* CRANについて [#be21a04c] CRAN (Comprehensive R Archive Network)は、R本体や各種パッケージをダウンロードするためのWebサイトで、 全世界にミラーサイト((同じコンテンツをコピーして提供するサイトをミラーと呼ぶ。))が存在する。 日本にも、統計数理研究所ミラー( http://cran.ism.ac.jp/ )、 会津大学ミラー ( ftp://ftp.u-aizu.ac.jp/pub/lang/R/CRAN )、東京大学ミラー(http://ftp.ecc.u-tokyo.ac.jp/CRAN/ )、兵庫教育大学ミラー(http://essrc.hyogo-u.ac.jp/cran/ )が存在する。 適切なミラーを選べば利用者の側には高速で快適なダウンロードが、サーバ管理者の側には負荷の軽減が期待できる。 * ミラーの使い方 [#u6d5254e] CRANはWebブラウザを用いてR自体をダウンロードするためにも使われるが、より便利な使い方として、 Rから直接パッケージを自動インストール、自動アップデートするためにも使うことができる(install.packages(), update.packages() )。 しかし、以下のような設定をしないと、これらの関数ではCRANの本家サイト( http://cran.r-project.org )が使われてしまう。 ** 初期設定であらかじめ設定しておく場合 [#v47a9e15] install.packages()等でCRAN国内ミラーを使うためには、options()をあらかじめ使っておくのが簡単だろう。 options(repos="http://cran.md.tsukuba.ac.jp") この指定以後はCRANからのファイルのダウンロードには指定されたミラーサイトが使われるようになる。 しかし、options()の指定は通常、Rを終了すると保存されず、毎起動時に指定しなおす必要がある。 これは面倒なので、Rの初期化ファイル(.Rprofile)にoptionsの指定を書いてしまうのがよい。 LinuxやMacOS Xではホームディレクトリ、WindowsではRをインストールした先のディレクトリ(C:¥Program Files¥R¥rw1090 など)に 下記のような内容の.Rprofileという名前のファイルを置けば、毎起動時にこの内容が読み込まれてCRANオプションが適切に設定される。 options(repos="http://cran.md.tsukuba.ac.jp") Windows環境ではドットで始まるファイルが作成し辛いらしいが、 いったんドット抜きのRprofileという名前のファイルを作って書き込み、それをエクスプローラでリネームするのがよいらしい(未確認)。 もし、Webへのアクセスにプロキシを利用しなければならない場所では、この.Rprofileに以下のような内容を追記すればよい(The R Book p.50より)。 Sys.putenv("http_proxy"="http://proxyhost:3128/") -Windows環境で「.Rprofile」という名前のファイルを作るときは、「メモ帳」でファイルの名前を""で囲んだ「".Rprofile"」、ファイルの種類を「すべてのファイル」にすればよい。 -- [[hashi]] &new{2006-07-08 (土) 14:59:24}; -Windows環境のノートPCなどでインターネット環境(プロキシ)が異なる職場・自宅・外出先を持ち歩く場合は、Rのショートカットのプロパティを開き、リンク先の「"...Rgui.exe"」の末尾に「 --internet2」を追記して、「"...Rgui.exe" --internet2」とすれば、コントロールパネルのインターネットオプションで設定したプロキシ設定が自動的に使われる(The R Book p.50より)。 -- &new{2006-07-08 (土) 15:14:56}; -Winows では,ドットで始まるファイルが作成しづらい?~ R コンソールから, cat("options(repos=\"http://cran.md.tsukuba.ac.jp\")\n", file="foo/bar/.baz") などではいかが? -- &new{2006-07-10 (月) 19:08:44}; - R2.12.2にて.Sys.putenvは廃止予定と警告が出る模様.動かない事例があればSys.setenvを使用のこと. -- &new{2011-04-27 (水) 02:54:10}; #comment ** 逐次設定する [#ld036c99] いつも使っているミラーでエラーが出るとき、一時的にダウンロード先のミラーサイトを変更したいときがあるだろう。そのような場合は、reposオプションでミラーサイトを指定する。例えば、Task Viewで"Spatial"のパッケージセットをインストールする際に、東京大学のミラーサイトを指定するには下記のようにする。 > library(ctv) > install.views("Spatial", repos="ftp://ftp.ecc.u-tokyo.ac.jp/CRAN/") - 選択リストからミラーサイトを選ぶコマンド例: -- [[kkd]] &new{2012-11-03 (土) 20:29:39}; > chooseCRANmirror(graphics=FALSE) #comment