[[A:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--I#od8517e5]]
[[B:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--I#i67ed2ea]]
[[C:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--I#g1d61c9f]]
[[D:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--I#wb6b788a]]
[[E:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--I#v2fbe62b]]
[[F:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--II#dfd6e0bc]]
[[G:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--II#t13a9272]]
[[H:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--II#x03913de]]
[[I:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--II#c0b3d4d2]]
[[J:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--II#bee56ca4]]
[[K:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--II#w1ae3894]]
[[L:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--II#pa851b1b]]
[[M:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--III#k19f18df]]
[[N:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--III#i42ceeb3]]
[[O:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--III#va02ff2e]]
[[P:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--III#ida25b2c]]
[[Q:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--III#r9a6e634]]
[[R:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--III#t904394c]]
[[S:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--IV#hab20eca]]
[[T:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--IV#i546cc78]]
[[U:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--IV#cbf46408]]
[[V:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--IV#uc9b8881]]
[[W:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--IV#nd98654b]]
[[X:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--IV#v5b41f05]]
[[Y:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--IV#ge4e73b6]]
[[Z:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--IV#l4166191]]~
~
[[CRAN パッケージリスト:http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88]]~
[[CRAN パッケージリスト(A〜E):http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--I]]~
[[CRAN パッケージリスト(F〜L):http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--II]]~
CRAN パッケージリスト(M〜R)~
[[CRAN パッケージリスト(S〜Z):http://www.okadajp.org/RWiki/?CRAN%20%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88--IV]]~
----
リンク切れになっていたので，エンコーディングの変更とサーバーの変更に対応させた 2017/04/17~
SIZE(25){COLOR(red){CRAN パッケージリスト(M〜R)}}~
#contents
~
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~
*M [#k19f18df]
**COLOR(red){mapdata}:追加地図データベース)パッケージ中のオブジェクト一覧 [#h3258754]
maps パッケージの追加．サイズ大きなデータベースおよび、または、高精度のデータベースを提供
[[mapdata(追加地図データベース)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){mapReduce}: 並列計算用の柔軟な mapReduce アルゴリズム [#p8465918]
//mapReduce - flexible mapReduce algorithm for parallel computation
mapReduce は、並列計算用のシンプルなフレームワークを提供する。本実装は、(a)純粋な R 実装、(b)mapReduce の論文に従うシンタックス、(c)柔軟で並列化可能なバックエンドを提供する。
//mapReduce is an algorithm provides a simple framework for parallel computations. This implementation provides (a) a pure R implementation (b) a syntax following the mapReduce paper and (c) flexible and parallelizable back end.
[[mapReduce(並列計算用の柔軟な mapReduce アルゴリズム)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){maps}:地図描画 [#s606c959]
地図表示。投影法のコードと大きなサイズの地図は別のパッケージ(mapproj and mapdata)にある。
[[maps (地図描画)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){maptools}: 空間オブジェクトの読み込みおよび操作用ツール [#gba5c316]
//Tools for reading and handling spatial objects
地理データを操作し読み込むためのツールのセット、特に ESRI シェープファイル用。ここでは shapelib から利用した C コード。本パッケージは、GSHHS 1.5 海岸線ファイルへのバイナリアクセスを含む。本パッケージはまた、PBSmapping, spatstat, maps, RArcInfo, Stata tmap, WinBUGS, Mondrian, その他のパッケージを用いた空間オブジェクトを交換するインターフェースラッパも提供する。
//Set of tools for manipulating and reading geographic data, in particular ESRI shapefiles; C code used from shapelib. It includes binary access to GSHHS 1.5 shoreline files. The package also provides interface wrappers for exchanging spatial objects with packages such as PBSmapping, spatstat, maps, RArcInfo, Stata tmap, WinBUGS, Mondrian, and others.
[[maptools(Maptools)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){maptree}: 木モデルのマッピング、刈り込み、そしてグラフ化 [#ac56e6ce]
階層的クラスタリング、分類、そして回帰木からのマッピング、刈り込み、そしてグラフ化用の、例示用データをもつ関数
**COLOR(red){marginTree}: 高次元の分類のマージン木(margin trees) [#u4465b9d]
//margin trees for high-dimensional classification
高次元分類のためのいくつかの関数。２クラス以上で役立つ。
//Some functions for high-dimensional classification, useful for more than 2 classe
**COLOR(red){MarkedPointProcess}: マーク付き点過程分析のマークの分析 [#n77de45c]
マーク付き点過程分析のマークのノンパラメトリック分析
**COLOR(red){Matrix}: R用マトリックスパッケージ [#rf83fe06]
Lapackを利用した線形代数のクラスとメソッド
**COLOR(red){matrixcalc}: 行列微分計算法コレクション [#e6cdba9a]
//Collection of functions for matrix differential calculus
Magnus and Neudecker (1999) Matrix Differential Calculus with Applications in Statistics and Econometrics, Second Edition, John Wiley, New York にある行列微分計算法サポートする関数コレクション。関数のいくつかは、実際のモデルおよび計算で役に立つ APL および J 関数と比較できる。
//A collection of functions to support matrix differential calculus as presented in Magnus and Neudecker (1999) Matrix Differential Calculus with Applications in Statistics and Econometrics, Second Edition, John Wiley, New York. Some of the functions are comparable to APL and J functions which are useful for actuarial models and calculations.
**COLOR(red){maxLik}: 最尤推定 [#h362ed65]
//Maximum Likelihood Estimation
最尤推定のためのツール
//Tools for Maximum Likelihood Estimation
**COLOR(red){maxstat}: 最大選択ランク統計量 [#q3899557]
**COLOR(red){MBA}: マルチレベル B スプライン近似 [#cac50627]
//Multilevel B-spline Approximation
マルチレベル B スプラインを利用した散布データ補間
//Scattered data interpolation with Multilevel B-Splines
**COLOR(red){MBESS}: 行動、教育および社会科学の手法 [#a37165d7]
//Methods for the Behavioral, Educational, and Social Sciences
MBESS は行動、教育および社会科学の研究者（実質的な研究者および方法論者双方）にとって特に役に立つ手法を実装している。MBESSの中に含まれる手法の多くは計量的な調査に一般的に応用できる。
//MBESS implements methods that are especially useful to researchers working within the behavioral, educational, and social sciences (both substantive researchers and methodologists). Many of the methods contained within MBESS are applicable to quantitative research in general.
**COLOR(red){mblm}: メジアンベース線形モデル [#k62426a0]
//Median-Based Linear Models
本パッケージは Theil-Sen メジアンおよび Siegel 繰り返しメジアンベースの線形モデルを提供する。これらの手法は非常に頑健であり（それぞれ 29 または 50 パーセントのブレークポイント）、外れ値がなにもなければ、推定量は OLS に非常に類似したものになる。
//This package provides linear models based on Theil-Sen single median and Siegel repeated medians. They are very robust (29 or 50 percent breakdown point, respectively), and if no outliers are present, the estimators are very similar to OLS.
**COLOR(red){mc2d}: ２次元モンテカルロシミュレーション用ツール [#wd0afe27]
//Tools for Two-Dimensional Monte-Carlo Simulations
各種の分布及びユーティリティーで、Ｒを利用しやすくし、２次元モンテカルロシミュレーションの構築および研究する。
//Various distributions and utilities to ease the use of R to build and study Two-Dimensional Monte-Carlo simulations
**COLOR(red){mclust}: モデルを基礎とするクラスター分析 [#cae722dc]
**COLOR(red){mclust1998}: モデルを基礎とするクラスター分析 [#acf4f918]
**COLOR(red){mclust02}: モデルベースのクラスター分析(旧バージョン) [#cb1ac828]
//Model-based cluster analysis (older version)
モデルベースのクラスター分析: MCLUST の 2002 バージョン
//Model-based cluster analysis: the 2002 version of MCLUST
**COLOR(red){MCMCglmm}: MCMC 一般化混合モデル [#a1280e72]
//MCMC Generalised Linear Mixed Models
MCMC 一般化混合モデル
//MCMC Generalised Linear Mixed Models
**COLOR(red){MCMCpack}: マルコフ連鎖モンテカルロ (MCMC) パッケージ [#rd32b2ad]
[[MCMCpackパッケージ(マルコフ連鎖モンテカルロ)中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){mda}: 混合、そして柔軟な判別分析 [#q498ff44]
混合そして柔軟な判別分析、多変量加法的回帰スプライン(MARS), BRUTO, ...
**COLOR(red){mco}: 多規準最適化アルゴリズム [#l9d087e4]
//Multi criteria optimization algorithms
記述なし
//Sorry, the description of this package is missing.
**COLOR(red){MDD}: 最小の検出可能な差分計算 [#y41dcb5f]
//Minimum Detectable Difference Calculations
いくつかの連続的なかつバイナリの端点のための最小の検出可能な差分計算をおこなう。このパッケージは MDD と臨床的に有意な差分とを、ほとんど同様なテストについて比較するプログラムももつ。
//Calculates minimum detectable difference for several continuous and binary endpoints. Also contains programs to compare the MDD to the clinically significant difference for most of the same tests.
**COLOR(red){meanscore}: ロジスティック回帰モデルにおける欠損共変量に対する平均スコア法 [#r6baca64]
欠損および補助共変量に対する平均スコア法はバイオメトリカの1995年の Reilly & Pepe の論文に記述されている。この尤度に基づく方法はすべての利用可能なケースを利用可能であり、したがってより効率的な推定を与えるであろう。この手法は cohort, case-control デザインに適用可能である。
**COLOR(red){mefa}: 動物相計数データ処理とレポート作成 [#s3f8d673]
//Faunistic count data handling and reporting
動物相計数データ処理とレポート作成用 R パッケージ。'mefa' という名称は,基本データの操作が第一であるが、そのほとんどが重要で時間のかかるデータ分析の部分であるというのを指す 'metafaunistics' という 用語を意味するものである。本のパッケージは基本的な動物相係数データ(標本/種/数)を組み合わせたオブジェクトの作成と管理をおこなう関数を含んでいる。ゼロカウントを含む係数データ及びサンプル内のセグメントが示され、続く操作で使用される。レポートはテキスト形式および LaTeX 形式で生成される。
//R package for faunistic count data handling and reporting. The name 'mefa' stands for the term 'metafaunistics' indicating that handling of basic data is only the first, but the most critical and sometimes most time consuming part of data analysis. It contains functions to create and manage objects combining basic faunistic (sample/species/count or crosstabulated) count data and sample/species attribute tables. Segments within the count data and samples with zero count can be indicated and used in subsequent operations. Reports can be generated in plain text or LaTeX format.
**COLOR(red){memisc}: 調査データ、グラフィックス、プログラミング、統計およびシミュレーション [#y03e8a32]
//Tools for Management of Survey Data, Graphics, Programming, Statistics, and Simulation
本パッケージの目的の一つは、調査データセットを扱う R ユーザの生活を楽にすることである。このパッケージは値のラベル、定義できない欠損値、変数の記録、符号表作成および SPSS および Stata これらのファイル（のサブセット）のインポート含む調査データ管理の基盤を提供する。さらには、記述統計の表とデータフレームおよび回帰モデル推定の（ほとんど）印刷品質の表も提供する。また、グラフィックス、プログラミングおよびシミュレーションのための便利なツールでもある。
//One of the aims of this package is to make life easier for useRs who deal with survey data sets. It provides an infrastructure for the management of survey data including value labels, definable missing values, recoding of variables, production of code books, and import of (subsets of) SPSS and Stata files. Further, it provides functionality to produce tables and data frames of arbitrary descriptive statistics and (almost) publication-ready tables of regression model estimates. Also some convenience tools for graphics, programming, and simulation are provided.
**COLOR(red){MFDA}: モデルベースの機能データ分析 [#d2300065]
//Model Based Functional Data Analysis
本パッケージはモデルベースの機能データクラスタリングをおこなうものである。
//This is the package for doing model based fucntional clustering.
**COLOR(red){mFilter}: 各種の時系列フィルター [#w19ee5da]
//Miscellaneous time series filters
本パッケージは時系列の傾向と周期要素の平滑化および抽出に有用な時系列フィルターを実装している。ルーチンは経済学及び財政学で共通なものを使用しているが、これらは他の分野においても興味があるはずだ。現在、本パッケージにはChristiano-Fitzgerald, Baxter-King, Hodrick-Prescott, Butterworth, および trigonometric regression が含まれている。
//The package implements several time series filters useful for smoothing and extracting trend and cyclical components of a time series. The routines are commonly used in economics and finance, however they should also be interest to other areas. Currently, Christiano-Fitzgerald, Baxter-King, Hodrick-Prescott, Butterworth, and trigonometric regression filters are included in the package.
**COLOR(red){mfp}: 多変量分数多項式 [#xe3be166]
//Multivariable Fractional Polynomials
分数多項式が回帰モデル曲率利用される。主要参考文献は Royston and Altman, 1994.
//Fractional polynomials are used to represent curvature in regression models. A key reference is Royston and Altman, 1994.
**COLOR(red){mgcv}: GCVによる多重平滑化パラメータ推定とGAM [#f7612a71]
GCV または UBREによる多重平滑化パラメータ推定選択を用いたGAMおよび他の一般化リッジ回帰問題用ルーチン。クローンでないgam()の実装を含む。
**COLOR(red){mi}: 欠損データの補定（インピュテーション）およびモデルのチェック [#q2e26d02]
//Missing Data Imputation and Model Checking
欠損データの補定（インピュテーション）およびモデルのチェック
//Missing-data imputation and model checking
**COLOR(red){micEcon}: ミクロ経済学 [#d8014288]
//Microeconomics
ミクロ経済学分析およびミクロ経済学モデリング用ツール
//Tools for microeconomic analysis and microeconomic modelling
**COLOR(red){mimR}: MIM の R のインタフェイス [#z8dd6a9e]
グラフィカルモデリング解析アプリケーション [[MIM:http://www.hypergraph.dk/]] を R 越しに使う．MS Windows のみ．
**COLOR(red){minpack.lm}: MINPACK に含まれる Levenberg-Marquardt 非線形最小二乗法アルゴリズム用インターフェース [#vdc01541]
//R interface to the Levenberg-Marquardt nonlinear least-squares algorithm found in MINPACK
MINPACK ライブラリの lmder および lmdif への R 用インターフェースを提供する。Levenberg-Marquardt アルゴリズムを修正することで非線形最小二乗法問題を解く。
//Provides R interface to lmder and lmdif from the MINPACK library, for solving nonlinear least-squares problems by a modification of the Levenberg-Marquardt algorithm.
[[minpack.lm(MINPACKに含まれるLevenberg-Marquardt非線形最小二乗法アルゴリズム用インターフェース)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){misc3d}: 雑多な３Ｄプロット [#g11b3796]
//Miscellaneous 3D Plots
等値面を含む雑多な３Ｄプロットコレクション
//A collection of miscellaneous 3d plots, including isosurfaces.
[[misc3d(雑多な３Ｄプロット)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){MiscPsycho}: 精神測定の寄せ集め [#r4f81452]
//Miscellaneous Psychometrics
精神測定者に有用な統計分析の計算
//Computes statistical analyses useful for applied psychometricians
**COLOR(red){mitools}: 欠損データの多重代入ツール [#cbc3cc06]
//Tools for multiple imputation of missing data
多重代入のデータセットの分析をおこない、結果を組み合わせるツール
//Tools to perform analyses and combine results from multiple-imputation datasets.
**COLOR(red){mix}: カテゴリカル、連続データの混合モデルに対する推定・補完 [#a9f6bd75]
**COLOR(red){mixlow}: 薬剤の相乗効果を評価する mixlow 手法 [#aa9f3d97]
//mixlow method for assessing drug synergism
薬剤の相乗/拮抗効果を評価する mixlow 手法
//mixlow software for assessing drug synergism/antagonism
**COLOR(red){mixnet}: ランダムなグラフクラスタリング [#l842fdfe]
//random graph clustering
グラフについての Erdos Reni 混合の推定をおこなう
//performs the estimation of Erdos Reni Mixture for Graphs
**COLOR(red){mixtools}: 混合モデル分析ツール [#x3ed9374]
//Tools for analyzing mixture models
混合モデル分析用 R 関数コレクション
//A collection of R functions for analyzing mixture models.
**COLOR(red){mlogit}: 多項ロジットモデル [#o9d693cb]
//multinomial logit model
代替的なまたは個々の特定の変数を使った多項ロジットモデル推定
//Estimation of the multinomial logit model with alternative and/or individual specific variables
[[mlogit(多項ロジットモデル)パッケージ中のオブジェクト中の一覧]]
**COLOR(red){MKLE}: 最大カーネル尤度推定 [#i2cb9fc9]
//Maximum kernel likelihood estimation.
最大カーネル尤度推定 (mkle) の高速計算パッケージ
//Package for fast computation of the maximum kernel likelihood estimator (mkle)
**COLOR(red){mlbench}: 機械学習ベンチマーク問題 [#kf818b5c]
//Machine Learning Benchmark Problems
人工および現実世界の機械学習ベンチマーク問題。これは、例えば、UCI リポジトリからのいくつかのデータセットを含む。
//A collection of artificial and real-world machine learning benchmark problems, including, e.g., several data sets from the UCI repository.
**COLOR(red){mlegp}: ガウス過程の最尤推定 [#i6e70256]
//Maximum Likelihood Estimates of Gaussian Processes
診断プロット及び感度分析つき単変量及び多次元出力用最尤推定ガウス過程モデル。
//Maximum likelihood Gaussian process modeling for univariate and multi-dimensional outputs with diagnostic plots and sensitivity analysis.
**COLOR(red){mlmmm}: 欠損値を持つ多変量線形混合モデル下の ML 推定 [#xd82819d]
//ML estimation under multivariate linear mixed models with missing
欠損値を持つ多変量線形混合モデルの計算戦略、Schafer and Yucel (2002), Journal of Computational and Graphical Statistics, 11, 421-442.
//Computational strategies for multivariate linear mixed-effects models with missing values, Schafer and Yucel (2002), Journal of Computational and Graphical Statistics, 11, 421-442.
**COLOR(red){mnormt}: 多変量正規/T 分布 [#p230d794]
//The multivariate normal and t distributions
本パッケージは、多変量正規分布及びT 分布より、ランダムなベクトル生成の及びそのための密度及び分関数を計算関数を提供する。本パッケージは 'mvtnorm' パッケージのものの範囲と同様な関数を提供すが、相違点がいくつかある。すなわち、確率を非モンテカルロ手法で計算するのである。
//This package provides functions for computing the density and the distribution function of, and for generating random vectors from the multivariate normal and multivariate t distributions. It provides functions similar in scope to those of the package 'mvtnorm', but with some differences; one of these is that probabilities are computed via a non-Monte Carlo method.
**COLOR(red){moc}: 曲線の一般的非線形混合 [#r74b4a3e]
ユーザー定義の分布とプロファイルによる多変量観測値に対する様々な混合モデルの当てはめ
**COLOR(red){modeltools}: 統計モデルのツール及びクラス [#la974614]
//Tools and Classes for Statistical Models
統計も出る処理ツール集成。機能は実験的なもので、ユーザインターフェースは将来変更があるようである。記述はむしろ簡潔明瞭ではあるが、パッケージ 'coin' および'party' にはいくつかの演習用の例がある。しかし、興味ある実装のアイデアをみつけたら、その申し出についての議論には興味がある。パッケージへの貢献は大歓迎！
//A collection of tools to deal with statistical models. The functionality is experimental and the user interface is likely to change in the future. The documentation is rather terse, but packages 'coin' and 'party' have some working examples. However, if you find the implemented ideas interesting we would be very interested in a discussion of this proposal. Contributions are more than welcome!
**COLOR(red){mokken}: R の Mokken 尺度分析 [#e42139cc]
//Mokken Scale Analysis in R
mokken パッケージは検定およびアンケートデータに関する Mokken 尺度分析を実行する関数を含んでいる。本パッケージは自動項目選択を含んでいる。
//mokken contains functions for performing mokken scale analysis on test and questionnaire data. It includes an automated item selection algorithm, and various checks of model assumptions.
**COLOR(red){moonsun}: R を使った基本天文学計算機 [#afdb1080]
//Basic astronomical calculations with R
Peter Duffet-Smith の"Practical astronomy with your calculator" に基づいたR 用の基本天文学ルーチンのコレクション。
//A collection of basic astronomical routines for R based on "Practical astronomy with your calculator" by Peter Duffet-Smith.
**COLOR(red){mpm}: スペクトルマップ分析 [#p323ecbc]
//Spectral Map Analysis
多変量データ、異なる投影手法をもつ特に遺伝子発現データの探索的グラフィック分析。すなわち、主成分分析、対応分析、スペクトルマップ分析。
//Exploratory graphical analysis of multivariate data, specifically gene expression data with different projection methods: principal component analysis, correspondence analysis, spectral map analysis.
**COLOR(red){MPV}: Montgomery, Peck and Vining の本からのデータセット [#r1795ad5]
**COLOR(red){mra}: Mark-Recapture データの分析 [#a0a1beee]
//Analysis of Mark-Recapture data バージョン 1.Xは live-capture Cormack-Jolly-Seber オープン人口モデルを推定する関数を含んでいる。
個々の、時間の、および個々に時間変動する共変数を使う mark-recapture (capture-recapture) データの分析。
//Analysis of mark-recapture (capture-recapture) data using individual, time, and individual-time varying covariates. Version 1.X contains functions to estimate live-capture Cormack-Jolly-Seber open population models.
**COLOR(red){msm}: 連続時間におけるマルチスケール・マルコフモデル [#l5d642c2]
任意の時間で観測されたカテゴリカルな過程への連続時間の多状態空間マルコフモデルの当てはめ用の関数。オプションで誤判別反応量や、推移や誤って判別された比率への共変量を伴っても良い。
**COLOR(red){MUCflights}: Munich Franz-Josef-Strauss 空港パターン分析 [#o6bafa89]
//Munich Franz-Josef-Strauss Airport Pattern Analysis
http://www.munich-airport.de からのフライトデータのダウンロード用とフライトパターン分析関数
//Functions for downloading flight data from http://www.munich-airport.de and for analyzing flight patterns.
**COLOR(red){muhaz}: 生存分析におけるハザード分析 [#v0b15ac1]
打ち切りデータに対する危険関数の滑らかな推定値を生成するパッケージ
**COLOR(red){multcomp}: 多重検定と同時信頼区間 [#q3c1ed2c]
一元分類に対する多重比較手法
**COLOR(red){multidim}: Multidim [#c61c6f7d]
多次元記述統計量：factorial method と分類
//multiv is ORPHANED.
//**COLOR(red){multiv}: 多変量データ解析ルーチン
//
//多変量データ解析ルーチン。階層型クラスタリング、PCA,Sammon マッピング、対応分析等が含まれる。
**COLOR(red){muStat}: Prentice 積和検定および McNemar 検定 [#ra46911e]
//Prentice Rank Sum Test and McNemar Test
Wilcox 積和検定, Kruskal 積和検定, Friedman 積和検定 および McNemar 検定の実行
//Performs Wilcox rank sum test, Kruskal rank sum test, Friedman rank sum test and McNemar test.
**COLOR(red){mvgraph}: 多変量対話型可視化 [#k42c6ffa]
//Multivariate, Interactive Visualization
本パッケージで、さまざまな多変量データの可視化ができる。
//This package offers different possibilities to visualize multivariate data
**COLOR(red){mvnmle}:欠損値を持つ多変量正規化データの ML 推定[#t79be890]
欠損値を持つ多変量正規化データの平均ベクトルと分散共分散マトリックスの最尤推定を見つける。
**COLOR(red){mvoutlier}: 頑健な手法に基づく多変量外れ値の検出 [#w3f6afa7]
//Multivariate outlier detection based on robust methods
本パッケージは多変量外れ値の検出用に作成された。
//This packages was made for multivariate outlier detection.
**COLOR(red){mvtnorm}: 多変量正規分布および T 分布 [#t1c85d70]
多変量正規分布および T 分布の計算
*N [#i42ceeb3]
**COLOR(red){ncomplete}: ncomplete [#m17bee38]
このライブラリは、二値回帰への regression depth 法 (RDM) を実行し、残りのデータセットが完全な分離を持つような、除去可能な最小観測値数を近似する
**COLOR(red){NADA}: 環境データの検出しないものとデータ分析 [#safeb4df]
Dennis R. Helsel の著書 "Nondetects And Data Analysis: Statistics for Censored Environmental Data" で彼が述べている手法を含む。
**COLOR(red){negenes}: ゲノム内の主要遺伝子数の推定 [#zfd78b80]
ギブス抽出法を用いた、ランダムな transposon mutagenesis 実験からのデータを基礎にした、ゲノム中の本質的遺伝子数の推定
**COLOR(red){netCDF}: UCARの netCDF 形式データの読み込み [#x497577b]
netCDF ファイルよりデータの読み込み
**COLOR(red){NetData}: McFarland の SNA R labs 用ネットワークデータ [#xb528787]
//Network Data for McFarland's SNA R labs
本パッケージは Dan McFarland の SNA R labs ために必要なデータすべてを含む。
//This package contains all data needed for Dan McFarland's SNA R labs.
**COLOR(red){netmodels}: スケールフリーで小さな世界のネットワーク学習ツール [#x55b3094]
//Tools for the study of scale free and small world networks
スケールフリーで小さな世界のネットワークの学習用ツール
//Provides a set of functions designed to help in the study of scale free and small world networks. This functions are high level abstractions of the functions provided by the Igraph package.
スケールフリーで小さな世界のネットワークの学習用ツールに役立つようにデザインされている関数セットを提供する。この関数は、Igraph パッケージの提供する関数の高水準の抽象概念である。
**COLOR(red){network}: 関係付けデータクラス [#w6b82750]
//Classes for Relational Data
network オブジェクトを作成。修正するツール。network クラスは関係付けデータタイプの範囲を表し、任意のバーテックス/エッジ/グラフ属性をサポートする。
//Tools to create and modify network objects. The network class can represent a range of relational data types, and supports arbitrary vertex/edge/graph attributes.
**COLOR(red){NightDay}: 昼夜の境界プロット関数 [#i0d14183]
//Night and Day Boundary Plot Funtion
昼夜の境界の計算とプロット
//Computes and plots the boundary between night and day.
**COLOR(red){NISTnls}: NISTの非線形最小二乗法の例 [#ae5a3c74]
非線形回帰式ルーチンの検証用データセット、
**COLOR(red){nleqslv}: 非線形連立方程式を解く [#m705667e]
//Solve systems of non linear equations
非線形連立方程式を、線分探索及び信頼領域法のような全域戦略を選択する Broyden 又は Newton 法を用いて解く。オプションに数値又は解析ヤコビアンがあり、固定又は自動尺度パラメータもある。
//Solve a system of non linear equations using a Broyden or a Newton method with a choice of global strategies such as linesearch and trust region. There are options for using a numerical or an analytical jacobian and fixed or automatic scaling of parameters.
**COLOR(red){nlme}:線形および非線形混合効果モデル [#x59db0dd]
ガウス線形および非線形混合効果モデルの適合と比較。
[[nlme(線形および非線形混合効果モデル)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){nlmeODE}: 微分方程式を利用した nlme の非線形混合効果モデリング [#ded68d24]
このパッケージは微分方程式を利用した混合効果モデリング用に odesolve およびnlme 両パッケージを組み合わせたものである。
**COLOR(red){nlrq}: 非線形区分回帰 [#sdad1549]
非線形区分回帰ルーティン
**COLOR(red){nls2}: 虱潰し法による非線形回帰 [#q10ef22c]
//Non-linear regression with brute force
nls に algorithm="brute-force" と多重開始値を追加。
//Adds algorithm="brute-force" and multiple starting values to nls.
**COLOR(red){nlts}: （非）線形時系列分析 [#of04cc32]
//(non)linear time series analysis
（非）線形時系列分析用の R 関数。トピックの核心はクロスバリデーションによる次数推定。
//R functions for (non)linear time series analysis. A core topic is order estimation through cross-validation.
**COLOR(red){norm}: 欠損値を含む多変量正規データセットの解析 [#ib6e53d3]
欠損値を含む多変量正規データセットの解析
**COLOR(red){normalp}: オーダー p の正規分布(GDE)用のパッケージ [#h3902c2f]
オーダー p の正規分布(一般化誤差分散)に関係する道具関数のコレクション
**COLOR(red){normix}: 正規混合モデル(１次元) {クラスおよび手法} [#ef7a9be0]
１次元正規混合モデルクラス。例を挙げると、密度推定または、クラスタリングアルゴリズム研究および教育に利用。このパッケージは広く使用されている Marron-Wand 密度を提供する。?MarronWandを参照。
**COLOR(red){npmc}: ノンパラメトリックな多重比較 [#x1205818]
特定の分布の仮定無しの、一変量レイアウトに対する同時ランクテスト手順を提供する
**COLOR(red){numDeriv}: 正確な数値微分 [#q93638e2]
//Accurate Numerical Derivatives
正確な数値微分.詳細は ?numDeriv で見ることができます．
//Accurate Numerical Derivatives. See ?numDeriv.Intro for more details.
**COLOR(red){nws}: NetWorkSpaces と Sleigh のための R 関数 [#dff42005]
//R functions for NetWorkSpaces and Sleigh
REvolution Computing が開発した netWorkSpaces を使って，強調および並列実行ファシリティ、および言語間データ交換を提供する。
//Provides coordination and parallel execution facilities, as well as limited, using the netWorkSpaces server developed by REvolution Computing
*O [#va02ff2e]
**COLOR(red){OAIHarvester}: [[OAI-PMH v2.0:http://www.nii.ac.jp/metadata/oai-pmh/]] を用いたメタデータの刈り取り [#q08eae68]
//Harvest Metadata Using OAI-PMH v2.0
オープンアーキテクチャイニシアティブプロトコル(OAI-PMH)バージョン 2.0 を用いたメタデータの刈り取り．
//Harvest metadata using the Open Archives Initiative Protocol for Metadata Harvesting (OAI-PMH) version 2.0.
[[OAI-PMH v2.0 を用いたメタデータの刈り取り)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){Oarray}: 任意の添字オフセットをもつ配列 [#q585ccde]
**COLOR(red){oce}:海洋データの分析 [#l7b9c4c1]
//Analysis of Oceanographic data
海洋データの分析の支援。データは CTD の測定値、海面時系列、海岸線のファイルなどを含む。また本パッケージは密度のような海水の特性および浮力の頻度のような派生的な特性を計算する関数も含む。
//Supports the analysis of Oceanographic data, including CTD measurements, sea-level timeseries, coastline files, etc. Also includes functions for calculating seawater properties such as density, and derived properties such as buoyancy frequency.
**COLOR(red){odesolve}: 常微分ソルバー [#m332a318]
//Solvers for Ordinary Differential Equations
本パッケージはODE solver lsoda のインターフェースを提供する. ODE は R 関数またはコンパイル済みのコードとして使用される.
//This package provides an interface for the ODE solver lsoda. ODEs are expressed as R functions or as compiled code.
**COLOR(red){odfWeave}: Open Document Format (ODF) ファイルの Sweave 処理 [#a5d1113b]
//Sweave processing of Open Document Format (ODF) files
Open Document Format (ODF) ファイルの Sweave 処理
//Sweave processing of Open Document Format (ODF) files
**COLOR(red){openNLP}: openNLP インターフェース [#g2859b9d]
//openNLP Interface
openNLP インターフェース
//An interface to openNLP (http://opennlp.sourceforge.net/).
**COLOR(red){openNLPmodels}: (英語とスペイン語の) openNLP モデル [#r8ad8803]
//(English and Spanish) openNLP models
openNLPための(英語とスペイン語の) モデル
//English and Spanish models for openNLP.
**COLOR(red){optimx}: optim() 関数の代替かつ拡張 [#fd64d94d]
//A replacement and extension of the optim() function
optim() 関数の代替かつ拡張 を提供して、いくつかの、ないしは、多くのパラメータからなる、平滑化、おそらくは、ボックス制約形関数について、R の最適化機能を統合し、かつ、簡潔なものにする。
//Provides a replacement and extension of the optim() function to unify and streamline optimization capabilities in R for smooth, possibly box constrained functions of several or many parameters
**COLOR(red){optmatch}: 最適マッチング [#y28251d7]
//Functions for optimal matching
最適マッチングを実行する関数、特に完全マッチングを実行できる
//Functions to perform optimal matching, particularly full matching
**COLOR(red){orientlib}: 方向データのサポート [#k5b39b10]
**COLOR(red){orloca}: オペレーションリサーチの立地分析モデルを扱うパッケージ [#k35bb140]
//The package deals with Operations Research LOCational Analysis models
パッケージのこのバージョンは、最小和またはセンター立地問題を処理する。最小和問題は需要点への重み付き距離の合計を最小にする点を探索する。
//This version of the package deals with the min-sum or center location problems. The min-sum location problem search for a point such that the weighted sum of the distances to the demand points are minimized.
[[orloca(オペレーションリサーチの立地分析モデルを扱う)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){orloca.es}: orloca パッケージのスペイン語版 [#lc487593]
//Spanish version of orloca package
**COLOR(red){ORMDR}: ORMDR [#s6c8075d]
//ORMDR
遺伝子間相互作用を検出するためのオッズ比に基づくマルチファクター次元縮小手法
//Odds ratio based multifactor-dimensionality reduction method for detecting gene-gene interactions
**COLOR(red){outliers}: 外れ値の検証 [#t75f13c9]
//Tests for outliers
外れ値を同定するために一般的に使用されている検定のコレクション
//A collection of some tests commonly used for identifying outliers.
**COLOR(red){oz}: オーストラリアの海岸線と州をプロット [#y7d653a0]
オーストラリアの海岸線と州界をプロットする関数。
*P [#ida25b2c]
**COLOR(red){pack}: RAW 型ベクトルの作成と操作 [#wabc6f13]
//Create and manipulate raw vectors
複数のデータ型とRAW 型間の変換操作のための関数
//Functions to convert multiple data type values to/from raw bytes
**COLOR(red){packdep}: R パッケージ間の依存関係をマッピング [#c656978f]
//Mapping dependencies among R packages
packdep はユーザの貢献した R パッケージ間の依存関係を明らかにし、社会ネットワークの指標に従ってキーとなるパッケージを識別する。
//packdep elucidates the dependencies between user-contributed R packages and identifies key packages according to social network analysis metrics.
[[packdep(R パッケージ間の依存関係のマッピング)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){PairViz}: オイラー閉路およびハミルトン分解の可視化 [#cca758d4]
//Visualization using Eulerian tours and Hamiltonian decompositions
完全グラフのオイラー閉路およびハミルトン分解は、統計グラフィックスでの順序効果を改善するのにもちいられている。
//Eulerian tours and Hamiltonian decompositions of complete graphs are used to ameliorate order effects in statistical graphics.
**COLOR(red){pamr}: Pam: マイクロアレイの予測分析 [#dcdc9943]
マイクロアレイにおける標本分類のいくつかの関数
**COLOR(red){pan}: 多変量パネルデータまたはクラスタデータのための多重データ補完 [#veef4980]
//Multiple imputation for multivariate panel or clustered data
多変量パネルデータまたはクラスタデータのための多重データ補完
//Multiple imputation for multivariate panel or clustered data
**COLOR(red){panel}: パネル [#vfd8a00e]
パネルデータへのモデル当てはめ用の関数とデータセット
**COLOR(red){parser}: 詳細な R ソースコードパーサ [#efab80a4]
//Detailed R source code parser
詳細なソースコードパーサで、標準的な R パーサに基づいているが、情報を違うやり方で構成する
//detailed source code parser, based on the standard R parser but organizing the information differently
**COLOR(red){pastecs}: 時空間生態系列の解析用のパッケージ [#kaa1547f]
時空間系列の正規化、分解、そして解析。pastec ライブラリは
[[PASSTEC 2000:http://www.obs-vlfr.fr/~enseigne/anado/passtec/passtec.htm]] を移植するための PNEC-Art4 と IFREMER (Benoit Beliaeff ) による第一歩である。
**COLOR(red){PASWR}: R を用いた確率と統計 [#hc388e9f]
//Probability and Statistics with R
書籍" the book Probability and Statistics with R"のためのデータと関数
//Data and functions for the book Probability and Statistics with R.
**COLOR(red){PBSmapping}: 地図描画およびその他の GIS 手続き [#vce9e454]
このソフトウェアはカナダブリティッシュ・コロンビア州 Nanaimo にある Pacific Biological Station (PBS) においておこなわれた漁業調査より、発展してきたものである。これは R 言語を拡張して、地理情報システム(GIS) で共通に利用可能であるのと同様な二次元作図機能を含むようにしている。埋め込まれた C のコードは、特定のポイントイベントを含んでいるポリゴンを見つけたり、または、経緯度とユニバーサル横メルカトル図法(UTM)座標間の変換のような計算幾何学のアルゴリズムを高速化している。パブリックドメインの地球の海岸線やその他のデータセットを含んでいる。
**COLOR(red){PBSmodelling}: PBS モデリング [#y01ee776]
// PBS Modelling
PBS モデリング はコンピュータモデルのデザイン、テスト、および操作を備えたソフトウェアを提供する。本パッケージは特にグラフィカルユーザインターフェース (GUI)のカスタマイズを構築・編集を容易にするツールに焦点を合わせている。本パッケージは R の Tcl/Tk パッケージのインターフェースにかなり依存しているものの、Tcl/Tkの知識は必要としない。本パッケージは他の R パッケージ、PBS Mapping, odesolve, および BRugs を含んだ、で構築したモデルの説明例を含んでいる。使用説明とプロセスを実行するバッチファイルと合わせて、新規の R パッケージを構築するための便利なプロトタイプとしても役に立つ。PBSmodelling のルートライブラリディレクトリには、完全なユーザガイド, PBSmodelling-UG.pdf, がある。本パッケージの有効利用にはこのガイドを調べてください。
//PBS Modelling provides software to facilitate the design, testing, and operation of computer models. It focuses particularly on tools that make it easy to construct and edit a customized graphical user interface (GUI). Although it depends heavily on the R interface to the Tcl/Tk package, a user does not need to know Tcl/Tk. The package contains examples that illustrate models built with other R packages, including PBS Mapping, odesolve, and BRugs. It also serves as a convenient prototype for building new R packages, along with instructions and batch files to facilitate that process. The root library directory of PBSmodelling includes a complete user guide PBSmodelling-UG.pdf. To use this package effectively, please consult the guide.
**COLOR(red){pcse}: R でのパネルで調整した標準誤差の推定 [#u6460d84]
//Panel-Corrected Standard Error Estimation in R
本パッケージはパネルで調整した標準誤差を推定するための関数を含んでいる。データはバランスのとれたパネルまたはバランスのとれていないパネルを含んでもよい、
//This package contains a function to estimate panel-corrected standard errors. Data may contain balanced or unbalanced panels.
**COLOR(red){pcurve}: 主曲線解析 [#z8c10ffa]
任意次元の数値的多変量データセットに主曲線を当てはめる。
また、拡張された非類似度行列を計算し、多次元尺度法と主曲線解析を実行する。
**COLOR(red){pear}: 周期的自己回帰パッケージ [#j0a65a88]
周期的自己回帰モデル推定用パッケージ。このパッケージは周期的時系列データの作図手法をも含む。
**COLOR(red){penalized}: GLM および Cox モデルの L1 (lasso) および L2 (リッジ) 罰則付き推定 [#v4668a2a]
//L1 (lasso) and L2 (ridge) penalized estimation GLMs and in the Cox model
一般化線形モデル および Cox 比例ハザードモデルの L1 (lasso) および L2 (リッジ) 罰則付き推定
//L1 (lasso) and L2 (ridge) penalized estimation in Generalized Linear Models and in the Cox Proportional Hazards model
**COLOR(red){permax}: permax [#ze1ef270]
permax ライブラリは 7 つの関数を含み、DNA アレイデータの基本的解析（特に、二種類の組織間の発現レベルの比較）を容易にすることを目指している。
**COLOR(red){pgirmess}: 生態学のデータ分析 [#j56888d0]
//Data analysis in ecology
生態学のデータ分析用各種関数
//Miscellaneous functions for data analysis in ecology
**COLOR(red){phangorn}: R による系統発生学 [#j70ad563]
//Phylogenetic analysis in R
R による系統発生学（最尤法、最大節約法、距離法およびアダマール結合をもちいた系統樹およびネットワーク）
//Phylogenetic analysis in R (Estimation of phylogenetic trees and networks using Maximum Likelihood, Maximum Parsimony, Distance methods & Hadamard conjugation)
**COLOR(red){picante}: 系統発生および生態学の統合ツール [#w302ddc7]
//Tools for integrating phylogenies and ecology
R による Phylocom との統合、生物群集解析、空モデル、特性及び進化
//Phylocom integration, community analyses, null-models, traits and evolution in R
**COLOR(red){pixmap}: ビットマップ・イメージ (``Pixel Maps'') [#mf17e6f5]
ビットマップ・イメージ のインポート、エクスポート、作図およびその他の操作関数。
**COLOR(red){PK}: 基本薬物動態 [#p1ecd726]
//Basic Pharmacokinetics
基本薬物動態パラメータの推定
//Estimation of pharmacokinetic parameters
**COLOR(red){PKfit}: 薬物動態のためのデータ分析 [#u1322f3c]
//A Data Analysis Tool for Pharmacokinetics
PKfit は非線形分析（遺伝アルゴリズムを含む）プログラムである。このプログラムはモデル／曲線のあてはめ及びモデルのシミュレーションを実行するようにデザインされている。
//PKfit is a nonlinear regression (including a genetic algorithm) program which was designed to perform model/curve fitting and model simulations for pharmacokinetics.
**COLOR(red){plan}: プロジェクトプランニング用ツール [#sb63bb12]
//Tools for project planning
バーンダウンチャート作成支援
//Supports the creation of burndown charts
**COLOR(red){plm}: パネルデータ用線形モデル [#j17ff9f5]
//Linear models for panel data
パネルデータの推定量および検定のセット
//A set of estimators and tests for panel data
**COLOR(red){plotGoogleMaps}: Google Maps API とユーザ自身のデータを使った HTML 出力のプロット [#o5adbb0d]
//Plot HTML output with Google Maps API and your own data
本パッケージは、Google Maps とカスタムレイヤ（レイヤ）を使って、HTML 出力を生成する。HTML はいつでもローカルファイルとして利用もでき、また、ユーザ自身のウェブサイトへもアップロードできる。Google Maps JavaScritpt API V3 のより詳細については、Google の公式ウェブサイト( http://code.google.com/apis/maps/documentation/javascript/)より入手できる。
//This package produces HTML output with Google Maps and costume layer (layers). The HTML is ready to use as local file or into your own website. More details about using Google Maps JavaScritpt API V3 is available on the official web site http://code.google.com/apis/maps/documentation/javascript/
**COLOR(red){plotSEMM}: SEMM の非線形潜在変数相互作用のグラフ化 [#i53d6c18]
//Graphing nonlinear latent variable interactions in SEMM
本パッケージは関数を含み、これらは、診断プロットを生成する。これは、Bauer(2005)により提案されたもので、LISREL の出力を用いる SEMM での非線形潜在可変相互作用を調べるためのものである。
//Contains functions plotSEMM_setup, plotSEMM_contour, plotSEMM_probability and plotSEMM_legend, which generate the diagnostic plots proposed by Bauer(2005) to investigate nonlinear latent variable interactions in SEMM using LISREL output.
**COLOR(red){plotrix}: 様々なプロット関数 [#tf3cef7e]
//Various plotting functions
豊富な作図、様々なラベリング、軸およびカラースケーリング関数.
//Lots of plots, various labeling, axis and color scaling functions.
[[plotrix(様々なプロット関数)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){pls.pcr}: PLS および PCR 関数 [#cea1c3c5]
PLS および PCR による多変量回帰．
**COLOR(red){plyr}: データの分割、適用および組み合わせのためのツール [#u52da651]
//Tools for splitting, applying and combining data
plyr は一連の共通の問題を解決するツールセットである。大きな問題を管理可能なことがらに分けて、それぞれを操作し、ふたたびそれらを一緒にして元に戻す。
//plyr is a set of tools that solves a common set of problems: you need to break a big problem down into manageable pieces, operate on each pieces and then put all the pieces back together.
**COLOR(red){pmml}: 各種モデル用 PMML の生成 [#ef99b4d9]
//Generate PMML for various models
予測モデリング用マークアップ言語 (PMML) はアプリケーションから独立してモデルを表現する言語。このようなモデルは、このために、Zementis の ADAPA、Teradata Warehouse Miner や IBM の DB2 を含む PMML をサポートしている他のアプリケーションにロードできる。本パッケージはオブジェクトのために pmml を生成する pmml 総称関数を提供する。S3 総称関数を使って、サポートするオブジェクトのクラスのための適切なメソッドを送る。本パッケージは現状では、線形回帰、SVM、rpart 分類木、randomSurvivalForest forest models および kmeans クラスタをサポートしている。また、PMML エクスポートのみサポートしている。本パッケージは Rattle ツールキットの一部である。
//The Predictive Modelling Markup Language (PMML) is a language for representing models, in an application independent way. Such models can then be loaded into other applications supporting PMML, including ADAPA from Zementis, Teradata Warehouse Miner and IBM's DB2. The package provides a generic pmml function to generate pmml for an object. Using a S3 generic function the approriate method for the class of the supplied object is dispatched. The package currently supports the export of PMML for linear regression, SVMs, rpart classification trees, randomSurvivalForest forest models, and kmeans clusters. This package is part of the Rattle toolkit.
[[pmml(各種モデル用 PMML の生成 )パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){poilog}: ポアソン対数正規および二変量ポアソン対数正規分布 [#la151e74]
//Poisson lognormal and bivariate Poisson lognormal distribution
ポアソン対数正規および二変量ポアソン対数正規分布の、密度，ランダム逸脱(random deviates)および最尤推定を取得する関数
//Functions for obtaining the density, random deviates and maximum likelihood estimates of the Poisson lognormal distribution and the bivariate Poisson lognormal distribution.
[[poilog(ポアソン対数正規および二変量対数正規分)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){polspline}: 多項スプライン・ルーチン [#u01105f1]
//Polynomial spline routines
ハザード回帰、柔軟な裾を持つハザード推定、logspline, lspec, polyclass, および polymars をあてはめる多項スプラインルーチン.C. Kooperberg と共著者によって作成.
//Routines for the polynomial spline fitting routines hazard regression, hazard estimation with flexible tails, logspline, lspec, polyclass, and polymars, by C. Kooperberg and co-authors
**COLOR(red){polycor}: 多分相関および多分系列相関(重双相関係数) [#n9a7044e]
//Polychoric and Polyserial Correlations
クイック「２段階」法またはＭＬによる多分相関および多分系列相関(重双相関係数)の計算。オプションで標準誤差が付く。テトラコリック相関係数（四分相関）、双列相関係数はこの関特殊なケースである。
//Computes polychoric and polyserial correlations by quick "two-step" methods or ML, optionally with standard errors; tetrachoric and biserial correlations are special cases.
[[polycorパッケージによる順序相関係数の算出]]
**COLOR(red){polynom}: 一変数多項式を操作するクラスを実装する関数のコレクション [#e2b4be58]
一変数多項式を操作するクラスを実装する関数のコレクシション
**COLOR(red){pomp}: 部分観測マルコフ過程 [#da6c5efa]
//Partially-observed Markov processes
部分観測マルコフ過程の推定手法
//Inference methods for partially-observed Markov processes
**COLOR(red){popbio}: マトリックス人口モデルの構築と分析 [#d8b223a4]
//Construction and analysis of matrix population models
年齢やステージで分類されたマーク付きの個人の人口学研究の射影マトリックスモデルの構築と分析をおこなう。本パッケージは、Caswell (2001)の "Matrix Population Models" および Morris and Doak (2002) "Quantitative Conservation Biology" 記載の手法をカバーしている。
//Construct and analyze projection matrix models from a demography study of marked individuals classified by age or stage. The package covers methods described in Matrix Population Models by Caswell (2001) and Quantitative Conservation Biology by Morris and Doak (2002).
**COLOR(red){portfolio}: 持分金融資産(equity portfolios)分析 [#q91035d3]
//Analysing equity portfolios
持分金融資産(equity portfolios)の分析および実装クラス群
//Classes for analysing and implementing equity portfolios.
**COLOR(red){portfolioSim}: 持分金融資産(equity portfolios)戦略のシミュレーションの枠組み [#kc408f34]
//Framework for simulating equity portfolio strategies
持分金融資産(equity portfolios)のシミュレーションデザインの枠組みになるクラス群
//Classes that serve as a framework for designing equity portfolio simulations.
**COLOR(red){prabclus}: 存在・非存在データのクラスタリングに対する検定 [#s8fbd0f6]
主に存在・非存在データ(種の分布マップのクラスタリング)を念頭においた、距離を元にするパラメトリックなブートストラップ検定。
Jaccard と Kulczynski の距離測度、MDS スコア、最近接距離を用いたノイズ検出(Byers and Raftery's (1998) "NNclean" のR実装)。主な関数は prabtest (検定用)、prabclust (クラスタリング用), prabinit (データの準備用) そしてNNclean (ノイズ検出用)。.prabtest と prabclust に対するヘルプページは簡単な標準的実行例を含む。
**COLOR(red){predbayescor}: フィーチャ選択バイアスの修正されたベイジアンナイーブベイズモデルベースの分類ルール [#q8eecb99]
//Classification rule based on Bayesian naive Bayes models with feature selection bias corrected
"predict.bayes"は高次のバイナリのフィーチャよりバイナリの反応を予測する。
//"predict.bayes" predicts the binary response from high dimensional binary features
**COLOR(red){predmixcor}: フィーチャ選択バイアスの修正されたベイジアン混合ベイズモデルベースの分類ルール [#sd73c33d]
//Classification rule based on Bayesian mixture models with feature selection bias corrected
"train_predict_mix" バイナリのフィーチャよりバイナリの反応を予測する。
//"train_predict_mix" predicts the binary response with binary features
**COLOR(red){princurve}: 任意次元の主曲線(Principal Curve)の当てはめ [#e761610f]
任意次元のデータ行列に主曲線(Principal Curve)を当てはめる
**COLOR(red){proj4}: PROJ.4 地図投影変換ライブラリ簡易インターフェース [#pb3a7211]
//A simple interface to the PROJ.4 cartographic projections library
PROJ.4 地図投影変換ライブラリの緯度経度投影変換および測地系変換の簡易インターフェース。このパッケージで一つの投影法およびまたは測地系より他のものへ地理座標変換が可能になる。
//A simple interface to lat/long projection and datum transformation of the PROJ.4 cartographic projections library. It allows transformation of geographic coordinates from one projection and/or datum to another.
[[proj4(PROJ.4 地図投影変換ライブラリ簡易インターフェース)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){ProfessR}: グレードの設定及び試験メーカー [#v85d0820]
//Grades Setting and Exam Maker
生徒のグレードを決定し、クエスチョン・バンクより試験を作成するプログラム。プログラムは、同じ質問リストの異なるバージョン用に数多くの複数選択試験を作成し、ランダムにシャッフルする。
//Programs to determine student grades and create examinations from Question banks. Programs will create numerous multiple choice exams, randomly shuffled, for different versions of same question list.
**COLOR(red){proxy}: 距離および類似測度 [#j2d2a1e3]
//Distance and Similarity Measures
もっとも有名なものの実装をともなった auto- and cross-proximities の効率的な計算のための拡張フレームワークを提供する。
//Provides an extensible framework for the effcient calculation of auto- and cross-proximities, along with implementations of the most popular ones.
**COLOR(red){pscl}: 政治科学計算研究所，スタンフォード大学 [#d5a01c29]
//Political Science Computational Laboratory, Stanford University
項目反応理論モデル (IRT) のベイズ分析、点呼分析；最高密度の領域計算;Hurdle. and Zero-Inflated カウントデータ・モデルの最尤推定;GLM の適合度手法;Political Science Computational Laboratory の論文作成および教育用データセット;投票議席曲線
//Bayesian analysis of item-response theory (IRT) models, roll call analysis; computing highest density regions; maximum likelihood estimation of zero-inflated and hurdle models for count data; goodness-of-fit measures for GLMs; data sets used in writing and teaching at the Political Science Computational Laboratory; seats-votes curves.
**COLOR(red){pspline}: 罰則付き平滑化スプライン [#w7582c54]
m 階の導関数に対するペナルティーをもつ平滑化スプライン
**COLOR(red){psych}: パーソナリティ、精神測定及び心理学研究のための方法 [#w517afd4]
//Procedures for Personality, Psychometric, and Psychological Research
パーソナリティ、精神測定及び実験心理学研究用の数多くのルーチン。関数は因子分析、クラスター分析および信頼性解析による尺度構成用のものであるが、他のものは基本的な記述統計用である。詳細については、personality-project.org/r を参照のこと。
//A number of routines for personality, psychometrics and experimental psychology. Functions are primarily for scale construction using factor analysis, cluster analysis and reliability analysis, although others provide basic descriptive statistics. For more information, see the personality-project.org/r.
[[psych(パーソナリティ、精神測定及び心理学研究 )パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){PTAk}: k モードに関する Principal Tensor Analysis [#p84e2224]
任意オーダーのテンソル（配列）を分解する多元配置手法。SVD の一般化として、また non-identity メトリックと罰則化をサポートする。こうした拡張を持つ二元 SVD も同様に
得られる。パッケージはまたこうした拡張を持つ他の多元手法を含む：PCAn (Tucker-n)
そして PARAFAC/CANDECOMP。
*Q [#r9a6e634]
**COLOR(red){qdg}: QTL 有向グラフ [#of56a72d]
//QTL directed graphs
表現型ネットワークのための QTL 有向依存性グラフフの推測
//Infer QTL-directed Dependency Graphs for Phenotype Networks
**COLOR(red){qpcR}: リアルタイム PCR データのモデリング及び分析 [#m587612d]
//Modelling and analysis of real-time PCR data
モデルのあてはめ、最適モデル選択およびさまざまなフィーチャの計算。これらは計量的リアルタイム連鎖反応(qPCR)の分析で重要である。
//Model fitting, optimal model selection and calculation of various features that are essential in the analysis of quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR).
**COLOR(red){QRMlib}: 計量リスク管理の概念を調べる R 言語コードの提供 [#i5bd9867]
//Provides R-language code to examine Quantitative Risk Management concepts
本パッケージは Alexander J. McNeil, Rudiger Frey and Paul Embrechts の著書 Quantitative Risk Management: Concepts, Techniques and Tools と一緒に使うデザインされたフリーのライブラリ。別バージョンの SPlus が Alexander McNeil の URL(http://www.ma.hw.ac.uk/~mcneil/book/QRMlib.html) よりダウンロードできる。
//This is a free R-language library designed to accompany the book Quantitative Risk Management: Concepts, Techniques and Tools by Alexander J. McNeil, Rudiger Frey and Paul Embrechts. A separate SPlus version can be downloaded from Alexander McNeil's URL at http://www.ma.hw.ac.uk/~mcneil/book/QRMlib.html
**COLOR(red){qtl}: QTL 実験の解析用の道具 [#odbc4aff]
定量的表現型の変動に寄与する遺伝子(quantitative tarit loci, QTL と呼ばれる)を特定するための実験的交配の解析
**COLOR(red){quadprog}: 二次計画法問題を解く関数 [#z15585a4]
このパッケージは二次計画法問題を解くルーチンとドキュメントを含む。
**COLOR(red){QuantPsyc}: 計量心理学ツール [#lc3dd8bf]
//Quantitative Psychology Tools
データのスクリーニング、適正化の検証、媒介および精神力の推定に有用な関数を含む。
//Contains functions useful for data screening, testing moderation, mediation and estimating power
**COLOR(red){quantreg}: 四分位回帰 [#i708d5cb]
四分位回帰および関連手法。
**COLOR(red){qvcalc}: 統計モデルにおける因子効果に対する疑似分散 [#vbda271f]
疑似分散と関連する近似誤差の測度を計算する関数
*R [#t904394c]
**COLOR(red){R.cache}: オブジェクトの高速・軽量キャッシング [#b4722f8b]
//Fast and light-weight caching of objects
永続的メディアに仮の R オブジェクトをキャッシングする方法。オブジェクトはハッシング・オブジェクトセットにロードされ、階層的に保存することができる。
//Methods for caching arbitrary R objects on persistent media. Objects can be loaded and saved stratified on a set of hashing objects.
**COLOR(red){R.huge}: 大規模データへのアクセスメソッド [#nbaa1bcd]
//Methods for accessing huge amounts of data
本パッケージはマトリックスを表現するクラスを現在のところ提供しており、実データはローカルファイルシステムのバイナリ形式で蓄積されている。この方法では，データサイズの限界はファイルシステムで設定され、メモリーで設定されるものではない。
//The package currently provides a class representing a matrix where the actuall data is stored in a binary format on the local file system. This way the size limit of the data is set by the file system and not the memory.
**COLOR(red){R.matlab}: MAT ファイルの読み書き及び R-to-Matlab 接続 [#lee3d546]
//Read and write of MAT files together with R-to-Matlab connectivity
本パッケージはMAT ファイルを読み書きする方法を提供する。また、本パッケージはローカルで動作またはリモートで動作している Matlab v6 以上と通信できる（コードの評価、オブジェクトの送信と検索等ができる）。
//This package provides methods to read and write MAT files. It also makes it possible to communicate (evaluate code, send and retrieve objects etc.) with Matlab v6 or higher running locally or on a remote host.
[[R.matlab(MAT ファイルの読み書き及びh R-to-Matlab 接続もできる)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){R2HTML}: RオブジェクトのHTMLエクスポート [#ecd23640]
**COLOR(red){R2PPT}: rcom を用いたマイクロソフトパワーポイント用簡易 R インターフェース [#jefa35f9]
//Simple R Interface to Microsoft PowerPoint using rcom
R2PPT はラッパーの簡易セットを提供し、rcom 利用のマイクロソフトパワーポイントのプレゼンを容易にする。
//R2PPT provides a simple set of wrappers to easliy use rcom for generating Microsoft PowerPoint presentations.
[[R2PPT(rcom を用いたマイクロソフトパワーポイント用簡易 R インターフェース )パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){rjags}: MCMC を用いたベイズグラフィカルモデル [#n6483959]
//Bayesian graphical models using MCMC
JAGS MCMC 用インターフェース
//Interface to the JAGS MCMC library
**COLOR(red){R2WinBUGS}: R より WinBUGS と OpenBUGS の実行 [#o7b4336a]
このパッケージを使用することで、BUGS モデルを呼び出し、テーブルやグラフに推論や収束の要約をし、シミュレーション結果をRでアクセスが容易な配列に保存する。
[[R2WinBUGS(R より WinBUGS および OpenBUGS の実行)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){RadioSonde}: 歪んだ T 図式と風のプロファイルをプロットする道具 [#dea939c9]
RadioSonde はラジオゾンデ（典型的な風船を用いた天候観測機器）により集められたデータ（関連ドキュメントでは "flight", "sonde", "profile" と呼んででいる）を読み込み、歪みT、log p 図式、そして風のプロファイルをプロットするためのプログラムである。
生のデータファイルは共通の書式で書かれており、ヘッダーに続く個々の変数からなる。
データファイルの完全な解説については "help(ExampleSonde)" を用いよ。
**COLOR(red){ramps}: RAMPS を使ったベイズ地球統計モデリング [#d54fc469]
//Bayesian Geostatistical Modeling with RAMPS
パラメータ再編(reparameterized)および周辺化(marginalized)アルゴリズムを使ったガウス過程のベイズ地球統計モデリング
//Bayesian geostatistical modeling of Gaussian processes using a reparameterized and marginalized posterior sampling (RAMPS) algorithm designed to lower autocorrelation in MCMC samples. Package performance is tuned for large spatial datasets.
[[ramps(RAMPS を使ったベイズ地球統計モデリング)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){RandomFields}: 確率場の解析とシミュレーション [#f6aaa336]
様々な手法を用いた確率場のシミュレーションと解析
**COLOR(red){randomForest}: Breiman の分類と回帰のための random forest [#ya5c1954]
ランダム入力を用いた木の森に基づく分類と回帰
**COLOR(red){randomLCA}: ランダム効果潜在クラス分析 [#tf944e38]
//Random Effects Latent Class Analysis
randomLCA: ランダム効果潜在クラスモデルおよび標準潜在クラスモデルのあてはめ
//Fits random effects latent class models, as well as standard latent class models.
**COLOR(red){RandVar}: ランダム変数の実装 [#m1bd3e67]
//Implementation of random variables
S4 クラスおよびメソッドをもちいたランダム変数の実装
//Implementation of random variables by means of S4 classes and methods
**COLOR(red){RArcInfo}: Arc/Info V7.x バイナリ・カバレッジよりデータをインポートする関数 [#x3e4cdce]
このパッケージは作成の関数を使って、Arc/Info V7.x 形式および E00 ファイルの地理情報をR変数に読み込むものである。
[[RArcInfo(ArcInfoカバレッジ・インポート)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){raster}: ラスターデータを使った地理分析とモデリング [#b07de923]
//Geographic analysis and modeling with raster data
グリッド化された空間データの読み書き、操作、分析及びモデリング。本パッケージは地図代数(map algebra)と同様な基本的で高水準の関数を実装している。巨大ファイルの処理もサポート。
//Reading, writing, manipulating, analyzing and modeling of gridded spatial data. The package implements basic and high-level functions, as well as map algebra. Processing of very large files is supported.
[[raster(地理データ分析・モデルリングのためのラスターデータ処理)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){rasterVis}: raster パッケージのための可視化メソッド [#red6f44e]
//Visualization methods for the raster package
raster パッケージは空間ラスターデータアクセスおよび操作のためのクラスとメソッドを定義する。rasterVis パッケージはラスターを補完して、拡張された可視化とインタラクションのためのメソッドのセットを提供するもの。
//The raster package defines classes and methods for spatial raster data access and manipulation. The rasterVis package complements raster providing a set of methods for enhanced visualization and interaction.
[[rasterViz(raster パッケージのための可視化メソッド)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){RBGL}: BOOST グラフ・ライブラリ用インターフェース [#w6c078d2]
//An interface to the BOOST graph library
BOOST グラフ・ライブラリに内包されたグラフ・アルゴリズムへのかなりの拡張性と総合性をもつインターフェース。
//A fairly extensive and comprehensive interface to the graph algorithms contained in the BOOST library.
**COLOR(red){RBerkeley}: Oracle Berkeley DB の R API [#gfb05c51]
//R API to Oracle Berkeley DB
組み込み Oracle Berkeley DB(tm) への R インターフェースを提供する
//Provides R Interface to Embedded Oracle Berkeley DB(tm)
**COLOR(red){RBloomberg}: R/Bloomberg [#y6f7d097]
Bloomberg よりデータを取ってくる。
**COLOR(red){rbugs}: R と OpenBugs との融合 [#ya35f1d1]
BUGS をバッチモードおよび R より呼び出して実行するのに必要なファイルを用意する関数。Linux での OpenBugs のサポートを強調している。
**COLOR(red){Rcmdr}: R Commander [#ha36644a]
プラットホームに依存せず GUI (graphical user interface)で基本統計分析を行う。tcl/tk パッケージに基づく。
**COLOR(red){rcdk}: rcdk - CDK ライブラリインターフェース [#h2100216]
//rcdk - Interface to the CDK Libraries
ユーザは本パッケージで CDK、化学情報管理のための java フレームワークの機能にアクセスできる。ユーザはこのパッケージで分子をロード、はっきりした特徴(fingerprints)を評価、分子記述子の計算などができる。これらに加えて、ユーザは CDK API で２次元構造を見ることができる。
//This package allows the user to access functionality in the CDK, a Java framework for cheminformatics. This allows the user to load molecules, evaluate fingerprints, calculate molecular descriptors and so on. In addition the CDK API allows the user to view structures in 2D.
**COLOR(red){Rcmdr.HH}: Temple 大学の入門コースの Rcmdr サポート [#a2d3eab3]
//Rcmdr support for the introductory course at Temple University.
入門コースでは R Commander にまだないトピックのいくつかに時間を割く。このため、メニュー項目を作成して利用できるようにした。
//Our introductory course spends time on several topics that are not yet in the R Commander. Therefore we wrote the menu items and make them available.
**COLOR(red){RcmdrPlugin.epack}: 時系列用 R コマンダープラグイン [#t3446cae]
//Rcmdr plugin for time series
本パッケージは、時系列関数ベースの R コマンダー「プラグイン」を提供する。貢献者: G. Jay Kerns, John Fox, および Richard Heiberger。
//This package provides an Rcmdr "plug-in" based on the time series functions. Contributors: G. Jay Kerns, John Fox, and Richard Heiberger.
**COLOR(red){RcmdrPlugin.Export}: オブジェクトをグラフィックを使って、LaTeX または HTML にエクスポート。[#x719865e]
//Graphically export objects to LaTeX or HTML
本パッケージは Rcmdr 出力を使って、Rcmdr 出力を LaTeX または HTML コードにグラフィックでエクスポートする機能を提供する。現時点では、本質的には、プラグインは xtable() のグラフィカルフロントエンドである。本パッケージは 、(1) Rcmdr 出力を ASCII テキストへエクスポートするのを容易にし、(2) R 初心者が使いやすくて、R オブジェクトのプリント出力に適切な形式へのエクスポートの際の参照のアクセスが容易であるように意図したものである。
//This package provides facilities to graphically export Rcmdr output to LaTeX or HTML code. Essentially, at the moment, the plug-in is a graphical front-end to xtable(). It is intended to (1) facilitate exporting Rcmdr output to formats other than ASCII text and (2) provide R novices with an easy to use, easy to access reference on exporting R objects to formats suited for printed output.
**COLOR(red){RcmdrPlugin.TeachingDemos}: Rcmdr 教育用デモプラグイン [#nbb849f4]
//Rcmdr Teaching Demos Plug-In
本パッケージは TeachingDemos パッケージをベースにした Rcmdr「プラグイン」を提供し、本パッケージは例を示して教えていくことを主たる目的としている。
//This package provides an Rcmdr "plug-in" based on the TeachingDemos package, and is primarily for illustrative purposes.
**COLOR(red){Rcplex}: CPLEX の R インターフェース [#fa2eae1a]
//R interface to CPLEX
線形、2次および（線形および2次）混合整数計画用CPLEX ソルバーの R インターフェース。CPLEX のインストールには Rcplex パッケージの利用が必要。詳細については、Linux/Unix-like での Rcplex パッケージをインストール方法を参照せよ。現状では Windows に対するサポートはない。
//R interface to CPLEX solvers for linear, quadratic, and (linear and quadratic) mixed integer programs. A working installation of CPLEX is required for usage of the Rcplex package. See the file "INSTALL" for details on how to install the Rcplex package in Linux/Unix-like systems. No support for Windows platforms is currently available.
**COLOR(red){RcppTemplate}: Rcpp R/C++ インターフェースライブラリー/パッケージテンプレート [#yc84672e]
// Rcpp R/C++ interface library and package template
R/C++ インターフェースクラスライブラリー/パッケージテンプレート。Rcpp ライブラリーは R and C++ 間でデータタイプをマッピングする。このマッピングは R の実数、整数、文字、ベクトル、マトリックス、データ、データフレームを含む。C++ からの R 関数の呼び出しをサポートする。詳細についてはパッケージのドキュメンテーションファイル doc/RcppAPI.pdf を参照のこと。このドキュメントは Windows 用のバイナリ R パッケージの構築については詳細を含んでいる。
//R/C++ interface class library and package template. The Rcpp library maps data types betweeen R and C++, and includes support for R types real, integer, character, vector, matrix, Date, data frame, and function. Supports calling R functions from C++. See the package documentation file doc/RcppAPI.pdf for more information, including details on building binary R packages for Windws.
**COLOR(red){RColorBrewer}: ColorBrewer パレット [#k0014c9c]
このパッケージは変数に応じて色が塗りつぶされるよい地図を描画するためのパレットを提供する。
[[RColorBrewer(ColorBrewerパレット)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){RCurl}: HTTP リクエストインターフェース [#tb0d261d]
//HTTP request interface
本パッケージで、URI の取得、フォームのポスト等及びウェブサーバの返す結果の処理をする HTTP リクエストを作成できる。このパッケージは、HTTP 接続及びリクエストのフォーム上でかなりの制御ができる。一方で、R ソケット接続の単なる利用で可能なもの以上の高水準のインターフェースを提供する。さらには、さらに、基礎となる実装は頑健で豊富であり、SSL/HTTPS、クッキー、リダイレクト、認証等をサポートしている。
//The package allows one to compose HTTP requests to fetch URIs, post forms, etc. and process the results returned by the Web server. This provides a great deal of control over the HTTP connection and the form of the request while providing a higher-level interface than is available just using R socket connections. Additionally, the underlying implementation is robust and extensive, supporting SSL/HTTPS, cookies, redirects, authentication, etc.
[[RCurl(HTTP リクエストインターフェース )パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){Rd2roxygen}: Rd を [[roxygen:http://roxygen.org/]] ドキュメンテーションに変換 [#qe05ef35]
//Convert Rd to roxygen documentation
Rd を [[roxygen:http://roxygen.org/]] ドキュメンテーションに変換する関数。本パッケージは Rd ファイルをパースしてリストを作成し、 roxygen ドキュメンテーションを作成、それによって、元の R スクリプト（例としては、関数の定義を含んでいるもの）を更新する。
//Functions to convert Rd to roxygen documentation. It can parse an Rd file to a list, create the roxygen documentation and update the original R script (e.g. the one containing the definition of the function) accordingly.
**COLOR(red){RDieHarder}: dieharder RNG テストスィート用 R インターフェース [#l79ed9a8]
//R interface to the dieharder RNG test suite
RDieHarder パッケージは R インターフェースを、Robert G. Brown によって, George Marsaglia 他による初期の研究を拡張して開発された乱数生成テストの dieharder スィートを提供する。
//The RDieHarder packages provides an R interface to the dieharder suite of random number generators and tests that was developed by Robert G. Brown, extending earlier work by George Marsaglia and others.
**COLOR(red){ReadImages}: R 用画像読み込みモジュール [#i66e1c45]
//Image Reading Module for R
本パッケージは JPEG・PNG 画像ファイル読み込み関数を提供する。本パッケージには libjpeg <http://www.ijg.org> が必要である。本パッケージは、Unixes / MacOS X / Windows 上で利用できる。
//This package provides functions for reading JPEG and PNG files. This package requires libjpeg <http://www.ijg.org>. This package can be used on Unixes / MacOS X / Windows.
**COLOR(red){realized}: Realized [#ce83bc2e]
//Realized
実現分散ツールキット
//Realized Variance Toolkit
**COLOR(red){regress}: 線形共分散構造つきのガウス線形モデル [#cebb892a]
//Gaussian linear models with linear covariance structure
共分散構造を既知のマトリックスの線形組み合わせとして書けるところで、残差の対数尤度の最大化でガウス線形モデルをあてはめる関数。多変量モデルおよびランダム効果モデル用に利用できる。ランダム相互作用を含むランダム効果モデルの指定方法が単純なために容易。
//Functions to fit Gaussian linear model by maximising the residual log likelihood where the covariance structure can be written as a linear combination of known matrices. Can be used for multivariate models and random effects models. Easy straight forward manner to specify random effects models, including random interactions.
**COLOR(red){relimp}: 回帰モデルにおける効果の相対的寄与 [#p8793077]
線形回帰又は一般化線形モデルにおける予測子の相対的重要性に関する推測を支援する関数
**COLOR(red){rEMM}: R 用データストリームクラスタリングのための拡張マルコフモデル(EMM) [#o47638ae]
//Extensible Markov Model (EMM) for Data Stream Clustering in R
拡張マルコフモデル(EMM)は、動的に適応するマルコフ連鎖を重ねることで、時間要素をデータストリームクラスタリングを追加する。本パッケージは、データストリームのための単純なクラスタリングアルゴリズムであるしきい値 NN の上に EMM を実装している。
//The Extensible Markov Model (EMM) adds a temporal component to data stream clustering by superimposing a dynamically adapting Markov Chain. This package implements EMM on top of threshold NN, a simple clustering algorithm for data streams.
**COLOR(red){reporttools}: Latex - 記述統計の結果を LaTeX 表として生成 [#r4891c77]
//Generate Latex - tables of descriptive statistics
本パッケージの関数は、Sweave をもちいたデータ分析のリポート作成時に特に役立つ。
//The functions in this package are especially helpful when writing reports of data analysis using Sweave.
**COLOR(red){REQS}: R/EQS インターフェース [#pea5231d]
//R/EQS Interface
本パッケージは EQS スクリプトファイルを呼び出す関数を含む。このスクリプトは、EQS 推定を実行し、最後には結果を R オブジェクトとしてインポートする。これらの２ステップは別々に実行できる。すなわり、call.eqs() は、EQS を呼び出し、実行する。ここで、read.eqs() は、既存の EQS 出力をオブジェクトとして R へインポートする。
//This package contains the function run.eqs() which calls an EQS script file, executes the EQS estimation, and, finally, imports the results as R objects. These two steps can be performed separately: call.eqs() calls and executes EQS, whereas read.eqs() imports existing EQS outputs as objects into R.
[[REQS(R/EQS インターフェース)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){RExcelInstaller}: R および Excel の統合 [#l01b2976]
//Integration of R and Excel
RExcel は MS Windows 上で MS Excel 用のアドインであり、R - Excel 間のデータ転送ができ、Excel 用のライブラリとして R を使った VBA マクロが書け、Excel でのワークシート関数として R 関数を呼び出せる。RExcel は、R Commander (Rcmdr)と見事に統合する。この R パッケージは、Excel のバージョン 2000 から 2007 までの Excel アドインをインストールする。本パッケージは MS Windows のみで動作する。
//RExcel, an add-in for MS Excel on MS Windows, allows to transfer data between R and Excel, writing VBA macros using R as a library for Excel, and calling R functions as worksheet function in Excel. RExcel integrates nicely with R Commander (Rcmdr). This R package installs the Excel add-in for Excel versions from 2000 to 2007. It only works on MS Windows.
**COLOR(red){RFinanceYJ}: Yahoo!ファイナンスからデータを取得する [#od65259f]
Yahoo!ファイナンスから株価・為替時系列データを取得する
**COLOR(red){RFreak}: R/FrEAK インターフェース [#vfdcdf60]
//R/FrEAK interface
フリーの進化アルゴリズムキット FrEAK の修正版の R インターフェース。FrEAK は、Java で書かれたツールキットで、進化アルゴリズムのデザインと分析をおこなえる。R インターフェースと拡張版の FrEAK が、RFreak に含まれる。FrEAK についての詳細情報は、http://sourceforge.net/projects/freak427/ を参照のこと。
An R interface to a modified version of the Free Evolutionary Algorithm Kit FrEAK. FrEAK is a toolkit written in Java to design and analyze evolutionary algorithms. Both the R interface and an extended version of FrEAK are contained in the RFreak package. For more information on FrEAK see http://sourceforge.net/projects/freak427/.
**COLOR(red){Rfwdmv}: 多変量データの前方検索 [#za18f297]
//Forward Search for Multivariate Data
前方検索を使った多変量データの探索
//Explore Multivariate Data with the Forward Search
**COLOR(red){rgcvpack}: GCVPACK フォートランパッケージの R インターフェース [#y5fa6a9f]
//R Interface for GCVPACK Fortran Package
薄板スプラインの当てはめと予測
//Thin plate spline fitting and prediction
**COLOR(red){rgdal}:地理空間データ抽象ライブラリ(Geospatial Data Abstraction Library(GDAL))のバインド [#s80abcf7]
FOSS4G(Free Open Source Software for GIS) の巨頭 Frank Warmerdam の地理空間データ抽象ライブラリ(Geospatial Data Abstraction Library (GDAL) (>= 1.3.1) ‐ このバージョンは新スタイルのクラスをもっている)のバインド。GDAL は外部ライブラリであるので、一番最初にちゃんとインストールされる必要がある。
[[rgdal(GDAL(Geospatial Data Abstraction Library, 地理空間データ抽象ライブラリ)のバインディング)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){rgeos}: GEOS：ジオメトリ（幾何図形）エンジンオープンソースインターフェース [#x54bf6ea]
//Interface to Geometry Engine - Open Source (GEOS)
ジオメトリ（幾何図形）のトポロジー操作のための C API を利用するGeometry Engine - Open Source (GEOS：ジオメトリ（幾何図形）エンジンオープンソース)インターフェース
//Interface to Geometry Engine - Open Source (GEOS) using the C API for topology operations on geometries.
[[rgeos (Geometry Engine - Open Source (GEOS：ジオメトリ（幾何図形）エンジンオープンソース)インターフェース)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){rggobi}: R と GGobi とのインターフェース [#w63a81e3]
//Interface between R and GGobi
rggobi は対話型ダイナミックグラフィックスパッケージ GGobi へのコマンドラインインターフェースを提供する。Rggobi は GGobi のグラフィカルユーザインターフェースを補い、分析と探索との間の転換方法を提供するとともに、共通のタスクを自動化する。
//The rggobi package provides a command-line interface to GGobi, an interactive and dynamic graphics package. Rggobi complements GGobi's graphical user interface, providing a way to fluidly transition between analysis and exploration, as well as automating common tasks.
**COLOR(red){Rglpk}: R/GNU 線形計画キットインターフェース [#l269b268]
//R/GNU Linear Programming Kit Interface
GNU 線形計画キット (GLPK version 4.33)用 R インターフェース。GLPK は大規模な線形計画(LP)、混合整数線形計画(MILP)および他の関連する問題を解くオープンソースソフトウェアである。
//R interface to the GNU Linear Programing Kit (GLPK version 4.28). GLPK is open source software for solving large-scale linear programming (LP), mixed integer linear programming (MILP) and other related problems.
[[Rglpk(R/GNU 線形計画キットインターフェース)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){RgoogleMaps}: R で、グーグルマップ上に重ね合わせ [#yb133f67]
//Overlays on Google map tiles in R
本パッケージは以下の２つの目的にかなうものである。(i) グーグルのサーバに静的な地図を問い合わす安定した R 用インターフェースを提供し、(ii) 地図を背景画像として用いて、R 内での作図を重ね合わせる。これには座標のスケーリングを適切にする必要がある。
//This package serves two purposes: (i) Provide a comfortable R interface to query the Google server for static maps, and (ii) Use the map as a background image to overlay plots within R. This requires proper coordinate scaling.
[[RgoogleMaps(R で、グーグルマップ上に重ね合わせ)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){rgr}: GSC (Geological Survey of Canada:カナダ地質調査所)応用地球化学 EDA パッケージ [#e7a8c531]
//The GSC (Geological Survey of Canada) Applied Geochemistry EDA Pa
応用科学データを処理する探索的データ分析用 R 関数
//R functions for Exploratory Data Analysis with applied geochemical data
**COLOR(red){rgrs}: 社会科学での R の利用を容易にする関数（フランス語） [#y8eca986]
//Functions to make R usage in social sciences easier (in french)
本パッケージは初心者および社会科学の学生又は研究者のための関数を提供する。目下のところ、このパッケージは、クロス表、重み付け、結果のレポート及び地図作図用関数を提供している。ドキュメンテーションとヘルプページはフランス語で書かれている。
//This package provides functions for beginners and social sciences students or researchers. Currently it includes functions for cross-tabulation, weighting, results export, and maps plotting. The documentation and help pages are written in french.
**COLOR(red){RHmm}: 隠れマルコフシミュレーションおよび推定 [#xe0689ac]
//Hidden Markov Models simulations and estimations
シミュレーションおよび推定のための離散、単変量または多変量ガウシアン、単変量ガウシアン混合 HMM 関数
//Discrete, univariate or multivariate gaussian, mixture of univariate gaussian HMM functions for simulation and estimation.
[[RHmm(隠れマルコフシミュレーションおよび推定)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){rimage}: R 用画像処理モジュール [#y1d193d1]
[[rimage (R用画像処理モジュール)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){rindex}: R 用インデックス作成 [#d96a92eb]
//Indexing for R
インデックス構造は大きなコレクションより要素を高速にアクセスできる。B 木はディスクデータベースアクセスに、Ｔ 木は RAM データベースに最適化する一方、R にまったく最適なハイブリッドの静的インデックス作成を使う。
//Index structures allow quickly accessing elements from large collections. While btree are optimized for disk databases and ttree for ram databases we use hybrid static indexing which is quite optimal for R.
**COLOR(red){RJaCGH}: CGH 配列解析のための Reversible Jump MCMC。[#td1f9e0f]
//Reversible Jump MCMC for the analysis of CGH arrays.
隠れマルコフ連鎖モデルのあてはめのベイズ分析。状態数の選択は Reversible Jump マルコフ連鎖モンテカルロ法により計算された事後確率経由によるもの。
//Bayesian analysis of CGH microarrays fitting Hidden Markov Chain models. The selection of the number of states is made via their posterior probability computed by Reversible Jump Markov Chain Monte Carlo Methods.
**COLOR(red){rJava}: R 用低水準 Java インターフェース [#v062af45]
.C/.Call and friends に非常によく似た Java VM 低水準インターフェース。オブジェクトの作成、メソッドの呼び出し、フィールドのアクセスができる。
**COLOR(red){RJDBC}: JDBC インターフェース経由でデータベースアクセスを提供 [#hab278e3]
//Provides access to databases through the JDBC interface
RJDBC はバックエンドとしての JDBC を利用して R の DBI インターフェースを実装。これで、R は JDBC ドライバーのあるどんな DBMS にも接続できる。
//RJDBC is an implementation of R's DBI interface using JDBC as a back-end. This allows R to connect to any DBMS that has a JDBC driver.
**COLOR(red){rjson}: R 用 JSON [#x7948a69]
//JSON for R
R オブジェクトを JSON オブジェクトとの相互交換
//Converts R object into JSON objects and vice-versa
[[rjson( R 用 JSON)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){RJSONIO}: R オブジェクトを JSON(JavaScript オブジェクト記法) にシリアライズ [#t14866e9]
//Serialize R objects to JSON, JavaScript Object Notation
本パッケージは、Javascript オブジェクト(JSON)記法でのデータの入出力変換ができる。これによって、R オブジェクトを Javascript/ECMAScript/ActionScript コードに挿入でき、R プログラマーが JSON を読み込んで、R オブジェクトへ変換できる。このパッケージは rjson パッケージに取って代わるものである。このバージョンは大きな R オブジェクトを JSON に変換するのがあまりに遅くて、拡張ができないが、非常に有用なプロトタイプである。パースは高速である。本パッケージは、JSON のデシリアライズのために、メソッド、ベクトル化操作および C コード及び R 関数へのコールバックを使用している。本パッケージのバージョン 0.4 は新しいネィティブパーサーを使用し、C の変換可能なコードを実装し、メモリーを効率的に配置している（イベントドリブンパーシングのために連結するというよりはむしろ）。この結果、大きなサイズの JSON ドキュメントのパースがかなり高速なものとなった。
//This is a package that allows conversion to and from data in Javascript object notation (JSON) format. This allows R objects to be inserted into Javascript/ECMAScript/ActionScript code and allows R programmers to read and convert JSON content to R objects. This is an alternative to rjson package. That version is too slow for converting large R objects to JSON and is not extensible, but a very useful prototype. It is fast for parsing. This package uses methods, vectorized operations and C code and callbacks to R functions for deserializing JSON objects to R. Verison 0.4 of this package uses a new native parser, implements the transformation code in C and allocates memory efficiently (rather than concatenating because of event driven parsing). The result is a significantly faster parsing of large JSON documents.
[[RJSONIO(R オブジェクトを JSON(JavaScript? オブジェクト記法) にシリアライズ)パッケージ中のオブジェクト一覧 ]]
**COLOR(red){RKEA}: R/KEA インターフェース [#k1f462b7]
//R/KEA interface
KEA (バージョン 5.0)向け R インターフェース。KEA（キーフレーズ抽出アルゴリズム）はテキスト文書よりキーフレーズの抽出がおこなえる。本パッケージはフリーインデックス又は管理された語彙を用いた索引付けに利用される。詳細については、http://www.nzdl.org/Kea/ を参照のこと。
//An R interface to KEA (Version 5.0). KEA (for Keyphrase Extraction Algorithm) allows for extracting keyphrases from text documents. It can be either used for free indexing or for indexing with a controlled vocabulary. For more information see http://www.nzdl.org/Kea/.
**COLOR(red){Rlab}: ST370 クラスに必要な関数及びデータセット [#i3db31bb]
//Functions and Datasets Required for ST370 class
ST370 クラスに必要な関数及びデータセット
//Functions and Datasets Required for ST370 class
**COLOR(red){Rlabkey}: Labkey データベースよりデータ検索 [#ife26ffc]
//Data retrieval from a Labkey database
本パッケージは、labkey データベースよりデータをインポートして、R データフレームに代入する
//This package imports data from a labkey database into an R data frame
**COLOR(red){rmeta}: メタアナリシス [#rd6fe203]
２つのサンプルを比較するための簡単な固定およびランダム効果メタアナリシスおよび累積的なメタアナリシス用関数。標準要約プロットと Funnel 図の表示およびオッズ比の計算と連関と異質性の検定。
**COLOR(red){RmSQL}: mSQL データベースへの R インターフェース [#j745d832]
R <-> mSQL データベース・インターフェース
**COLOR(red){RMySQL}: MySQLデータベースへの R インターフェース [#e0928906]
**COLOR(red){RNetCDF}: NetCDF データベース R インターフェース [#u5e1202b]
このパッケージは Unidat の NetCDF ライブラリ関数（バージョン３）へのインターフェースを提供し、さらに Unidata の units カレンダー変換のアクセスも提供する。ルーチンとドキュメントは NetCDF および udunits C インターフェースにしたがっている。このため、より詳細については、こららに対応するマニュアルで調べることができる。
[[RNetCDF(NetCDF データベース R インターフェース)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){Rniftilib}: Rniftilib 0.0-27 [#m5d3b39e]
//Rniftilib 0.0-27
nifticlib (nifticlib-1.1.0) 用 R インターフェース(ANALYZE(TM)7.5/NIfTI-1 ボリューム画像の読み書き)
//R interface to nifticlib (nifticlib-1.1.0) (read/write ANALYZE(TM)7.5/NIfTI-1 volume images)
**COLOR(red){RobAStBase}: ロバスト漸近的統計 [#l68d52c1]
//Robust Asymptotic Statistics
ロバスト漸近的統計のためのベースの S4 クラスおよび関数
//Base S4-classes and functions for robust asymptotic statistics.
**COLOR(red){robfilter}: ロバスト時系列フィルタ [#gaa12b6a]
//Robust Time Series Filters
ロバスト統計からの概念に基づいた時系列フィルタリング関数セット
//A set of functions to filter time series based on concepts from robust statistics.
**COLOR(red){RODBC}: ODBC データベース・アクセス [#gb11182b]
ODBC データベース・インターフェース
[[RODBC(ODBCデータベース・アクセス)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){ROptEst}: 最適ロバスト推定 [#aff7a765]
//Optimally robust estimation
S4 クラスおよびメソッドをもちいた最適ロバスト推定
//Optimally robust estimation using S4 classes and methods
**COLOR(red){ROracle}: R用オラクル・データベース・インターフェース [#f136eac3]
**COLOR(red){roxygen}: R の洗練されたプログラミング [#yafb8842]
//Literate Programming in R
Rd, 照合, 名前空間および 関数の呼出関係(callgraph)のための Doxygen ライクな文書システム。
//A Doxygen-like in-source documentation system for Rd, collation, namespace and callgraphs.
**COLOR(red){rpart}: 再帰的分割 [#q48f6914]
再帰的分割と回帰ツリー
[[rpart(再帰的分割(Recursive Partitioning))パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){RpgSQL}: PostgreSQL データベース用 DBI/RJDBC インターフェース [#hd285ab3]
//DBI/RJDBC interface to PostgreSQL Database
RJDBC 経由の PostgreSQL データベース用 DBI インターフェース
//DBI interface to PostgreSQL database via RJDBC
**COLOR(red){rPorta}:R/PORTA インターフェース [#w6126bd2]
PORTA 修正版用 R インターフェース
//An R interface to a modified version of POR
**COLOR(red){rpvm}: PVM (並列仮想計算機)への R インタフェイス [#ne95fa97]
PVM の API への R インタフェイス, 使用法の例と解説を含む。
**COLOR(red){RPostgreSQL}: PostgreSQL データベースシステムの R インターフェース [#s507ee6e]
//R interface to the PostgreSQL database system
R 用データベースインターフェースおよびd PostgreSQLドライバー。本バージョンはデータベースインターフェースの定義を DBI パッケージで実装してまとめられた。
//Database interface and PostgreSQL driver for R. This version complies with the database interface definition as implemented in the package DBI.
**COLOR(red){RPyGeo}: Python 経由による、R での ArcGIS のジオプロセッシング [#i36e83e1]
//ArcGIS Geoprocessing in R via Python
Python のコードを作成せずに、または、ArcGIS に触れることなしに、Python のジオプロセッシングスクリプトを実行することで、R 内より、（仮想的にいかなる）ArcGIS ジオプロセッシングツールへのアクセスを提供する。ArcGIS バージョン 9.2 以上、Python の適切なバージョン（現行の 2.4）およびウィンドーズ
//Provide access to (virtually any) ArcGIS Geoprocessing tool from within R by running Python geoprocessing scripts without writing Python code or touching ArcGIS. Requires ArcGIS >=9.2, a suitable version of Python (currently 2.4), and Windows.
[[RPyGeo(Python 経由による、R での ArcGIS のジオプロセッシング)パッケージ中のオブジェクト中の一覧]]
**COLOR(red){R.rsp}: R サーバページ [#x057ca1d]
//R Server Pages
R サーバページ (RSP) は形式 (HTML, TeX, ...) を選択するテキスト及び特別なタグの中にある R のソースコード文書である。RSP ファイルはいわゆる R サーブレットに変換できる。この R サーブレットはソース作成時の最後にドキュメントを出力する R スクリプトである。このように、いかなる形式でのドキュメントも、R を用いて動的に生成可能である。例えば、自動統計分析レポート作成がある。内部クロスプラットフォームを使って、本パッケージは 動的なヘルプページを HTML で提供する。他のパッケージが、RSP ヘルプページを提供するならば、RSP のメインメニューでこれらのページを自動的にリンク付けできる。
//An R Server Page (RSP) is a document that contains both text in a format of choice (HTML, TeX, ...) as well as R source code within special tags. An RSP file can be translated into a so called R servlet, which is an R script that outputs the final document when sourced. This way documents in any format can be generated dynamically using R, e.g. automatic reports of statistical analysis. Utilizing an internal cross-platform web server, this package provides dynamic help pages in HTML. If other packages provide RSP help pages, these are automatically linked to in the RSP main menu.
[[R.rsp(R サーバページ)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){RQuantLib}: QuantLib ライブラリのR インタフェイス [#k26d6d80]
RQuantLib パッケージはRから（幾つかの）QuantLib 関数を呼び出すことを可能にする。
現在のところ、幾つかのオプション価格付けと解析関数に限定されている。QuanLib プロジェクトは定量的ファイナンスに対する網羅的なソフトウエアの体系を提供することを目指している。目標は、定量的解析、モデル開発、取り引き、そしてファイナンス価格のリスク管理に対する、標準的なフリー／オープンなソースライブラリーを提供することである。RQuantLib を使うには QuantLib をインストールする必要がある。
**COLOR(red){RSAGA}: R での SAGA ジオプロセッシングおよび地形解析 [#ye6bbc0a]
//SAGA Geoprocessing and Terrain Analysis in R
RSAGA は R 内より、SAGA のジオコンピューティングおよび地形解析機能のアクセスを、コマンドライン版の SAGA を実行することで提供する。さらに、ASCII グリッドの処理および操作をするいくつかの R の関数が提供されており、これらにはグリッドに対する局所および focal 関数を適用する柔軟なフレームワークが含まれる。SAGA は GPL の下に http://www.saga-gis.org/ より入手できる。
//RSAGA provides access to geocomputing and terrain analysis functions of SAGA from within R by running the command line version of SAGA. In addition, several R functions for handling and manipulating ASCII grids are provided, including a flexible framework for applying local or focal functions to grids. SAGA is available under GPL via http://www.saga-gis.org/.
[[RSAGA(R での SAGA ジオプロセッシングおよび地形解析)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){Rserve}: バイナリ R サーバ [#q25f438c]
//Binary R server
Rserve はソケットサーバ (TCP/IP またはローカルソケット)の役割をして、バイナリのリクエストを R に送ることができるようにする。コネクションは分離されたワークスペースおよび作業ディレクトリである。クライアント側の実装は C/C++ および Java のようなポピュラーな言語で、R のコードへのリンクなしに R のファシリティを利用するアプリが可能になる。Rserve はリモート接続、ユーザ認証およびファイル転送をサポートする。
//Rserve acts as a socket server (TCP/IP or local sockets) which allows binary requests to be sent to R. Every connection has a separate workspace and working directory. Client-side implementations are available for popular languages such as C/C++ and Java, allowing any application to use facilities of R without the need of linking to R code. Rserve supports remote connection, user authentication and file transfer.
**COLOR(red){Rsge}: SGE 待ち行列システムインターフェース [#nb2ca9be]
//Interface to the SGE Queuing System
本パッケージは SGE 待ち行列クラスター・グリッドシステムで R を利用する関数を提供する。
//This package provides functions for using R with the SGE cluster/grid queuing system.
**COLOR(red){RSurvey}: 空間的に分布したデータの分析 [#ub860991]
//Analysis of Spatially Distributed Data
本パッケージは空間的に分布したデータの処理プログラムである。このプログラムでエラー修正及びデータの可視化ができる。ＧＵＩあり。
//This package is a processing program for spatially distributed data. The program is capable of error corrections and data visualization. A graphical user interface is provided.
[[RSurvey(空間的に分布したデータの分析 ）パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){Rsymphony}: R で Symphony [#ddeb6a46]
//Symphony in R
SYMPHONY MILP ソルバー (バージョン 5.1.7)用 R インターフェース
//An R interface to the SYMPHONY MILP solver (version 5.1.7).
**COLOR(red){rtiff}: R 用 tiff リーダ [#h7a8fd0a]
//A tiff reader for R.
このパッケージは TIFF 形式画像を読み込め（かつバージョン１，１では書き込め）、これらを pixmap オブジェクトして返す。結果としてできるオブジェクトは、手ごろなサイズのTIFF 画像でさえ非常に大きなため、パフォーマンス改良のために画像は減らされている。このパッケージは libtiff (www.libtiff.org) のラッパーで、このライブラリに依存している（たとえば、libtiff シェアドライブラリは 作業用バイナリについてはPATH 上にある必要があり、ソース構築のためには tiffio.h はシステム上にある必要がある）。libtiff の高水準 TIFFReadRGBAImage 関数を使うことで、このパッケージは幅広い 画像形式と圧縮スキームを元々サポートしている。このパッケージはまたバイナリのマスクを容易に作成できるRidler Autothresholding のアルゴリズムの実装も提供する。
//This package will read (and, as of version 1.1, write) TIFF format images and return them as a pixmap object. Because the resulting object can be very large for even modestly sized TIFF images, images can be reduced as they are read for improved performance. This package is a wrapper around libtiff (www.libtiff.org), on which it depends (i.e. the libtiff shared library must be on your PATH for the binary to work, and tiffio.h must be on your system to build the package from source). By using libtiff's highlevel TIFFReadRGBAImage function, this package inherently support a wide range of image formats and compression schemes. This package also provides an implementation of the Ridler Autothresholding algorithm for easy generation of binary masks.
**COLOR(red){rsprng}: SPRNG (Scalable Parallel Random Number Generators)のRインターフェース [#a0132444]
SPRNG APIs へのインタフェイス、その使い方の例とドキュメント
**COLOR(red){RSQLite}: R用SQLite インターフェース [#web97fa9]
SQLite 用 データベースインターフェース R ドライバー。本パッケージは SQLite データベースを組み込み、 DBI パッケージ準拠のインターフェースを提供する。 SQLite エンジン (バージョン 3.6.23.1)が同梱されている。
//Database Interface R driver for SQLite. This package embeds the SQLite database engine in R and provides an interface compliant with the DBI package. The source for the SQLite engine (version 3.6.23.1) is included.
**COLOR(red){RSvgDevice}: R SVG グラフィックス・デバイス。[#c40f73dc]
w3.org の新 xml 標準である Scalable Vector Graphics を利用する R 用 SVG グラフィックス・デバイス。
**COLOR(red){RUnit}: R ユニットテストフレームワーク [#x7fa02d8]
標準的なユニットテスティングフレームワークを実装した R 関数。追加コード検査とリポート生成ツール付き。
[[RUnit(R ユニットテストフレームワーク)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){Runuran}: UNU.RAN ランダムな変量生成用 R インターフェース [#eadd54d1]
//R interface to the UNU.RAN random variate generators
汎用の非均一ランダムな変量生成用 UNU.RAN ライブラリインターフェース
//Interface to the UNU.RAN library for Universal Non-Uniform RANdom variate generators
**COLOR(red){Rvelslant}: R の坑内地震分析 [#he799142]
//Downhole Seismic Analysis in R
R の坑内地震を対話的に分析し、境界層を越えて来る反射を説明する定常速度(constant velocity layer)の層化速度モデル(layered velocity model)を解釈する R スクリプト
//R scripts for interactively analyzing downhole seismic data and interpreting layered velocity models of constant velocity layers accounting for refractions across layer boundaries.
**COLOR(red){Rwave}: 一次元信号の時間・周波数領域解析 [#z76cc2a3]
**COLOR(red){RWeka}: R/Weka インターフェース [#ya4fa5f2]
//R/Weka interface
Weka (バージョン 3.5.7)用 R インターフェース。Weka は Java で書かれたデータマイニング用機械学習アルゴリズムコレクション。データの前処理、分類、クラスタリング、関連ルールおよび可視化。R インターフェースおよび weka 本体が RWeka パッケージに含まれる。Weka に関するさらなる情報は http://www.cs.waikato.ac.nz/~ml/weka/ を参照のこと。
//An R interface to Weka (Version 3.5.7). Weka is a collection of machine learning algorithms for data mining tasks written in Java, containing tools for data pre-processing, classification, regression, clustering, association rules, and visualization. Both the R interface and Weka itself are contained in the RWeka package. For more information on Weka see http://www.cs.waikato.ac.nz/~ml/weka/.
[[RWeka(R/Weka インターフェース)パッケージ中のオブジェクト一覧]]
**COLOR(red){RWekajars}: R/Weka インターフェース jar [#qf2bf7f1]
//R/Weka interface jars
RWeka パッケージに必要な外部 jar
//External jars required for package RWeka.
**COLOR(red){rwm}: R ワークスペースマネジャー [#i17c649b]
//R Workspace Manager
R ワークスペース管理のための APL ライク関数
//APL-like functions for managing R workspaces.
**COLOR(red){rworldmap}: 世界のデータのマッピング : rworldmap [#u49048e8]
//For mapping global data : rworldmap
国レベルおよびグリッド化されたユーザデータセットの地図化を可能にする。
//Enables mapping of country level and gridded user datasets.
**COLOR(red){Ryacas}: yacas コンピュータ代数システムのR インターフェース [#a46d28c5]
//R interface to the yacas computer algebra system
yacas コンピュータ代数システムのインターフェース
//An interface to the yacas computer algebra system.
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