-GeoXp パッケージの densitymap 関数。ESDA対応。
--Laurent, T., A. Ruiz-Gazen, and C. Thomas-Agnan, [["Geo...
-sm パッケージ
--[[Clipping a Surface By a Polygon:http://www.r-bloggers...
**Kriging [#df0c3770]
-[[automap: Automatic interpolation package:http://cran.r...
--[[Automatic spatial interpolation with R: the automap p...
***シェープファイルへの変換方法 [#c674fabc]
[[Unexpected parameter problem using rsaga.geoprocessor()...
***[[Kernel Density With Lines:http://r-sig-geo.2731867.n...
**クリギング [#wdf10ee3]
-fields
-gstat
-[[automap:http://intamap.geo.uu.nl/~paul/Downloads.html]...
-[[GRASS GIS と R の gstat パッケージを使ったクリギングの...
-[[Hurricane Sandy Land Wind Speed and Kriging:http://sta...
** 傾向面 [#scc3a5b6]
*** グローバル [#d5165cff]
- spatial パッケージ surf.ls 関数
*** ローカル [#vb816d38]
- stats パッケージ loess 関数
-- ヴェナブルズ他『S-PLUS による統計解析』、シュプリンガ...
**Pycnophylactic Interpolation(密度保持？内挿) [#g5f082c1]
-pycno
--[[Smooth pycnophylactic interpolation for geographical ...
--[[A combined pycnophylactic-dasymetric method for disag...
**[[intamap: procedures for automated interpolation:http:...
*カルトグラム [#p39b8f45]
**連続型面カルトグラム [#tf9d1331]
-[[Rcartogram:http://www.omegahat.org/Rcartogram/]].
[[ソースコード:http://www.omegahat.org/Rcartogram/Rcartog...
--[[利用例:http://www.stat.purdue.edu/~mdw/490M/indianama...
--ダニエル・ドーリング/マーク・ニューマン/アンナ・バーフ...
library(spdep)
library(cart)
example(columbus)
cartc<-cartogram(columbus["CRIME"])
cartcj <- SpatialPolygonsDataFrame(cartc, columbus@data,...
plot(cartcj)
-[[Worldmapper:http://www.worldmapper.org/index.html]] 上...
-[[cart@r-forge:https://r-forge.r-project.org/R/?group_id...
--座標が保持されない
--[[Rでカルトグラムを作る:http://d.hatena.ne.jp/dichika/2...
**非連続型面カルトグラム [#ub1691fd]
-[[Rmapを使った地図表示]]に実行例あり。
-state.carto@maps - アメリカの州別人口カルトグラム
**Dorling の円カルトグラム [#f25ff182]
隣接するポリゴンが共有する辺の長さを求める必要があり、rg...
~または、他のサイトに例のある Forced Based Direction Algo...
-参考になるのかもしれない例
--[[Plotting non-overlapping circles...:http://grrrraphic...
--[[Circle packing with R:http://lastresortsoftware.blogs...
**MDS(多次元尺度構成法)による距離行列(時間距離(時間地図)...
-stats パッケージの cmdscale(古典的 (計量) 多次元尺度構成...
利用例
data(eurodist) #ヨーロッパの主要都市間の距離行列
loc<-cmdscale(eurodist) #MDS の計算
plot(loc) #座標のプロット
text(loc,names(eurodist),col="red") #都市名の表示
#ref(eurodist_mds.png)
図 ヨーロッパの主要都市間の距離行列からの各都市の位置の...
-INDSCAL: SensoMineR
-[[ALSCAL:http://www.cuddyvalley.org/psychoR/]]
-参考リンク
--[[Rと多次元尺度法:http://www1.doshisha.ac.jp/~mjin/R/27...
--[[Multidimensional Scaling in Quick-r:http://www.statme...
**SOM を使ったカルトグラム [#kbd370bc]
**tree map の利用（実際の位置の表示ではない） [#ad544f7a]
**[[Comparing regions: maps, cartograms and tree maps:htt...
*フローデータ分析 [#g53d3f9c]
**人口移動分析 [#pd3e1f09]
-[[Using 'S' To Analyze Migration Tables:http://www.geog....
-[[Look Familiar? Mapping in R:http://0utlier.blogspot.jp...
アクセシビリティ(近接性) [#icde6ace]
-ポテンシャル図
--[[Rを用いての数量化理論�類の都道府県間人口移動へ...
**フードチェーン [#m91477a4]
-[[Reshaping Horse Import/Export Data to Fit a Sankey Dia...
**[[Look Familiar? Mapping in R:http://0utlier.blogspot.j...
*ネットワーク解析 [#ue5d1b7c]
** 最短経路探索 [#t4c0da45]
***指定ノード [#kaa85940]
---RGBL@BioConductorの関数
Dijkstra
*** 全ノードの最短経路探索 [#lcdba6d1]
---RGBL@BioConductorの関数
Floydのアルゴリズム
-- CRAN の e1071 パッケージ内の allShortestPaths および e...
ただし、数千ノードまで。Dijkstraではなく、Floydのアルゴ...
***位相構造をもたないシェープファイルでも、[[OpenJUMP:htt...
**[[shp2graph:https://r-forge.r-project.org/projects/shp2...
-[[Win Bin:https://sites.google.com/site/neugwr/r-package...
-[[Converting a spatial network to a graph in R:http://ww...
--[[slides:http://www.warwick.ac.uk/statsdept/user-2011/T...
***関連リンク [#c8f01019]
-[[Rでネットワーク解析とGIS:http://www.slideshare.net/Med...
***文献 [#oc56a8cc]
-[[観光分析 計量的アプローチと応用:http://www.kokon.co.jp...
**立地配分問題 [#h5877ed4]
--lpsolve等
--ボロノイ分割（評価）
tripack
--orloca: The package deals with Operations Research LOCa...
--BARD: よりよい自動化再配分
--[[Using R to visualize geo optimization algorithms:http...
--[[Using R to visualize geo optimization algorithms:http...
**巡回セールスマン問題 [#a01089ff]
--optim 関数のサンプル参照
--TSP パッケージ([[Concorde:http://www.tsp.gatech.edu/con...
--[[Combinatorial optimization with gaoptim package:http:...
**[[河川ネットワーク:http://rpubs.com/geospacedman/runnin...
**スタイナー木 [#r6d1d450]
-[[SteinerNet: Steiner Tree Approach for Graph Analysis:h...
要 limma from BioConductor
*ポイント・パターン分析 [#u8caa467]
[[Point pattern analysis packages on CRAN:http://www.sal....
**２次元 [#u09767b6]
-方格法
--spatstat
-最近隣法
--spatstat
-K関数法
--spatial パッケージ
-ユークリッド二次元回帰
--[[kernels, contours, points?:https://stat.ethz.ch/piper...
--[[BiDimRegression: Calculates the bidimensional regress...
-マーク付き点過程
--[[spatstat:http://www.spatstat.org/]]
--[[MarkedPointProcess:http://cran.r-project.org/src/cont...
-ads: 空間ポイントパターン分析 パッケージ
--[[ads(空間ポイントパターン分析)のバインディング)パッケ...
--[[Analysis of Spatial Point Patterns in R:http://www.st...
**１次元（道路上の点分布（インターチェンジ）など） [#x696...
-lpp 関数@spatstat
*セントログラフィ [#bcdf95e6]
-[[aspace(セントログラフィ統計量を推定する関数コレクショ...
*Spatial Scan Statistics [#p59181ed]
CRAN で入手できるDClusterでサポート。プレリリース版が公...
**GAM(Geograpgical Analysis Machine) [#na904a24]
DCluster の opgam 関数でサポート。GAM/K は GAM 結果にカ...
-[[Mapping Hotspots with R: The GAM:http://www.r-bloggers...
-[[Hot Spot Mapping in R: Illustrating Relative Seasonal ...
*地球統計(Geostatistics) [#b6a4074f]
[[Geostatistics packages on CRAN:http://www.sal.uiuc.edu/...
**[[simProto:http://bolmen.ethz.ch/~simsurvey/simsurvey/s...
GUIベースの地球統計を使った分析をおこなえる Web サイト(...
**[[A Practical Guide to Geostatistical Mapping:http://sp...
**[[RGeoS:http://cg.ensmp.fr/rgeos/]] rgeos とは別物。 [#...
**[[IntR – Interactive GUI for performing geostatis...
*地形解析 [#x886f8bc]
**Map Algebra or Cartographic Model [#bd0a13a9]
-raster パッケージ:@CRAN
--[[raster(地理データ分析・モデルリングのためのラスターデ...
// ダウンロードできない場合は R 内より、以下のコマンド...
// install.packages("raster", repos="http://R-Forge.R-pro...
---[[Terrain Attributes with the raster package:R Video t...
---[[reading raster data using library(parallel):http://m...
--[[R GIS: Terrain Analysis for Polygons as Simple as it ...
-[[geovec@r-forge:https://r-forge.r-project.org/R/?group_...
-[[RSAGA(R での SAGA ジオプロセッシングおよび地形解析)パ...
--[[Brenning, A.: Statistical Geocomputing combining R an...
-[[spsextante:http://r-forge.r-project.org/projects/spsex...
//**斜面計算 [#r89c7498]
//--[[斜面計算:https://www.msu.edu/~ashton/classes/866/no...
**自動地形分類 [#d5c4093e]
--[[R+ILWIS/SAGA で DEM の解析:http://spatial-analyst.net...
--[[Automated extraction of geomorphological features usi...
--[[R + SAGA + ILWIS + GRASS で地形計測:http://geomorphom...
--[[Terrain Classification Ideas: Coupling GRASS and R:ht...
-- [[Terrain Classification Experiment 2: GRASS, R, and t...
--[[Terrain Attributes with the raster package:Terrain At...
**地形シミュレーション [#d9dcdf2a]
***[[DEMsim:http://geomorphometry.org/view_scripts.asp?id...
***[[R/ILWIS SCRIPTS FOR GEOSTATISTICAL SIMULATIONS:http:...
**費用距離 [#ebf506c0]
-raster
-gdistance
**[[平均地形曲率推定 Using R and r.mapcalc (GRASS) to Est...
**[[地形表示用カラースキームパッケージ:http://r-forge.r-p...
--[[記事:https://stat.ethz.ch/pipermail/r-help/2009-Novem...
--[[解説:http://r-forge.r-project.org/plugins/scmsvn/view...
**Google Earth [#sff159dc]
-[[Use Case: Spatial R & Google Earth for Terrain Analyse...
**Natural Hazard [#g071cb75]
-[[Creating a map showing land covered by rising sea leve...
*空間的自己相関 [#lc5eb5d3]
CRAN の spdep パッケージを利用。[[spdep(空間従属性)パッ...
**空間ウェイト・マトリックス [#lfa29011]
***cshapes: CShapes データセット及びユーティリティー [#s0...
[[cshapes(CShapes データセット及びユーティリティー)パッケ...
**グローバル空間的自己相関 [#d30e994a]
*** Moran のI統計量 [#yd93fe0d]
-spdepの moran(統計量のみ) および moran.test(検定付き)
-autocorrelation@raster
式
#mimetex( 4$I = \frac{\Bigsum_{i=\1}^{n} \Bigsum_{j=\1}^{...
ここで
#mimetex( 4$W = \Bigsum_{i=\1}^{n} \Bigsum_{j=\1}^{n}w_{i...
*** Geary のｃ統計量 [#tc728e81]
-spdep の geary(統計量のみ) および geary.test(検定付き)
-autocorrelation@raster
*** グローバル G統計量 [#i8000075]
spdep の globalG.test
*** Join 統計量 [#aaba1ca1]
spdepのjoincount(統計量のみ) および joincount.test(検...
**ローカル [#w103431d]
*** Local Moran 統計量 [#w9ef0c9d]
-spdep の localmoran
-autocorrelation@raster
*** Local Geary 統計量 [#kd0f646b]
*** G and G* 統計量 [#k34c8b77]
spdep のlocalG
** [[Classification Trees and Spatial Autocorrelation:htt...
**空間自己回帰 [#rdce1a4c]
*** SAR(同時自己回帰) [#za0806c2]
spdep のerrorsarlm
*** CAR（条件付自己回帰) [#uba7142d]
-spdepのspautol
-spatcounts: Spatial count regression
-R 以外では[[GEOBUGS:http://www.mrc-bsu.cam.ac.uk/bugs/wi...
*** SNA パッケージの自己相関分析関数 [#wde2bd17]
社会ネットワーク分析への応用
***利用例 [#r5be4106]
-[[Constructing Cost Distance in Spatial Models:http://ch...
**空間コレログラム [#u3d6be5c]
spdep の sp.correlogram
-[[Simple Spatial Correlograms for Cross-Country Analysis...
-[[Spatial correlograms in R: a mini overview:http://www....
**空間主成分分析 [#jd444dfb]
-[[Performing a spatial Principal Component Analysis usin...
*Hot Spot [#s426d588]
-[[Mapping research hot-spots:http://spatial-analyst.net/...
*空間スキャン統計量 [#p641867f]
-[[SpatialEpi:http://cran.r-project.org/web/packages/Spat...
*空間的相互作用モデル [#u71a3330]
集計型の主な手法はＧＬＭ（一般化線形モデル）で処理可能...
非集約型は？
**古典的重力モデル [#r6767bc1]
***対数線形 [#d8582b86]
lm
**エントロピー最大化モデル [#oa91690d]
GLMを利用
***無制約型（ポアソン型） [#dfbe2c1d]
***発地制約型 [#u42f8111]
***着地制約型 [#ncfaa94b]
***二重制約型 [#b302b9f9]
-[[Estimating flows between geographical locations: get m...
***競合着地型 [#z1b2b6f9]
**ニューラルネット [#m6887c3b]
nnet
**ライリー・コンバース・モデル [#q768881e]
**ハフ・モデル [#u7ca739f]
-[[in Deutch:http://www.reymann.eu/wp-content/uploads/201...
-http://www.odot.state.or.us/tddtpau/R.html リンク切れ
*GWR(Geographically Weighted Regression, 地理的加重回帰) ...
**spgwr at CRAN [#q08b44e1]
[[spgwr(地理的加重回帰)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
-[[残差と予測値の求め方:https://stat.ethz.ch/pipermail/r-...
-[[GWR 3.0 との相違点:http://web.gg.qub.ac.uk/people/staf...
-[[グリッドコンピューティングによる並列処理の例:http://es...
-[[Advanced Spatial Analysis With R:http://www.geos.ed.ac...
--[[Introduction to Geographically Weighted Regression (G...
- [[spgwr(旧):http://spatial.nhh.no/R/gwr/]]
--[[GEOGRAPHICAL STATISTICS & THE GRID:http://www.casa.uc...
**[[gwrr:http://cran.r-project.org/web/packages/gwrr/gwrr...
**[[gwr:http://www.ncl.ac.uk/~ngeog/GWR/]] [#m4b75c1b]
-[[もう一つの R 用 GWR:http://ncg.nuim.ie/ncg/GWR/softwar...
**[[GWmodel: Geographically weighted models:http://cran.m...
**MGWR 混合地理的加重回帰 [#c98319d3]
--[[mixed geographically weighted regression model:https:...
**BayesX: R Utilities Accompanying the Software Package B...
**地理的加重判別分析 [#gb3ed956]
multinom in nnet パッケージ
**gwrr: Fits geographically weighted regression models wi...
**GWR 関連リンク [#p62652dc]
-[[Geographically Weighted Regression:http://gwr.nuim.ie/]]
-[[空間データのための回帰分析@Hiroshima.R:http://www.slid...
*WSAF（加重空間適応フィルタ） [#cae5d392]
*ベイズ [#n7424093]
-[[spBayes:http://blue.fr.umn.edu/spatialBayes/]]
階層型空間モデリングパッケージ
-[[spatialprobit: Spatial Probit Models:http://cran.rstud...
*空間フィルタリング [#k8b58bfb]
-[[Spatial Filtering Workshop:http://www.spatialfiltering...
--spdep の SpatialFilter 関数
**参考 [#wc23f8d5]
-[[SPATIAL STRUCTURE AND SPATIAL INTERACTION: 25 YEARS LA...
る。Minitab/SAS/Fortran/R のコード(maptools/spdep)
-[[SAM(Spatial Analysis in Macroecology:http://www.ecoevo...
- SAS, Matlab 用ツールもあり
- [[Spatial Filtering in ArcGIS with a little help from S...
-[[Spatial Methods:http://www.iccs.org.uk/docs/Spatial%20...
*空間的拡散 [#f46a8ff7]
-Walmart
--[[Walmart Invasion:http://bayesianbiologist.com/2012/08...
--[[Three ways of visualizing the growth of Walmart:http:...
*空間データマイニング [#k69b5443]
**空間データベースとの接続 [#n6d4d4e5]
[[RODBC]] 経由
***PostgreSQL/PostGIS [#q9fe580c]
[[RとPostGIS]]
-RODBC 経由~
--[[空間ウェイトマトリックス作成例:https://www.stat.math....
-Rdbi/RdbiPgSQL
***MySQLの空間エクステンション [#j2debf70]
[[RMySQL]]パッケージ。
[[MySQLは4.x より空間データをサポートしている:http://de...
***SQLITE の空間ＤＢエンジン [#h21d7bb8]
-RSQLite: [[SpatiaLite:http://www.gaia-gis.it/spatialite-...
*WebGIS [#jdb02493]
-[[小地域データにおける地理統計解析とSVGによる可視化:http...
-[[GoogleMapsを用いた地理統計データの可視化:http://www.is...
-[[R で GeoWeb:http://giswin2.geo.tsukuba.ac.jp/mapfish/M...
-[[シェープから SVG に変換:https://stat.ethz.ch/pipermail...
*ESDA(探索的空間分析) [#t4d2ec1c]
-[[GeoXp:http://w3.univ-tlse1.fr/GREMAQ/Statistique/geoxp...
分析結果（モランプロット、バリオグラムクラウド、ローレ...
-[[Visualizing Data Patterns with Micromaps:http://www.cr...
-rgr: The GSC Applied Geochemistry EDA Package
*SMALL AREA ESTIMATION [#u52a23ad]
-経験ベイズ
--empbaysmooth in DCluster
-[[SAE(Software for small-area estimation):http://www.bia...
--[[Tutorial: Small Area Estimation with R at useR! 2008:...
*時間地理学 [#ha024ed8]
-[[geolabs:http://geolabs.wordpress.com/]] Time Geography
--GPS を利用
---[[R: Interactive 3D WebGL plot of time-space cube with...
*時空間分析 [#i4eb0b6b]
-[[CRAN Task View: Handling and Analyzing Spatio-Temporal...
-[[spacetime:http://cran.md.tsukuba.ac.jp/web/packages/sp...
-[[Spatio-temporal data analysis in R and links to GIS:ht...
-[[Manipulating Spatio-temporal Environmental Data in R u...
*空間的マイクロシミュレーション [#n9f40f08]
-[[sms:http://cran.r-project.org/web/packages/sms/]]
--[[R library for spatial microsimulation:http://www.dimi...
*リモセン [#xb0a116d]
-[[unsupervised classification of a Landsat image in R: t...
*GISソフトウェアとの接続・統合 [#k72225c5]
R(D)COM や RServe およびその他のソフトを利用したものを...
**ArcGISのVBAよりR(D)COM経由でRの各空間分析パッケージを使...
[[VBAによるArcGISプログラミングガイド:http://www.amazon...
[[ArcGIS で R]]
**Grass GIS [#ie91bf73]
-[[R と GRASS GIS]]
-[[GRASS and RStat:http://josef.fsv.cvut.cz/WIKI/grass-os...
-[[GRASSとＲを用いたリモートセンシング情報と家畜の空間行...
** RPyGeo: Python 経由で、R で、ArcGIS のジオプロセッシン...
**[[SDAM 空間データ分析マシン:http://giswin.geo.tsukuba.a...
GeoComputaion用。R(D)COM と JCOMを使ってGeoTools(Java ...
現在新バージョンを開発中。
**[[歴史統計GeoWeb]] [#we2b648b]
Ajax + PHP + R
**[[Q(uantum) GIS:http://www.qgis.org]] との連動 [#f5e66d...
QGIS は Python をサポートしているので、この機能を使って R...
最近活動が活発になっているようだ。
-[[BridgeToR - Quantum GIS Wiki:http://wiki.qgis.org/qgis...
-[[R-QGis Data Transfer:http://wiki.qgis.org/qgiswiki/R-Q...
-[[Qgis Basic Stats Plugin:http://www.maths.lancs.ac.uk/~...
-[[manageR:http://www.geog.uvic.ca/spar/carson/]] R を使...
-[[Arlat - RapLoa Analysis Tool:http://www.maths.lancs.ac...
空間疫学関係の分析システム。Rpy(Python) を利用して QGIS...
-[[FOSS4G2007の発表:http://www.foss4g2007.org/presentatio...
-[[スライド:http://www.foss4g2007.org/presentations/viewa...
-[[プログラムソース:http://www.maths.lancs.ac.uk/Software...
-[[参考文献:http://www.bepress.com/cgi/viewcontent.cgi?ar...
-[[QGIS and Python and R and statistics from QGIS Blog:ht...
**[[DIVA GIS:http://udig.refractions.net/gallery/cgiar/]]...
Eclipse のRCPを利用したオープンソース GIS、uDig のプラ...
*地理空間情報ウェブサービスとの連携 [#x6a3bc44]
**[[R で GeoWeb]] [#dbc8e286]
**地図画像 [#m7ebca3d]
-WMS(Web Mapping Service)
rogr, RCURL
**空間データ取得 [#k78ff687]
-WFS
rogr, RCURL
-[[Web Maps:https://r-forge.r-project.org/projects/webmap...
-SOS
--[[SOS4R:http://giv-wikis.uni-muenster.de/agp/pub/Main/S...
**分散型ジオプロセッシング [#x6d4f5e1]
-WPS(Web Processing Service)
[[INTMAP(Interoperability and Automated Mapping):http:/...
**空間パネルモデル [#x1b56eb5]
-[[splm: econometric analysis of spatial panel data:http:...
--[[ドキュメント:http://www.agrocampus-ouest.fr/math/useR...
**空間分析のための並列計算 [#j75cfa88]
-[[Parallel Computing for spatial data analysis:http://ge...
**FlowViz [#g66fe288]
-[[Great circles, raster, sp and lattice:http://www.r-blo...
-[[Mapped: British, Spanish and Dutch Shipping 1750-1800:...
-[[Automating great-circle map production in R:http://sta...
-[[USING GREAT CIRCLES AND GGPLOT2 TO MAP ARRIVAL/DEPARTU...
**Mapping Tips [#vc0c9b74]
-[[半透明地図の重ね合わせ:https://stat.ethz.ch/pipermail/...
*Open Data Hack [#j47121f8]
-[[An exercise in R using local open data:http://chrislad...
*Google Earth/KML による可視化 [#w1d311d0]
-[[plotKML:http://plotkml.r-forge.r-project.org/]] プリズ...
-[[R2G2: Converting R CRAN outputs into Google Earth:http...
--[[Displaying Your Data in Google Earth Using R2G2:http:...
*順位・規模の法則、ランク・サイズルール [#uc211c8d]
-[[City Size and SUHI:http://www.r-bloggers.com/city-size...
*アニメーション [#rc1845aa]
-[[MORTALITY RATE OF CHILDREN UNDER 5 AND GENDER DIFFEREN...
-[[Generate GIS integrated animation:Gun deaths animation...
-[[Animated map of 2012 US election campaigning, with R a...
-[[Animated choropleths using animation, ggplot2, rCharts...
*フィールドワーク [#md0de208]
-[[Displaying spatial sensor data from Arduino with R on ...
*書籍（オンラインも含む） [#rccebc22]
+Springer より、R を使った空間統計の本(Bivand, R. S.(sp, ...
)が2008/09出版。
--[[One-day introductory course on Spatial Data Analysis ...
小地域推定（Small Area Estimation）など
+Crawley, M. J. :[[The R Book:http://as.wiley.com/WileyC...
+[[Spatial Statistical Data Analysis for GIS Users:http:/...
+古谷知之著[[『Rによる空間データの統計分析』:http://www.a...
--[[空間の統計学, ESTRELA 2009年8月〜2010年7月 :http://we...
+[[Displaying time series, spatial and space-time data wi...
+[[Introduction to visualising spatial data in R:http://e...
+ Brunsdon, C. , Comber, L.(2015):[[An Introduction to R ...
*関連情報 [#x00297bb]
-[[R Spatial Projects:http://sal.uiuc.edu/csiss/Rgeo/]] R...
-[[R-sig-Geo:https://stat.ethz.ch/pipermail/r-sig-geo/]] ...
-[[newsgroup のアーカイブ:http://news.gmane.org/gmane.com...
-[[r-spatial-devel:http://sourceforge.net/mail/?group_id=...
-[[r-spatial:http://sourceforge.net/projects/r-spatial/]]...
-[[aRT - API R-TERRALIB:http://www.est.ufpr.br/art/]] INP...
-[[Geographic Data Analysis Using R:http://geography.uore...
-[[地理空間分析のためのベクタデータモデル共通基盤 - sp パ...
-pgirmess: 生態学のデータ分析 というのにもいくつか入って...
-[[Spatio-temporal data analysis in R and links to GIS:ht...
-[[Review of Cluster Analysis Software:http://www.naaccr....
-[[Ecology and epidemiology in R: Spatial analysis:http:/...
-[[Analysing spatial point patterns in 'R':http://www.csi...
-[[Political Science 867 Spatial Modeling Winter 2005:htt...
-[[QGIS Labs:http://www.plantsciences.ucdavis.edu/plant/q...
--Lab 6 基本属性データ操作
--Lab 7 R を用いた QGIS の機能補完
--Lab 8 空間補間
--Lab 9 QGIS へのデータの取り込み方法
--Lab 10 属性と位置の結合
-[[R Wiki の空間データ tips:http://wiki.r-project.org/rwi...
-[[An educational resource about spatial statistics and g...
-[[e-workshop on spatial analysis with R 2009/01-03:https...
-[[Marine Geospatial Ecology Tools:http://code.env.duke.e...
-[[rgis:http://r-forge.r-project.org/projects/r-gis/]]
以下のパッケージを開発中。
--gdistance:GIS
--raster:ラスター型データ処理
--remotesensing:リモセン
--cropsim および dismo:生物多様性。
-[[R-Forge の空間データと統計のサイト:http://r-forge.r-pr...
--[[空間データクラス:http://r-forge.r-project.org/softwar...
--[[疾病地図化と空間データ分析:http://r-forge.r-project.o...
--[[生態学分析:http://r-forge.r-project.org/softwaremap/t...
--[[点分布分析:http://r-forge.r-project.org/softwaremap/t...
--[[空間データの入出力:http://r-forge.r-project.org/softw...
--地球統計
-[[Hydrology in R:http://source.ggy.bris.ac.uk/wiki/Hydro...
R を使った水文学分析の事例。パッケージ（TOPMODEL 、RHy...
-[[R-Project spatial statistics software packages:http://...
-[[R による空間分析図例集:http://r-spatial.sourceforge.ne...
-[[PySAL:http://geodacenter.asu.edu/pysal]] 空間計量経済...
-[[spatial-analyst.net:http://spatial-analyst.net/wiki/in...
--[[GEOSTAT 2011:http://www.uni-koblenz-landau.de/landau/...
--[[GEOSTAT 2012 Munster:http://geostat-course.org/Muenst...
--[[GEOSTAT 2013 Quebec City:http://geostat-course.org/Qu...
-[[An alternative approach for object oriented classifica...
-[[Introduction to Applied Spatial Analysis :https://www....
-[[Geospatial Use Cases and Case Studies:http://www.nceas...
-[[Geospatial Data Processing in R Geospatial Data Proces...
-[[dylan's blog:http://casoilresource.lawr.ucdavis.edu/dr...
-[[GEOGRAPHY AND REGIONAL DEVELOPMENT:http://www.ic.arizo...
--[[GEOGRAPHY AND REGIONAL DEVELOPMENT 657:http://www.ic....
-[[Geographic Information Systems (GIS) in Public Health ...
-[[Open Source/Non-Commercial GIS Products:http://www.spa...
-[[Using open source Geographical Information Systems and...
-[[Open Source Geospatial Software - an Introduction Spat...
-[[R Spatial Tips:http://rspatialtips.org.uk/]] R Spatial...
-[[Spatial Analysis | Spatial data visualisation, analysi...
--[[Improved Tree Maps with R:http://spatialanalysis.co.u...
-[[R で空間統計:http://blogs.yahoo.co.jp/shohei_tokyo_198...
-[[Workshop Applied Spatial Statistics in R:http://www.pe...
-[[Spatial data and GIS (Geographical Information Systems...
-[[日本地図を描く（japan_ver62.shpから）:http://www.eeso....
-The Big List Of Free GIS Programs ? S Through Z
--[[A Through H:http://freegeographytools.com/2008/the-bi...
--[[I Through M:http://freegeographytools.com/2008/the-bi...
--[[ N Through R:http://freegeographytools.com/2008/the-b...
--[[S Through Z:http://freegeographytools.com/2008/the-bi...
-[[R GIS:http://www.geopacific.org/opensourcegis/r/r-gis]]
-[[StarSpan:http://starspan.projects.atlas.ca.gov/doku/do...
-[[Function to Collect Geographic Coordinates for IP-Addr...
-[[Before, During and After: The Richest 1 Percent:http:/...
-[[Berlin's children:http://factbased.blogspot.com/2012/0...
-[[Great Maps with ggplot2:http://spatialanalysis.co.uk/2...
-Maps with R
--[[(I):http://www.r-bloggers.com/maps-with-r-i/]]
--[[(II):http://www.r-bloggers.com/maps-with-r-ii/]]
--[[(III):http://www.r-bloggers.com/maps-with-r-iii/]]
-[[Creating beautiful maps:http://www.r-bloggers.com/crea...
-[[The undiscovered country – a tutorial on plottin...
-[[Coming of Age:R and Spatial Data Visualisation:http://...
-[[GME - Geospatial Modeling Environment:http://www.spati...
--[[r.deldir:http://www.spatialecology.com/gme/rdeldir.ht...
-[[R Maps@theBioBucket*:http://thebiobucket.blogspot.jp/s...
-[[3D Maps in R:http://r-nold.blogspot.jp/2012/06/talking...
-[[Notes from A Recent Spatial R Class I Gave:http://dave...
-[[Gis and r:http://wiki.osgeo.jp/index.php/Gis_and_r]]
-[[Using R as a GIS:https://sites.google.com/site/rodrigu...
-[[R Analytical Environment:http://www.nceas.ucsb.edu/sci...
-Wine MAP
--[[Napa Valley wine tasting map: interactive version:htt...
--[[The World Wine Web:http://geospaced.blogspot.co.uk/20...
-[[Mapping Bike Accidents in R:http://bayesianbiologist.c...
-[[Spatial data in R:http://r-spatial.sourceforge.net/]] ...
-[[rasterVis to the rescue:http://www.r-bloggers.com/rast...
-[[Watch Sandy in “R” (Including Forecast Cone):http://ru...
-[[Modis R: Package tutorial:http://www.r-bloggers.com/mo...
-[[Mapping Current Average Price Per Sqft for Rentals by ...
-[[Read and write ESRI Shapefiles with R:http://www.nceas...
-[[Earthquakes Over the Past 7 Days:http://statistical-re...
-[[Mapping Primary Care Trust (PCT) Data:http://blog.ouse...
-[[Visualizing Baltimore 3.1: Crime and Vacant Properties...
-[[US State Maps using map_data():http://is-r.tumblr.com/...
-[[Creating 2011 Census Output Area Change Maps Using R:h...
-Maps in R
--[[Introduction - Drawing the map of Europe:http://www.m...
--[[Plotting data points on a map:http://www.milanor.net/...
--[[choropleth maps:http://www.milanor.net/blog/?p=634]]
-[[Measuring the Gerrymander with spatstat:http://is-r.tu...
-[[Convert OpenStreetMap Objects to KML with R:http://the...
-[[R Video tutorial for Spatial Statistics:http://r-video...
-[[Earthquakes in Netherlands:http://wiekvoet.blogspot.jp...
-Twitter
--[[Twitter Languages in New York:http://spatialanalysis....
--[[The arteries of the world, in Tweets:http://blog.revo...
-[[Computing Maritime Routes in R:http://freigeist.devmag...
-[[http://github.com/jasondavies/conrec.js:http://www.r-b...
-[[Using R ― Working with Geospatial Data:http://mazamasc...
-[[Biodiversity Visualizations using R:http://vijaybarve....
-[[Stamen maps with spplot:http://procomun.wordpress.com/...
-[[A Shiny web app to find out how much medical procedure...
-[[BISON USGS species occurrence data:http://schamberlain...
-[[Dialect Survey Results:http://spark-1590165977.us-west...
-[[R2leaflet (v0.1) – make interactive online maps ...
-[[More code and images from “Displaying time series, spa...
-[[ggplot2 Choropleth of Supreme Court Decisions: A Tutor...
-[[Loading Multiple Shapefiles to the R-Console Simultane...
-[[R でGIS:http://www.slideshare.net/hoshida/rgis]]
-[[Thirteen lines of code:http://www.milanor.net/blog/?p=...
-[[R: Mapping Super Typhoon Yolanda (Haiyan) Track:http:/...
-[[Introducing CrimeMap – A Web App Powered by Shin...
-[[Tim Hortons Density:http://rmflight.github.io/posts/20...
-[[R Spatial Cheatsheet:http://www.maths.lancs.ac.uk/~row...
-[[Creating an Interactive Map of Craft Breweries in VA U...
-[[Mapping every IPv4 address:http://datadrivensecurity.i...
-[[List of spatial analysis software:http://en.wikipedia....
終了行:
COLOR(red){SIZE(30){RでGIS}}
ここでは、Rによって実現できるGIS(地理情報システム)とい...
#contents
*地図パッケージ [#hf842fc3]
** ベクトル型 [#y7d974a1]
- [[Rmapを使った地図表示]]
- [[maptools で地図表示]]
- sp
- maps
- RArcInfo
- gmt: GMT 4.0 へのインターフェース
**ベクトル/ラスター型 [#tf8157c4]
- [[rgdal(GDAL(Geospatial Data Abstraction Library, 地理...
*空間データ [#x669e88e]
//**ポータルサイト [#m728bb6f]
//-[[The National Map Seamless Server:http://seamless.usg...
// 画像、ＤＥＭ等。ベクターデータ（ＵＳＡのみ）。
//-[[カナダ バンクーバー市:http://data.vancouver.ca/]] ...
** シェープファイル & KML & E00[#xdc0ca93]
- 世界
//-- [[DataServer:http://biogeo.berkeley.edu/bgm/gdata.ph...
-- [[Shapefiles for Epi Info:http://www.cdc.gov/epiinfo/s...
--[[SALB - Administrative boundaries:http://www.unsalb.or...
--DCW
--[[FAO GeoNetwork:http://www.fao.org/geonetwork/]] 検索...
--[[Global Administrative Areas:http://www.gadm.org/count...
---[[R 関連情報:http://www.gadm.org/node/346#comment-133]]
---[[Provincial Map using GADM:http://r-nold.blogspot.jp/...
--[[Natural Earth:http://www.naturalearthdata.com/]] 行政...
--OSM:Open Street Map --- Croudsourcing で作成された空間...
---[[CloudMade:http://downloads.cloudmade.com/]]
--[[Free GIS Datasets:http://freegisdata.rtwilson.com/]]
--[[cshapes:http://cran.r-project.org/web/packages/cshape...
[[解説:http://journal.r-project.org/archive/2010-1/RJou...
--[[UNEP の原子力発電所データセット(E00):https://stat.eth...
--[[http://www.diva-gis.org/Data]]
- 日本
--[[地図で見る統計（統計GIS）:http://www.e-stat.go.jp/SG1...
シェープファイル形式の町丁字界とCSV形式の人口・世帯デー...
--地球地図
--- [[地球地図日本:http://www.gsi.go.jp/kankyochiri/gm_jp...
-- [[国土交通省 国土数値情報:http://nlftp.mlit.go.jp/ksj...
---各種の情報があるが、市区町村界は、昭和２５年から、５年...
---[[国土数値情報 土地利用細分メッシュデータ(昭和51年度...
---小学校区（コミュニティの単位として）
---流動データ：パーソントリップ
---シェープファイル形式が用意されていないものは、[[変換ツ...
---[[土地分類調査・水調査:http://tochi.mlit.go.jp/tockok/...
--環境省
---[[第６回・第７回自然環境保全基礎調査 植生調査:http://...
--[[地震ハザードステーション:http://www.j-shis.bosai.go.j...
- 中国
-- [[400万分の１ - 行政界の中心点・行政界（県(county)以上...
-- 上記のデータを使った chinamap という R パッケージが公...
- アフガニスタン
--[[Afghan War Diary, 2004-2010:http://wikileaks.org/wiki...
---[[Wikileaks Attack Data by Year and Type Projected on ...
R のソースコードあり
- アメリカ合衆国
--[[geodata.gov - U. S. MAPS & DATA:http://gos2.geodata.g...
-- [[連邦政府各機関が提供するデータの総合サイト:http://da...
-- [[アメリカ地質調査所のナショナルアトラス（国勢地図帳）...
-- ESRI - Geography Network
-- アメリカセンサス局
---[[2007 TIGER/LineR Shapefiles:http://www.census.gov/ge...
--[[The US National Historical GIS:http://www.nhgis.org]]...
--[[Atlas of Historical County Boundaries:http://publicat...
--[[Washington DC Data Catalog:http://data.dc.gov/]] Shap...
-カナダ
-- [[道路ネットワークデータ:http://www.statcan.gc.ca/mgeo...
--ブリティッシュコロンビア州ヴァンクーヴァー市 [[Open Da...
--オンタリオ州[[トロント市:http://www1.toronto.ca/wps/por...
--Ottawa
--Edmonton
--[[ケベック州:http://donnees.gouv.qc.ca/?node=/accueil]]
---[[ケベック市:http://donnees.ville.quebec.qc.ca/]]
--ポータルサイト
-ハイチ
--[[HaitiData.org:http://haitidata.org/]]
-ヨーロッパ
--[[EEA(欧州環境庁) Data Service:http://dataservice.eea.e...
--[[Corine land cover2000:http://terrestrial.eionet.europ...
-イギリス
--[[http://www.sharegeo.ac.uk/]]
---[[Amateur Mapmaking: Getting Started With Shapefiles:h...
--[[イングランド・ウェールズ歴史的カウンティ(historic cou...
--[[OS Open Data :https://www.ordnancesurvey.co.uk/openda...
シェープファイル形式(行政界)、ポイントデータ(CSV),等高...
--[[Ordnance Survey Opendata:http://wiki.openstreetmap.or...
--[[John Snow のロンドン・ソーホーにおけるコレラの感染地...
---[[John Snow’s Cholera data in more formats:http://blog...
---[[John Snow’s famous cholera analysis data in modern G...
--[[Open Geoscience イギリス地質調査所の地質図:http://www...
--[[Census 2012:http://www.ons.gov.uk/ons/guide-method/ge...
---[[2011 CENSUS OPEN ATLAS PROJECT:http://www.alex-singl...
-フランス
--[[フランス国土地理院:http://www.ign.fr/rubrique.asp?lng...
--パリ市
-イタリア
-- [[イタリア国家統計局:http://www.istat.it/it/strumenti/...
- オーストラリア
--[[GeoScience Australia:https://www.ga.gov.au/products/s...
行政界、DEM、地形、環境、地質、地球物理、地球化学、地質...
- ニュージーランド
ニュージーランドは公的な空間データがフリーになる模様
-- [[Statistics New Zealand’s Digital Boundaries and stan...
--[[Mapping New Zealand - a summary:http://blog.thematicm...
-南極
--[[南極の地理空間情報データ:http://antarctic.gsi.go.jp/i...
**変換ツール [#fc91ce5b]
-数値地図のデータ形式がXML(JPGIS)形式に変更されたためか、...
-[[国土地理院:http://fgd.gsi.go.jp/download/]]から基盤地...
**ラスター [#ac466938]
***[[USGS EarthExplorer:http://edcsns17.cr.usgs.gov/Earth...
***[[地球環境データセット:http://spatial-analyst.net/wiki...
-地形・行政界
--標高・地形
--行政界
--社会経済
--水資源
-ウエブサービスによるもの
-リモセン画像
-主題図（派生データ）
***DEM（数値標高モデル） [#a82efae1]
-[[基盤地図情報@国土地理院:http://www.gsi.go.jp/kiban/ets...
-[[ASTER全球3次元地形データ:http://www.gdem.aster.ersdac....
--[[Global Multi-resolution Terrain Elevation Data 2010 (...
-UK
--[[LIDAR Digital Surface Model:http://data.gov.uk/datase...
-USA
--[[Open Topography:http://www.opentopography.org/index.p...
-NZ
--[[geographx のフリーでＤＬできるDEM:http://www.geograph...
***[[国土地理院火山地形分類データファイル:http://www1.gsi...
***NOAAの夜間照明（画像）TIFF 形式 [#q055e336]
-[[Version 4 DMSP-OLS Nighttime Lights Time Series:http:/...
-[[Nightlights:http://stevemosher.wordpress.com/2010/10/0...
//***地球の月 [#k28713f4]
//-かぐやのデータ２００９年１１月公開予定
***LANDSAT [#se378509]
-landsat@CRAN
**属性データ [#xa67723f]
[[GISで利用可能なRパッケージ内データ]]
-アメリカ
--UScensus2000
---[[US Census Spatial and Demographic Data in R: The USc...
--人口移動
---[[IRS(アメリカ合衆国内国歳入庁) の州間およびカウンティ...
----[[Great Circles US IRS Migration mapping:https://stat...
---[[カウンティ間の労働者の移動データ(2006-2009):http://u...
-イギリス
--[[data.gov.uk:http://data.gov.uk/]] ポータルサイト。GIS...
--[[census 2011 key statistics and quick statistics bulk ...
-[[Census Open Atlas Project Version Two:http://www.r-blo...
*lattice パッケージを使った地図表示 [#c8f99c9a]
http://dsarkar.fhcrc.org/lattice/book/figures.html に多...
**latticeExtra パッケージを使った地図表示 [#y1f3f043]
-[[Customizing Maps in R: spplot() and latticeExtra funct...
sp, gstat
*GPS [#v6af9871]
-[[gpsbabel を利用:https://stat.ethz.ch/pipermail/r-sig-g...
-maptools の readgps 関数。GPSBabel 経由のデータ読み込み。
-[[Stay on track: Plotting GPS tracks with R:http://rcras...
*シェープファイルの新規作成 [#ga9d885a]
-[[[R-sig-Geo] How to create a SpatialPolygonsDataFrame o...
-座標値を含むCSVファイルよりポイントシェープファイルの作成
library(maptools)
d<-read.csv(ファイル名)
coordinates(d)<-c("X座標属性名","Y座標属性名")
writeShapePoints(d,"シェープファイル出力ファイル")
*地図投影変換 [#gdaadb8c]
**rgdal [#g3724558]
**[[proj4(PROJ.4 地図投影変換ライブラリ簡易インターフェー...
[[投影法のパラメータが検索できるサイト:http://spatialre...
*等値線図 [#s9d2c7c4]
**[[シェープファイルへの変換:https://stat.ethz.ch/piperma...
ContourLines2SLDF(maptools) 関数で変換して、writeOGR(rg...
*総描 [#bc56d839]
**幾何図形の簡略化 [#id758bb5]
-gSimplify@rgeos
**ラインの簡略化（単純化） [#y71eee53]
-maptools パッケージの thinnedSpatialPoly 関数 --- ポリゴ...
-PBSmapping パッケージの thinPolys 関数 --- ポリゴンのラ...
-shapefiles パッケージの dp 関数 --- ラインの簡略化
-[[Alpha Shapes to Polygons:http://rpubs.com/geospacedman...
*ラベル配置 [#xbe79e7a]
-[[Label placement with spplot and lattice:http://procomu...
*住所照合 [#x9a72bb0]
-gooJSON の gooadd & goomap 関数
#位置（地理座標（緯度）を求める）
uci.add <- gooadd(address=list("千代田区内幸町"))
goomap(uci.add, key="Google Key")
goomap(paste(140,40,sep=","), key="Google Key")
#住所（地理座標（緯度）より求める）
*空間検索 [#z70818d5]
**rgeos [#d74f5ca3]
GEOS パッケージを利用しているので、主要機能をカバーして...
**重心 [#x9b56c6b]
- maptools パッケージ get.Pcent 関数
- PBSMappingパッケージの calcCentroid 関数
-[[Compute Polygon Centroids Using R :http://www.nceas.uc...
**ポリゴンの面積 [#x7e84e41]
- splancs パッケージ areapl 関数
- gpclib パッケージ area.poly 関数(hole のあるポリゴン対応)
- PBSMappingパッケージの calcArea 関数
**最近接点 [#rf57fef7]
- splancs パッケージ n2dist 関数
- [[１つのポイントセットに別のポイントセットの最近接点を...
-spatstat パッケージの nncross 関数
*** K-NN [#c980f3f0]
- spdepパッケージのknearneigh関数
***任意のポイントに近接するラインとの距離と交点 [#xb8c9253]
-dist2Line@geosphere ラインの特定は要プログラミング
***近接するポリゴン情報取得・・・Dorling のカルトグラムや...
- [[シェープファイルよりポリゴンの近隣情報を取得する R ス...
**ポイント・イン・ポリゴン [#ae2483b6]
- sp パッケージ point.in.polygon 関数
- splancsパッケージ inpip , inout 関数
- splancsパッケージ point.in.polygon 関数
**任意のポリゴンに隣接するポリゴン数 [#rf4c9274]
- spdepパッケージ
**空間インデックス [#d388788c]
-[[SearchTrees:http://cran.at.r-project.org/web/packages/...
-gstat パッケージの predict.gstat 関数が内部で4分木（quad...
*空間解析 [#ff494701]
**ポリゴン・オーバーレイ解析 [#v6ec5f2f]
--[[rgeos:http://cran.at.r-project.org/web/packages/rgeos...
gpclib の代替として、[[GEOS:http://trac.osgeo.org/geos/...
Maptools の一部の関数でも利用できる。
libray(stringr) と、"stringr"パッケージを明示的にインス...
--[[Map overlay and spatial aggregation in sp:http://cran...
---[[Google Summer of Code '2010 R:http://gsoc2010r.wordp...
- CRAN の gpclib パッケージ。[[gpclib(R用汎用ポリゴン・...
- spgpc
- PostGIS(RODBC経由)
--PBSMappingパッケージの joinPolys 関数
-[[Spatial Overlays with R - Retrieving Polygon Attribute...
-[[Follow Up on Spatial Overlays with R – Getting A...
**ポリゴンの三角形分割 [#va174fa1]
-deldir
-gpclib
**凸包 [#d4899a31]
-CRAN の tripack パッケージ
-PBSMappingパッケージの calcConvexHull 関数
**TIN [#y5449946]
CRAN の tripack パッケージを利用([[tripack(不規則な間隔...
-deldir
--[[Voronoi polygons with R:http://www.carsonfarmer.com/?...
-[[misc3d(雑多な３Ｄプロット)パッケージ中のオブジェクト一...
**ボロノイ [#h99af677]
-CRAN の tripack パッケージ
--[[tripack を使った六角形グリッドの生成:http://article.g...
-CRAN の deldir パッケージ
--[[deldir を使った六角形グリッドの生成:http://article.gm...
-PBSMappingパッケージの calcVoronoi 関数
-[[擬似ボロノイ（指数の内積および距離の平方によるバイアス...
-voronoi パッケージ(deldir 利用)
-[[Images as Voronoi tesselations:http://is-r.tumblr.com/...
*空間サンプリング（標本化） [#nf40483f]
-sp パッケージの spsample 関数.ライン、ポリゴンおよびグリ...
-splancs パッケージ.spsample より高度な手法をサポートする...
-[[PSURVEY.DESIGN:http://www.epa.gov/nheerl/arm/analysisp...
EPAが開発。近くCRANからも入手可能。
-[[Grid size calculator:http://spatial-analyst.net/wiki/i...
*空間内挿・サーフェス（平滑化） [#r13ab5fa]
**ローパスフィルター [#i42c03e6]
-[[Function to smooth grids using n x n window moving ave...
**スプライン [#raf91525]
-akima
-fields
薄板スプライン(Tps関数)
-MBA(CRAN)
マルチレベルＢスプライン [[MBA パッケージ(マルチレベル ...
**カーネル密度推定法 [#p8e94983]
-[[spatialkernel パッケージ:http://cran.okada.jp.org/src/...
--多変量空間点過程における空間隔離のノンパラメトリック推定
***属性なし [#icb95366]
-MASS パッケージの kde2d 関数
-kde3d 3次元カーネル密度推定計算 in misc3d パッケージ
-density 関数
--[[density+spatstat による例:https://stat.ethz.ch/piperm...
-sm パッケージ
***属性あり [#df81e7ca]
-fields パッケージの smooth.2d 関数
-GeoXp パッケージの densitymap 関数。ESDA対応。
--Laurent, T., A. Ruiz-Gazen, and C. Thomas-Agnan, [["Geo...
-sm パッケージ
--[[Clipping a Surface By a Polygon:http://www.r-bloggers...
**Kriging [#df0c3770]
-[[automap: Automatic interpolation package:http://cran.r...
--[[Automatic spatial interpolation with R: the automap p...
***シェープファイルへの変換方法 [#c674fabc]
[[Unexpected parameter problem using rsaga.geoprocessor()...
***[[Kernel Density With Lines:http://r-sig-geo.2731867.n...
**クリギング [#wdf10ee3]
-fields
-gstat
-[[automap:http://intamap.geo.uu.nl/~paul/Downloads.html]...
-[[GRASS GIS と R の gstat パッケージを使ったクリギングの...
-[[Hurricane Sandy Land Wind Speed and Kriging:http://sta...
** 傾向面 [#scc3a5b6]
*** グローバル [#d5165cff]
- spatial パッケージ surf.ls 関数
*** ローカル [#vb816d38]
- stats パッケージ loess 関数
-- ヴェナブルズ他『S-PLUS による統計解析』、シュプリンガ...
**Pycnophylactic Interpolation(密度保持？内挿) [#g5f082c1]
-pycno
--[[Smooth pycnophylactic interpolation for geographical ...
--[[A combined pycnophylactic-dasymetric method for disag...
**[[intamap: procedures for automated interpolation:http:...
*カルトグラム [#p39b8f45]
**連続型面カルトグラム [#tf9d1331]
-[[Rcartogram:http://www.omegahat.org/Rcartogram/]].
[[ソースコード:http://www.omegahat.org/Rcartogram/Rcartog...
--[[利用例:http://www.stat.purdue.edu/~mdw/490M/indianama...
--ダニエル・ドーリング/マーク・ニューマン/アンナ・バーフ...
library(spdep)
library(cart)
example(columbus)
cartc<-cartogram(columbus["CRIME"])
cartcj <- SpatialPolygonsDataFrame(cartc, columbus@data,...
plot(cartcj)
-[[Worldmapper:http://www.worldmapper.org/index.html]] 上...
-[[cart@r-forge:https://r-forge.r-project.org/R/?group_id...
--座標が保持されない
--[[Rでカルトグラムを作る:http://d.hatena.ne.jp/dichika/2...
**非連続型面カルトグラム [#ub1691fd]
-[[Rmapを使った地図表示]]に実行例あり。
-state.carto@maps - アメリカの州別人口カルトグラム
**Dorling の円カルトグラム [#f25ff182]
隣接するポリゴンが共有する辺の長さを求める必要があり、rg...
~または、他のサイトに例のある Forced Based Direction Algo...
-参考になるのかもしれない例
--[[Plotting non-overlapping circles...:http://grrrraphic...
--[[Circle packing with R:http://lastresortsoftware.blogs...
**MDS(多次元尺度構成法)による距離行列(時間距離(時間地図)...
-stats パッケージの cmdscale(古典的 (計量) 多次元尺度構成...
利用例
data(eurodist) #ヨーロッパの主要都市間の距離行列
loc<-cmdscale(eurodist) #MDS の計算
plot(loc) #座標のプロット
text(loc,names(eurodist),col="red") #都市名の表示
#ref(eurodist_mds.png)
図 ヨーロッパの主要都市間の距離行列からの各都市の位置の...
-INDSCAL: SensoMineR
-[[ALSCAL:http://www.cuddyvalley.org/psychoR/]]
-参考リンク
--[[Rと多次元尺度法:http://www1.doshisha.ac.jp/~mjin/R/27...
--[[Multidimensional Scaling in Quick-r:http://www.statme...
**SOM を使ったカルトグラム [#kbd370bc]
**tree map の利用（実際の位置の表示ではない） [#ad544f7a]
**[[Comparing regions: maps, cartograms and tree maps:htt...
*フローデータ分析 [#g53d3f9c]
**人口移動分析 [#pd3e1f09]
-[[Using 'S' To Analyze Migration Tables:http://www.geog....
-[[Look Familiar? Mapping in R:http://0utlier.blogspot.jp...
アクセシビリティ(近接性) [#icde6ace]
-ポテンシャル図
--[[Rを用いての数量化理論�類の都道府県間人口移動へ...
**フードチェーン [#m91477a4]
-[[Reshaping Horse Import/Export Data to Fit a Sankey Dia...
**[[Look Familiar? Mapping in R:http://0utlier.blogspot.j...
*ネットワーク解析 [#ue5d1b7c]
** 最短経路探索 [#t4c0da45]
***指定ノード [#kaa85940]
---RGBL@BioConductorの関数
Dijkstra
*** 全ノードの最短経路探索 [#lcdba6d1]
---RGBL@BioConductorの関数
Floydのアルゴリズム
-- CRAN の e1071 パッケージ内の allShortestPaths および e...
ただし、数千ノードまで。Dijkstraではなく、Floydのアルゴ...
***位相構造をもたないシェープファイルでも、[[OpenJUMP:htt...
**[[shp2graph:https://r-forge.r-project.org/projects/shp2...
-[[Win Bin:https://sites.google.com/site/neugwr/r-package...
-[[Converting a spatial network to a graph in R:http://ww...
--[[slides:http://www.warwick.ac.uk/statsdept/user-2011/T...
***関連リンク [#c8f01019]
-[[Rでネットワーク解析とGIS:http://www.slideshare.net/Med...
***文献 [#oc56a8cc]
-[[観光分析 計量的アプローチと応用:http://www.kokon.co.jp...
**立地配分問題 [#h5877ed4]
--lpsolve等
--ボロノイ分割（評価）
tripack
--orloca: The package deals with Operations Research LOCa...
--BARD: よりよい自動化再配分
--[[Using R to visualize geo optimization algorithms:http...
--[[Using R to visualize geo optimization algorithms:http...
**巡回セールスマン問題 [#a01089ff]
--optim 関数のサンプル参照
--TSP パッケージ([[Concorde:http://www.tsp.gatech.edu/con...
--[[Combinatorial optimization with gaoptim package:http:...
**[[河川ネットワーク:http://rpubs.com/geospacedman/runnin...
**スタイナー木 [#r6d1d450]
-[[SteinerNet: Steiner Tree Approach for Graph Analysis:h...
要 limma from BioConductor
*ポイント・パターン分析 [#u8caa467]
[[Point pattern analysis packages on CRAN:http://www.sal....
**２次元 [#u09767b6]
-方格法
--spatstat
-最近隣法
--spatstat
-K関数法
--spatial パッケージ
-ユークリッド二次元回帰
--[[kernels, contours, points?:https://stat.ethz.ch/piper...
--[[BiDimRegression: Calculates the bidimensional regress...
-マーク付き点過程
--[[spatstat:http://www.spatstat.org/]]
--[[MarkedPointProcess:http://cran.r-project.org/src/cont...
-ads: 空間ポイントパターン分析 パッケージ
--[[ads(空間ポイントパターン分析)のバインディング)パッケ...
--[[Analysis of Spatial Point Patterns in R:http://www.st...
**１次元（道路上の点分布（インターチェンジ）など） [#x696...
-lpp 関数@spatstat
*セントログラフィ [#bcdf95e6]
-[[aspace(セントログラフィ統計量を推定する関数コレクショ...
*Spatial Scan Statistics [#p59181ed]
CRAN で入手できるDClusterでサポート。プレリリース版が公...
**GAM(Geograpgical Analysis Machine) [#na904a24]
DCluster の opgam 関数でサポート。GAM/K は GAM 結果にカ...
-[[Mapping Hotspots with R: The GAM:http://www.r-bloggers...
-[[Hot Spot Mapping in R: Illustrating Relative Seasonal ...
*地球統計(Geostatistics) [#b6a4074f]
[[Geostatistics packages on CRAN:http://www.sal.uiuc.edu/...
**[[simProto:http://bolmen.ethz.ch/~simsurvey/simsurvey/s...
GUIベースの地球統計を使った分析をおこなえる Web サイト(...
**[[A Practical Guide to Geostatistical Mapping:http://sp...
**[[RGeoS:http://cg.ensmp.fr/rgeos/]] rgeos とは別物。 [#...
**[[IntR – Interactive GUI for performing geostatis...
*地形解析 [#x886f8bc]
**Map Algebra or Cartographic Model [#bd0a13a9]
-raster パッケージ:@CRAN
--[[raster(地理データ分析・モデルリングのためのラスターデ...
// ダウンロードできない場合は R 内より、以下のコマンド...
// install.packages("raster", repos="http://R-Forge.R-pro...
---[[Terrain Attributes with the raster package:R Video t...
---[[reading raster data using library(parallel):http://m...
--[[R GIS: Terrain Analysis for Polygons as Simple as it ...
-[[geovec@r-forge:https://r-forge.r-project.org/R/?group_...
-[[RSAGA(R での SAGA ジオプロセッシングおよび地形解析)パ...
--[[Brenning, A.: Statistical Geocomputing combining R an...
-[[spsextante:http://r-forge.r-project.org/projects/spsex...
//**斜面計算 [#r89c7498]
//--[[斜面計算:https://www.msu.edu/~ashton/classes/866/no...
**自動地形分類 [#d5c4093e]
--[[R+ILWIS/SAGA で DEM の解析:http://spatial-analyst.net...
--[[Automated extraction of geomorphological features usi...
--[[R + SAGA + ILWIS + GRASS で地形計測:http://geomorphom...
--[[Terrain Classification Ideas: Coupling GRASS and R:ht...
-- [[Terrain Classification Experiment 2: GRASS, R, and t...
--[[Terrain Attributes with the raster package:Terrain At...
**地形シミュレーション [#d9dcdf2a]
***[[DEMsim:http://geomorphometry.org/view_scripts.asp?id...
***[[R/ILWIS SCRIPTS FOR GEOSTATISTICAL SIMULATIONS:http:...
**費用距離 [#ebf506c0]
-raster
-gdistance
**[[平均地形曲率推定 Using R and r.mapcalc (GRASS) to Est...
**[[地形表示用カラースキームパッケージ:http://r-forge.r-p...
--[[記事:https://stat.ethz.ch/pipermail/r-help/2009-Novem...
--[[解説:http://r-forge.r-project.org/plugins/scmsvn/view...
**Google Earth [#sff159dc]
-[[Use Case: Spatial R & Google Earth for Terrain Analyse...
**Natural Hazard [#g071cb75]
-[[Creating a map showing land covered by rising sea leve...
*空間的自己相関 [#lc5eb5d3]
CRAN の spdep パッケージを利用。[[spdep(空間従属性)パッ...
**空間ウェイト・マトリックス [#lfa29011]
***cshapes: CShapes データセット及びユーティリティー [#s0...
[[cshapes(CShapes データセット及びユーティリティー)パッケ...
**グローバル空間的自己相関 [#d30e994a]
*** Moran のI統計量 [#yd93fe0d]
-spdepの moran(統計量のみ) および moran.test(検定付き)
-autocorrelation@raster
式
#mimetex( 4$I = \frac{\Bigsum_{i=\1}^{n} \Bigsum_{j=\1}^{...
ここで
#mimetex( 4$W = \Bigsum_{i=\1}^{n} \Bigsum_{j=\1}^{n}w_{i...
*** Geary のｃ統計量 [#tc728e81]
-spdep の geary(統計量のみ) および geary.test(検定付き)
-autocorrelation@raster
*** グローバル G統計量 [#i8000075]
spdep の globalG.test
*** Join 統計量 [#aaba1ca1]
spdepのjoincount(統計量のみ) および joincount.test(検...
**ローカル [#w103431d]
*** Local Moran 統計量 [#w9ef0c9d]
-spdep の localmoran
-autocorrelation@raster
*** Local Geary 統計量 [#kd0f646b]
*** G and G* 統計量 [#k34c8b77]
spdep のlocalG
** [[Classification Trees and Spatial Autocorrelation:htt...
**空間自己回帰 [#rdce1a4c]
*** SAR(同時自己回帰) [#za0806c2]
spdep のerrorsarlm
*** CAR（条件付自己回帰) [#uba7142d]
-spdepのspautol
-spatcounts: Spatial count regression
-R 以外では[[GEOBUGS:http://www.mrc-bsu.cam.ac.uk/bugs/wi...
*** SNA パッケージの自己相関分析関数 [#wde2bd17]
社会ネットワーク分析への応用
***利用例 [#r5be4106]
-[[Constructing Cost Distance in Spatial Models:http://ch...
**空間コレログラム [#u3d6be5c]
spdep の sp.correlogram
-[[Simple Spatial Correlograms for Cross-Country Analysis...
-[[Spatial correlograms in R: a mini overview:http://www....
**空間主成分分析 [#jd444dfb]
-[[Performing a spatial Principal Component Analysis usin...
*Hot Spot [#s426d588]
-[[Mapping research hot-spots:http://spatial-analyst.net/...
*空間スキャン統計量 [#p641867f]
-[[SpatialEpi:http://cran.r-project.org/web/packages/Spat...
*空間的相互作用モデル [#u71a3330]
集計型の主な手法はＧＬＭ（一般化線形モデル）で処理可能...
非集約型は？
**古典的重力モデル [#r6767bc1]
***対数線形 [#d8582b86]
lm
**エントロピー最大化モデル [#oa91690d]
GLMを利用
***無制約型（ポアソン型） [#dfbe2c1d]
***発地制約型 [#u42f8111]
***着地制約型 [#ncfaa94b]
***二重制約型 [#b302b9f9]
-[[Estimating flows between geographical locations: get m...
***競合着地型 [#z1b2b6f9]
**ニューラルネット [#m6887c3b]
nnet
**ライリー・コンバース・モデル [#q768881e]
**ハフ・モデル [#u7ca739f]
-[[in Deutch:http://www.reymann.eu/wp-content/uploads/201...
-http://www.odot.state.or.us/tddtpau/R.html リンク切れ
*GWR(Geographically Weighted Regression, 地理的加重回帰) ...
**spgwr at CRAN [#q08b44e1]
[[spgwr(地理的加重回帰)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
-[[残差と予測値の求め方:https://stat.ethz.ch/pipermail/r-...
-[[GWR 3.0 との相違点:http://web.gg.qub.ac.uk/people/staf...
-[[グリッドコンピューティングによる並列処理の例:http://es...
-[[Advanced Spatial Analysis With R:http://www.geos.ed.ac...
--[[Introduction to Geographically Weighted Regression (G...
- [[spgwr(旧):http://spatial.nhh.no/R/gwr/]]
--[[GEOGRAPHICAL STATISTICS & THE GRID:http://www.casa.uc...
**[[gwrr:http://cran.r-project.org/web/packages/gwrr/gwrr...
**[[gwr:http://www.ncl.ac.uk/~ngeog/GWR/]] [#m4b75c1b]
-[[もう一つの R 用 GWR:http://ncg.nuim.ie/ncg/GWR/softwar...
**[[GWmodel: Geographically weighted models:http://cran.m...
**MGWR 混合地理的加重回帰 [#c98319d3]
--[[mixed geographically weighted regression model:https:...
**BayesX: R Utilities Accompanying the Software Package B...
**地理的加重判別分析 [#gb3ed956]
multinom in nnet パッケージ
**gwrr: Fits geographically weighted regression models wi...
**GWR 関連リンク [#p62652dc]
-[[Geographically Weighted Regression:http://gwr.nuim.ie/]]
-[[空間データのための回帰分析@Hiroshima.R:http://www.slid...
*WSAF（加重空間適応フィルタ） [#cae5d392]
*ベイズ [#n7424093]
-[[spBayes:http://blue.fr.umn.edu/spatialBayes/]]
階層型空間モデリングパッケージ
-[[spatialprobit: Spatial Probit Models:http://cran.rstud...
*空間フィルタリング [#k8b58bfb]
-[[Spatial Filtering Workshop:http://www.spatialfiltering...
--spdep の SpatialFilter 関数
**参考 [#wc23f8d5]
-[[SPATIAL STRUCTURE AND SPATIAL INTERACTION: 25 YEARS LA...
る。Minitab/SAS/Fortran/R のコード(maptools/spdep)
-[[SAM(Spatial Analysis in Macroecology:http://www.ecoevo...
- SAS, Matlab 用ツールもあり
- [[Spatial Filtering in ArcGIS with a little help from S...
-[[Spatial Methods:http://www.iccs.org.uk/docs/Spatial%20...
*空間的拡散 [#f46a8ff7]
-Walmart
--[[Walmart Invasion:http://bayesianbiologist.com/2012/08...
--[[Three ways of visualizing the growth of Walmart:http:...
*空間データマイニング [#k69b5443]
**空間データベースとの接続 [#n6d4d4e5]
[[RODBC]] 経由
***PostgreSQL/PostGIS [#q9fe580c]
[[RとPostGIS]]
-RODBC 経由~
--[[空間ウェイトマトリックス作成例:https://www.stat.math....
-Rdbi/RdbiPgSQL
***MySQLの空間エクステンション [#j2debf70]
[[RMySQL]]パッケージ。
[[MySQLは4.x より空間データをサポートしている:http://de...
***SQLITE の空間ＤＢエンジン [#h21d7bb8]
-RSQLite: [[SpatiaLite:http://www.gaia-gis.it/spatialite-...
*WebGIS [#jdb02493]
-[[小地域データにおける地理統計解析とSVGによる可視化:http...
-[[GoogleMapsを用いた地理統計データの可視化:http://www.is...
-[[R で GeoWeb:http://giswin2.geo.tsukuba.ac.jp/mapfish/M...
-[[シェープから SVG に変換:https://stat.ethz.ch/pipermail...
*ESDA(探索的空間分析) [#t4d2ec1c]
-[[GeoXp:http://w3.univ-tlse1.fr/GREMAQ/Statistique/geoxp...
分析結果（モランプロット、バリオグラムクラウド、ローレ...
-[[Visualizing Data Patterns with Micromaps:http://www.cr...
-rgr: The GSC Applied Geochemistry EDA Package
*SMALL AREA ESTIMATION [#u52a23ad]
-経験ベイズ
--empbaysmooth in DCluster
-[[SAE(Software for small-area estimation):http://www.bia...
--[[Tutorial: Small Area Estimation with R at useR! 2008:...
*時間地理学 [#ha024ed8]
-[[geolabs:http://geolabs.wordpress.com/]] Time Geography
--GPS を利用
---[[R: Interactive 3D WebGL plot of time-space cube with...
*時空間分析 [#i4eb0b6b]
-[[CRAN Task View: Handling and Analyzing Spatio-Temporal...
-[[spacetime:http://cran.md.tsukuba.ac.jp/web/packages/sp...
-[[Spatio-temporal data analysis in R and links to GIS:ht...
-[[Manipulating Spatio-temporal Environmental Data in R u...
*空間的マイクロシミュレーション [#n9f40f08]
-[[sms:http://cran.r-project.org/web/packages/sms/]]
--[[R library for spatial microsimulation:http://www.dimi...
*リモセン [#xb0a116d]
-[[unsupervised classification of a Landsat image in R: t...
*GISソフトウェアとの接続・統合 [#k72225c5]
R(D)COM や RServe およびその他のソフトを利用したものを...
**ArcGISのVBAよりR(D)COM経由でRの各空間分析パッケージを使...
[[VBAによるArcGISプログラミングガイド:http://www.amazon...
[[ArcGIS で R]]
**Grass GIS [#ie91bf73]
-[[R と GRASS GIS]]
-[[GRASS and RStat:http://josef.fsv.cvut.cz/WIKI/grass-os...
-[[GRASSとＲを用いたリモートセンシング情報と家畜の空間行...
** RPyGeo: Python 経由で、R で、ArcGIS のジオプロセッシン...
**[[SDAM 空間データ分析マシン:http://giswin.geo.tsukuba.a...
GeoComputaion用。R(D)COM と JCOMを使ってGeoTools(Java ...
現在新バージョンを開発中。
**[[歴史統計GeoWeb]] [#we2b648b]
Ajax + PHP + R
**[[Q(uantum) GIS:http://www.qgis.org]] との連動 [#f5e66d...
QGIS は Python をサポートしているので、この機能を使って R...
最近活動が活発になっているようだ。
-[[BridgeToR - Quantum GIS Wiki:http://wiki.qgis.org/qgis...
-[[R-QGis Data Transfer:http://wiki.qgis.org/qgiswiki/R-Q...
-[[Qgis Basic Stats Plugin:http://www.maths.lancs.ac.uk/~...
-[[manageR:http://www.geog.uvic.ca/spar/carson/]] R を使...
-[[Arlat - RapLoa Analysis Tool:http://www.maths.lancs.ac...
空間疫学関係の分析システム。Rpy(Python) を利用して QGIS...
-[[FOSS4G2007の発表:http://www.foss4g2007.org/presentatio...
-[[スライド:http://www.foss4g2007.org/presentations/viewa...
-[[プログラムソース:http://www.maths.lancs.ac.uk/Software...
-[[参考文献:http://www.bepress.com/cgi/viewcontent.cgi?ar...
-[[QGIS and Python and R and statistics from QGIS Blog:ht...
**[[DIVA GIS:http://udig.refractions.net/gallery/cgiar/]]...
Eclipse のRCPを利用したオープンソース GIS、uDig のプラ...
*地理空間情報ウェブサービスとの連携 [#x6a3bc44]
**[[R で GeoWeb]] [#dbc8e286]
**地図画像 [#m7ebca3d]
-WMS(Web Mapping Service)
rogr, RCURL
**空間データ取得 [#k78ff687]
-WFS
rogr, RCURL
-[[Web Maps:https://r-forge.r-project.org/projects/webmap...
-SOS
--[[SOS4R:http://giv-wikis.uni-muenster.de/agp/pub/Main/S...
**分散型ジオプロセッシング [#x6d4f5e1]
-WPS(Web Processing Service)
[[INTMAP(Interoperability and Automated Mapping):http:/...
**空間パネルモデル [#x1b56eb5]
-[[splm: econometric analysis of spatial panel data:http:...
--[[ドキュメント:http://www.agrocampus-ouest.fr/math/useR...
**空間分析のための並列計算 [#j75cfa88]
-[[Parallel Computing for spatial data analysis:http://ge...
**FlowViz [#g66fe288]
-[[Great circles, raster, sp and lattice:http://www.r-blo...
-[[Mapped: British, Spanish and Dutch Shipping 1750-1800:...
-[[Automating great-circle map production in R:http://sta...
-[[USING GREAT CIRCLES AND GGPLOT2 TO MAP ARRIVAL/DEPARTU...
**Mapping Tips [#vc0c9b74]
-[[半透明地図の重ね合わせ:https://stat.ethz.ch/pipermail/...
*Open Data Hack [#j47121f8]
-[[An exercise in R using local open data:http://chrislad...
*Google Earth/KML による可視化 [#w1d311d0]
-[[plotKML:http://plotkml.r-forge.r-project.org/]] プリズ...
-[[R2G2: Converting R CRAN outputs into Google Earth:http...
--[[Displaying Your Data in Google Earth Using R2G2:http:...
*順位・規模の法則、ランク・サイズルール [#uc211c8d]
-[[City Size and SUHI:http://www.r-bloggers.com/city-size...
*アニメーション [#rc1845aa]
-[[MORTALITY RATE OF CHILDREN UNDER 5 AND GENDER DIFFEREN...
-[[Generate GIS integrated animation:Gun deaths animation...
-[[Animated map of 2012 US election campaigning, with R a...
-[[Animated choropleths using animation, ggplot2, rCharts...
*フィールドワーク [#md0de208]
-[[Displaying spatial sensor data from Arduino with R on ...
*書籍（オンラインも含む） [#rccebc22]
+Springer より、R を使った空間統計の本(Bivand, R. S.(sp, ...
)が2008/09出版。
--[[One-day introductory course on Spatial Data Analysis ...
小地域推定（Small Area Estimation）など
+Crawley, M. J. :[[The R Book:http://as.wiley.com/WileyC...
+[[Spatial Statistical Data Analysis for GIS Users:http:/...
+古谷知之著[[『Rによる空間データの統計分析』:http://www.a...
--[[空間の統計学, ESTRELA 2009年8月〜2010年7月 :http://we...
+[[Displaying time series, spatial and space-time data wi...
+[[Introduction to visualising spatial data in R:http://e...
+ Brunsdon, C. , Comber, L.(2015):[[An Introduction to R ...
*関連情報 [#x00297bb]
-[[R Spatial Projects:http://sal.uiuc.edu/csiss/Rgeo/]] R...
-[[R-sig-Geo:https://stat.ethz.ch/pipermail/r-sig-geo/]] ...
-[[newsgroup のアーカイブ:http://news.gmane.org/gmane.com...
-[[r-spatial-devel:http://sourceforge.net/mail/?group_id=...
-[[r-spatial:http://sourceforge.net/projects/r-spatial/]]...
-[[aRT - API R-TERRALIB:http://www.est.ufpr.br/art/]] INP...
-[[Geographic Data Analysis Using R:http://geography.uore...
-[[地理空間分析のためのベクタデータモデル共通基盤 - sp パ...
-pgirmess: 生態学のデータ分析 というのにもいくつか入って...
-[[Spatio-temporal data analysis in R and links to GIS:ht...
-[[Review of Cluster Analysis Software:http://www.naaccr....
-[[Ecology and epidemiology in R: Spatial analysis:http:/...
-[[Analysing spatial point patterns in 'R':http://www.csi...
-[[Political Science 867 Spatial Modeling Winter 2005:htt...
-[[QGIS Labs:http://www.plantsciences.ucdavis.edu/plant/q...
--Lab 6 基本属性データ操作
--Lab 7 R を用いた QGIS の機能補完
--Lab 8 空間補間
--Lab 9 QGIS へのデータの取り込み方法
--Lab 10 属性と位置の結合
-[[R Wiki の空間データ tips:http://wiki.r-project.org/rwi...
-[[An educational resource about spatial statistics and g...
-[[e-workshop on spatial analysis with R 2009/01-03:https...
-[[Marine Geospatial Ecology Tools:http://code.env.duke.e...
-[[rgis:http://r-forge.r-project.org/projects/r-gis/]]
以下のパッケージを開発中。
--gdistance:GIS
--raster:ラスター型データ処理
--remotesensing:リモセン
--cropsim および dismo:生物多様性。
-[[R-Forge の空間データと統計のサイト:http://r-forge.r-pr...
--[[空間データクラス:http://r-forge.r-project.org/softwar...
--[[疾病地図化と空間データ分析:http://r-forge.r-project.o...
--[[生態学分析:http://r-forge.r-project.org/softwaremap/t...
--[[点分布分析:http://r-forge.r-project.org/softwaremap/t...
--[[空間データの入出力:http://r-forge.r-project.org/softw...
--地球統計
-[[Hydrology in R:http://source.ggy.bris.ac.uk/wiki/Hydro...
R を使った水文学分析の事例。パッケージ（TOPMODEL 、RHy...
-[[R-Project spatial statistics software packages:http://...
-[[R による空間分析図例集:http://r-spatial.sourceforge.ne...
-[[PySAL:http://geodacenter.asu.edu/pysal]] 空間計量経済...
-[[spatial-analyst.net:http://spatial-analyst.net/wiki/in...
--[[GEOSTAT 2011:http://www.uni-koblenz-landau.de/landau/...
--[[GEOSTAT 2012 Munster:http://geostat-course.org/Muenst...
--[[GEOSTAT 2013 Quebec City:http://geostat-course.org/Qu...
-[[An alternative approach for object oriented classifica...
-[[Introduction to Applied Spatial Analysis :https://www....
-[[Geospatial Use Cases and Case Studies:http://www.nceas...
-[[Geospatial Data Processing in R Geospatial Data Proces...
-[[dylan's blog:http://casoilresource.lawr.ucdavis.edu/dr...
-[[GEOGRAPHY AND REGIONAL DEVELOPMENT:http://www.ic.arizo...
--[[GEOGRAPHY AND REGIONAL DEVELOPMENT 657:http://www.ic....
-[[Geographic Information Systems (GIS) in Public Health ...
-[[Open Source/Non-Commercial GIS Products:http://www.spa...
-[[Using open source Geographical Information Systems and...
-[[Open Source Geospatial Software - an Introduction Spat...
-[[R Spatial Tips:http://rspatialtips.org.uk/]] R Spatial...
-[[Spatial Analysis | Spatial data visualisation, analysi...
--[[Improved Tree Maps with R:http://spatialanalysis.co.u...
-[[R で空間統計:http://blogs.yahoo.co.jp/shohei_tokyo_198...
-[[Workshop Applied Spatial Statistics in R:http://www.pe...
-[[Spatial data and GIS (Geographical Information Systems...
-[[日本地図を描く（japan_ver62.shpから）:http://www.eeso....
-The Big List Of Free GIS Programs ? S Through Z
--[[A Through H:http://freegeographytools.com/2008/the-bi...
--[[I Through M:http://freegeographytools.com/2008/the-bi...
--[[ N Through R:http://freegeographytools.com/2008/the-b...
--[[S Through Z:http://freegeographytools.com/2008/the-bi...
-[[R GIS:http://www.geopacific.org/opensourcegis/r/r-gis]]
-[[StarSpan:http://starspan.projects.atlas.ca.gov/doku/do...
-[[Function to Collect Geographic Coordinates for IP-Addr...
-[[Before, During and After: The Richest 1 Percent:http:/...
-[[Berlin's children:http://factbased.blogspot.com/2012/0...
-[[Great Maps with ggplot2:http://spatialanalysis.co.uk/2...
-Maps with R
--[[(I):http://www.r-bloggers.com/maps-with-r-i/]]
--[[(II):http://www.r-bloggers.com/maps-with-r-ii/]]
--[[(III):http://www.r-bloggers.com/maps-with-r-iii/]]
-[[Creating beautiful maps:http://www.r-bloggers.com/crea...
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-Wine MAP
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--[[The World Wine Web:http://geospaced.blogspot.co.uk/20...
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--[[Plotting data points on a map:http://www.milanor.net/...
--[[choropleth maps:http://www.milanor.net/blog/?p=634]]
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-Twitter
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-[[Thirteen lines of code:http://www.milanor.net/blog/?p=...
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-[[List of spatial analysis software:http://en.wikipedia....
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