xlsxパッケージによりExcel2007ファイル(xlsxファイル)の読み書きが可能です。
xlsxファイルはxmlをzip圧縮したものらしい。
read.xlsx                 package:xlsx                 R Documentation
Read the contents of a worksheet into an R data.frame
Description:
     Read the contents of a worksheet into an R 'data.frame'.
Usage:
     read.xlsx(file, sheetIndex, sheetName=NULL, rowIndex=NULL,
       colIndex=NULL, as.data.frame=TRUE, header=TRUE, colClasses=NA,
       keepFormulas=FALSE, encoding="unknown", ...)
write.xlsx                package:xlsx                 R Documentation
Write a data.frame to an Excel workbook.
Description:
     Write a 'data.frame' to an Excel workbook.
Usage:
     write.xlsx(x, file, sheetName="Sheet1", 
       col.names=TRUE, row.names=TRUE, append=FALSE)